Innovating Works

BFU2017-86970-P

Financiado
REDES POST-TRANSCRIPCIONALES Y REGULACION GENICA
LA PROTEINAS DE UNION A RNA (SIGLAS EN INGLES RBPS, RNA-BINDING PROTEINS) SON CLAVES PARA EL CONTROL DE SPLICING, EXPORTACION, ESTABILIDAD, LOCALIZACION Y TRADUCCION DE TRANSCRITOS: I) LOS COMPLEJOS DE RBPS SE UNEN A LAS REGIONES... LA PROTEINAS DE UNION A RNA (SIGLAS EN INGLES RBPS, RNA-BINDING PROTEINS) SON CLAVES PARA EL CONTROL DE SPLICING, EXPORTACION, ESTABILIDAD, LOCALIZACION Y TRADUCCION DE TRANSCRITOS: I) LOS COMPLEJOS DE RBPS SE UNEN A LAS REGIONES REGULADORAS COMO INTRONES Y REGIONES NO TRADUCIDAS 5’ Y 3’ (SIGLAS EN INGLES UTR, UNTRANSLATED REGIONS), QUE A SU VEZ SE COMPORTAN COMO UNA PLATAFORMA DONDE SE MEDIAN ESTAS UNIONS Y SE ORQUESTRA LA REGULACION POST-TRANSCRIPCIONAL; II)HAY COMPLEJOS DE RNA QUE TAMBIEN SE UNEN A ELEMENTOS ESPECIFICOS DEL TRANSCRIPTOMA COMO LAS EXPANSIONES DE MICROSATELITES, ASI COMO LOS RNAS NO CODIFICANTES; III)LAS RBPS Y LOS RNAS A MENUDO SE UNEN EN ENSAMBLADOS O GOTAS EN QUE LOS TRANSCRITOS SE ENCUENTRAN CONFINADOS Y DONDE SE SUCEDEN REACCIONES ENCIMATICAS, AUNQUE PARA ALGUNOS DE LOS COMPLEJOS RBPS-RNA NO SE CONOCEN BIEN SU NI COMPOSICION NI SU FUNCION, HAY EVIDENCIAS DE QUE LOS ENSAMBLADOS RIBONUCLEOPROTEICOS SON UNA CLASE HETEROGENEA Y EXTENDIDA DE GOTAS QUE CRECEN, COLAPSAN Y FINALMENTE SE FUSIONAN EN EL NUCLEO Y EN EL CITOPLASMA, SIENDO UTIL PARA UN SEGUIDO DE PROPOSITOS, INCLUYENDO EL ALMACENAMIENTO DE RNA EN CELULAS GERMINALES Y EL TRANSPORTE DE RNA A TRAVES DE LAS NEURONAS, A DIFERENCIA DE LOS AGREGADOS AMILOIDOGENICOS, LAS GOTAS TIENEN UN CONTENIDO DESTACABLE EN RNA, LO CUAL FAVORECE SU RAPIDA DISOLUCION, Y SON LOS CAMBIOS EN LA COMPOSICION PROTEICA O DEL RNA LOS QUE PUEDEN INDUCIR LA FORMACION DE DEPOSITOS SOLIDOS,NOS PROPONEMOS DESCUBRIR RBPS QUE ESTEN IMPLICADAS EN LA REGULACION DE RNAS CUYA EXPRESIO ABERRANTE ESTA ASOCIADA A PATOLOGIA, EMPEZANDO CON LA HIPOTESIS ORIGINAL DE QUE LOS TRANSCRITOS CON UN ELEVADO NUMERO DE INTERACCIONES CON PROTEINAS PUEDEN ACTUAR COMO PLATAFORMAS PARA LA FORMACION DE COMPLEJOS MACROMOLECULARES, MI EQUIPO INVESTIGARA SI LOS RNAS ESPECIFICOS FAVORECEN LA FORMACION DE GOTAS, PRETENDEMOS DESCUBRIR INTERACCIONES FISICAS DE PROTEINAS Y RNAS QUE ENSAMBLAN EN GRANULOS, Y PROPONGO ESTUDIAR SUS ASOCIACIONES CON LA FUNCION Y LA DISFUNCION CELLULAR, LO CUAL VA A SER IMPORTANTE PARA ENTENDER LAS VIAS INVOLUCRADAS EN LA HOMEOSTASIS CELULAR, EN PARTICULAR, INVESTIGAREMOS SI LAS GOTAS SE PUEDEN UTILIZAR PARA PROTEGER LA CELULA CONTRA ESTIMULOS ADVERSOS QUE LLEVAN A PROCESOS DE NEURODEGENERACION,LOS OBJETIVOS DE MI PROYECTO SE PUEDEN CONSEGUIR CON UNA COMBINACION DE ESTUDIOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES, PREDECIREMOS MILLONES DE INTERACCIONES Y LAS VALIDAREMOS CON PRUEBAS EXPERIMENTALES A GRAN ESCALA, PARA UN NUMERO SELECCIONADO DE PAREJAS RBP-RNA, PROFUNDIZAREMOS CON EXPERIMENTOS FUNCIONALES, UTILIZAREMOS NUEVOS METODOS COMPUTACIONALES DESARROLLADOS EN MI LABORATORIO CON EL FIN DE PREDECIR LAS INTERACCIONES RBP-RNA Y LA FORMACION DE GRANULOS, COMPLEMENTAREMOS LOS CALCULOS CON ENSAYOS DE ULTIMA GENERACION, TECNICAS CONOCIDAS COMO MICRO-ARRAYS DE PROTEINA, CROSSLINKING AND IMMUNOPRECIPITATION (CLIP), FLUORESCENT IN SITU HYBRIDIZATION (FISH) Y FLUORESCENCE RECOVERY AFTER PHOTOBLEACHING (FRAP),EN CONCLUSION, ESTE PROYECTO DESVELARA ARQUITECTURAS RIBONUCLEOPROTEICAS IMPLICADAS EN MECANISMOS DE REGULACION POST-TRANSCRIPCIONAL, EL DESCUBRIMIENTO DE REDES DE INTERACCION DE RBPS CON CAPACIDAD PARA REGULAR RNAS VA A SUPONER UN MARCO IMPORTANTE PARA ENTENDER LOS DETERMINANTES MOLECULARES DE ENFERMEDADES HUMANAS COMO LA ENFERMEDAD DE PARKINSON, EL SINDROME DE TEMBLOR Y ATAXIA ASOCIADO AL CROMOSOMA X FRAGIL, Y LA ENFERMEDAD POR INCLUSIONES HIALINAS INTRANUCLEARES NEURONALES, INTERACCIONES PROTEÍNAS-RNA\REGULACIÓN POST-TRANSCRIPCIONAL\GOTAS RIBONUCLEOPROTEICAS ver más
01/01/2017
FUNDACIO PRIVADA C...
235K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 235K€
Líder del proyecto
FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion
Perfil tecnológico TRL 4-5 50K