Descripción del proyecto
EL PROYECTO PROPUESTO TIENE POR OBJETIVO EL ESTUDIO DEL ENLACE QUÍMICO Y LA REACTIVIDAD EN SISTEMAS (BIO)QUÍMICOS QUE SON IMPORTANTES PARA LOS CAMPOS DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR Y LA BIOMEDICINA, BASÁNDOSE EN LA QUÍMICA CUÁNTICA Y LAS SIMULACIONES MOLECULARES, ES ESPECIALMENTE RELEVANTE LA INTERACCIÓN DE LAS ESPECIES ACTIVAS DE ESTOS SISTEMAS CON SU ENTORNO QUÍMICO, QUE ESTÁ FORMADO POR EJEMPLO POR EL DISOLVENTE, EL ENTORNO DE PROTEÍNA Y/O LA PRESENCIA DE ÁTOMOS DE METAL (DE TRANSICIÓN), EL PROYECTO COMPRENDE TRES LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN QUE ESTÁN ESTRECHAMENTE RELACIONADAS Y COMPLEMENTARIAS: (A) MÉTODO DE DESARROLLO DE TÉCNICAS DE LA QUÍMICA CUÁNTICA Y SIMULACIONES MOLECULARES, ASÍ COMO SU VALIDACIÓN, (B) MECANISMOS DE REACCIÓN DE QUÍMICA (IN)ORGÁNICA Y CATALIZADA POR ENZIMAS, (C) ENLACE QUÍMICO, ESTRUCTURA Y CARACTERIZACIÓN ESPECTROSCÓPICA (NMR, UV-VIS, EPR, MÖSSBAUER) DE LOS SISTEMAS INORGÁNICOS Y BIOQUÍMICOS, LA QUÍMICA CUÁNTICA SE BASA EN LOS CÁLCULOS DE ALTO NIVEL AB INITIO Y LA TEORÍA DEL FUNCIONAL DE LA DENSIDAD (DFT), QUE PERMITEN MODELOS MO CON RELEVANCIA FÍSICA PARA ESTUDIAR EL ENLACE QUÍMICO, AMPLIOS ESTUDIOS DE VALIDACIÓN (REALIZADOS POR OTROS AUTORES Y NOSOTROS) HAN DEMOSTRADO QUE DFT ES EL MÉTODO DE ELECCIÓN EN TÉRMINOS DE EFICIENCIA Y EXACTITUD DE LOS SISTEMAS INORGÁNICOS Y BIOQUÍMICOS, PARA ALGUNOS SISTEMAS COMPLICADOS (POR EJEMPLO, ADN), DONDE LAS INTERACCIONES FUERTES (INTRAMOLECULARES) Y DÉBILES (π-ACOPLAMIENTO, PUENTES DE HIDRÓGENO) ACTÚAN SIMULTÁNEAMENTE, UN RÉGIMEN DE MÚLTIPLES NIVELES QM / QM, COMO EL RECIENTEMENTE DESARROLLADO POR NOSOTROS (QUILD), ES OBLIGATORIO, LAS INTERACCIONES CON EL ENTORNO QUÍMICO A MENUDO TIENEN UN GRAN EFECTO EN LA REACTIVIDAD O EN LAS PROPIEDADES CARACTERÍSTICAS (ESPECTROSCÓPICAS) DEL SISTEMA, SIN EMBARGO, LOS DETALLES ESPECÍFICOS DEL ENLACE QUÍMICO ENTRE LAS ESPECIES ACTIVAS Y SU ENTORNO QUÍMICO TODAVÍA NO SE CONOCEN EN PROFUNDIDAD, COMO POR EJEMPLO EL CASO DE LA REACCIÓN DE LA POLIMERASA DEL ADN, POR LO TANTO, REPRESENTACIONES PRECISAS DEL ENTORNO QUÍMICO, COMO POR EJEMPLO A TRAVÉS DE CAMPOS DE FUERZA POLARIZANTES, FORMAN UN INGREDIENTE VITAL DEL PROYECTO, LA CARACTERIZACIÓN ESPECTROSCÓPICA DE LAS ESPECIES ACTIVAS Y INTERMEDIOS DE REACCIÓN SE LLEVARÁN A CABO EN COLABORACIÓN CON GRUPOS EXPERIMENTALES, CON EL FIN DE AYUDAR A ACLARAR LOS RESULTADOS DE LOS EXPERIMENTOS, Biomedicina\bioquímica\replicación de ADN\química de fullereno\mecánica quántica\enlace químico\simulación molecular\proteínas metálicas