SE PUEDEN OBTENER APROXIMACIONES PLAUSIBLES A SECUENCIAS DE PROTEINAS ANCESTRALES A PARTIR DE SECUENCIAS DE PROTEINAS MODERNAS USANDO ANALISIS FILOGENETICOS Y BIOINFORMATICOS ADECUADOS, LAS PROTEINAS CODIFICADAS POR LAS SECUENCIAS...
SE PUEDEN OBTENER APROXIMACIONES PLAUSIBLES A SECUENCIAS DE PROTEINAS ANCESTRALES A PARTIR DE SECUENCIAS DE PROTEINAS MODERNAS USANDO ANALISIS FILOGENETICOS Y BIOINFORMATICOS ADECUADOS, LAS PROTEINAS CODIFICADAS POR LAS SECUENCIAS ASI RECONSTRUIDAS PUEDEN PREPARARSE EN EL LABORATORIO, I,E,, RESUCITARSE, EN EL ARGOT DEL CAMPO, LA RESURRECCION DE PROTEINAS ANCESTRALES FUE PROPUESTA EN 1963 POR LINUS PAULING (GANADOR DEL PREMIO NOBEL) Y SE HA USADO EN LOS ULTIMOS 25 AÑOS PARA ABORDAR PROBLEMAS IMPORTANTES EN EVOLUCION MOLECULAR, SOLO MUY RECIENTEMENTE, SIN EMBARGO, SE HAN EMPEZADO A EXPLORAR LAS APLICACIONES E IMPLICACIONES DE LA MODIFICACION DE ORGANISMOS MODERNOS CON PROTEINAS ANCESTRALES, PROPONEMOS AQUI TRES OBJETIVOS QUE, JUNTO CON UNA CARACTERIZACION EXHAUSTIVA A NIVEL DE BIOFISICA MOLECULAR, IMPLICAN PROTEINAS ANCESTRALES EN EL CONTEXTO DE ORGANISMOS MODERNOS:OBJETIVO 1, DETERMINACION DE MECANISMOS DE ADAPTACION VIRAL A NUEVOS AMBIENTES MOLECULARES, NUESTROS ESTUDIOS RECIENTES SOBRE LA PROPAGACION DEL FAGO T7 EN E, COLI INDICAN QUE TIORREDOXINAS ANCESTRALES PUEDEN PROPORCIONAR UN MODELO EXCELENTE PARA ABORDAR COMO LOS VIRUS EVOLUCIONAN PARA RECLUTAR NUEVOS FACTORES PROVIRALES (PROTEINAS DEL HUESPED SECUESTRADAS PARA PROCESES ESENCIALES PARA LA PROPAGACION VIRAL),OBJETIVO 2, ENCONTRAR INHIBIDORES ALOSTERICOS DE ENZIMAS RESPONSABLES DE LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS, PRETENDEMOS ENCONTRAR INHIBIDORES ALOSTERICOS PARA LAS BETA-LACTAMASAS, LAS ENZIMAS RESPONSABLES DEL MECANISMO PRIMARIO DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS BETA-LACTAMICOS, PLANEAMOS APROVECHAR QUE, DE ACUERDO CON NUESTROS ESTUDIOS RECIENTES, BETA-LACTAMASAS ANCESTRALES PRESENTAN CONSIDERABLE FLEXIBILIDAD Y DIVERSIDAD CONFORMACIONAL Y PROPORCIONAN, POR TANTO, PUNTOS DE PARTIDA EXCELENTES PARA IDENTIFICAR SITIOS ALOSTERICOS ESCONDIDOS (SITIOS QUE SE EXPONEN MEDIANTE FLUCTUACIONES CONFORMACIONALES),OBJETIVO 3, EXPLORAR LA RELACION ENTRE EL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS IN VIVO Y EL PLEGAMIENTO IN VITRO, NUESTROS ESTUDIOS RECIENTES SUGIEREN QUE EL PLEGAMIENTO IN VITRO REFLEJA EL PLEGAMIENTO PRIMORDIAL, PERO QUE TAMBIEN PRESENTA HUELLAS DE LA CO-EVOLUCION CON LA MAQUINARIA CELULAR QUE ASISTE EL PLEGAMIENTO IN VIVO, EXPLORAREMOS ESTAS POSIBILIDADES MEDIANTE ESTUDIOS DE PLEGAMIENTO CON PROTEINAS MODERNAS Y ANCESTRALES,LOS TRES OBJETIVOS PROPUESTOS PRESENTAN CONEXIONES CON PROBLEMAS RELACIONADOS CON LA SALUD, EN RELACION CON EL OBJETIVO 3 (PLEGAMIENTO IN VIVO VS, PLEGAMIENTO IN VITRO), HAY QUE NOTAR QUE EL PLEGAMIENTO PRECISO ES ESENCIAL PARA LA SUPERVIVENCIA DE LOS ORGANISMOS, EL PLEGAMIENTO INCORRECTO DE PROTEINAS PUEDE CONDUCIR A UN NUMERO DE ENFERMEDADES PARA LAS QUE NO EXISTE TRATAMIENTO EFICAZ EN MUCHOS CASOS, LO QUE PUEDE REFLEJAR, AL MENOS EN PARTE, NUESTRO CONOCIMIENTO INSUFICIENTE DE LOS PROCESOS DE PLEGAMIENTO DE PROTEINAS, EN RELACION AL OBJETIVO 1 (EVOLUCION DE VIRUS), LOS VIRUS DEBEN ADAPTARSE A NUEVOS AMBIENTES MOLECULARES CUANDO SALTAN DE UNA ESPECIE A OTRA Y LA TRANSMISION VIRAL ENTRE ESPECIES ESTA RELACIONADA CON ALGUNAS ENFERMEDADES GRAVES, SIN EMBARGO, ES NUESTRO OBJETIVO 2 EL QUE TIENE UNA RELEVANCIA MAS INMEDIATA EN RELACION CON UN PROBLEMA RELACIONADO CON LA SALUD, ESTO ES ASI PORQUE LA EMERGENCIA DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS ES UNA DE LAS AMENAZAS ACTUALES MAS SERIAS PARA EL GENERO HUMANO Y LA POSIBILIDAD DE ENCONTRAR NUEVOS INHIBIDORES DE LAS ENZIMAS RESPONSABLES DE LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS PODRIA TENER IMPLICACIONES INMEDIATAS EN ESTE CONTEXTO, EVOLUCIÓN MOLECULAR\EVOLUCIÓN VIRAL\RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS\PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS\PROTEÍNAS ANCESTRALES\INHIBIDORES ALOSTÉRICOS\FACTORES PROVIRALESver más
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