Descripción del proyecto
A MAYORIA DE LOS SNPS ASOCIADOS A ENFERMEDAD SE LOCALIZAN EN SECUENCIAS NO CODIFICANTES DEL GENOMA, SE PIENSA QUE MUCHOS PODRIAN ESTAR AFECTANDO LA FUNCION DE SECUENCIAS REGULADORAS, SIN EMBARGO, COMO DESCONOCEMOS LAS REGLAS QUE CONTROLAN EL GENOMA REGULADOR, NO TENEMOS CAPACIDAD DE ASIGNAR RELEVANCIA FUNCIONAL A LOS SNPS NO CODIFICANTES, LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION (FTS) Y LAS REGLAS A LAS QUE OBEDECEN PARA SU FUNCION ESTAN MUY CONSERVADOS EN EVOLUCION, RECIENTEMENTE HEMOS OBSERVADO QUE LOS PROGRAMAS GENETICOS QUE CONTROLAN LA IDENTIDAD CELULAR ESTAN TAMBIEN FILOGENETICAMENTE CONSERVADOS, EN ESTA SOLICITUD APROVECHAMOS LA SIMPLICIDAD DEL ORGANISMO MODELO C,ELEGANS Y NUESTRA EXPERIENCIA EN ESTUDIO DE SECUENCIAS REGULADORAS PARA ESTUDIAR LA LOGICA DE REGULACION TRANSCRIPCIONAL DE DOS POBLACIONES DE GRAN IMPORTANCIA EN BIOMEDICINA: LAS NEURONAS MONOAMINERGICAS Y LAS CELULAS CILIADAS, LAS MONOAMINAS (MA) SON UN GRUPO DE NEUROTRANSMISORES CONSERVADOS EN EVOLUCION Y CUYA DISFUNCION SE ASOCIA A ENFERMEDADES CON COMPONENTE GENETICO COMO PARKINSON, ESQUIZOFRENIA O TRASTORNO BIPOLAR, TRABAJO PREVIO DEL LABORATORIO HA IDENTIFICADO REDES DE REGULACION DOPAMINERGICAS Y SEROTONERGICAS QUE ESTAN CONSERVADAS ENTRE NEMATODO Y MAMIFERO, EN EL PRESENTE PROYECTO PROPONEMOS EXPANDIR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LOS MECANISMOS DE GENERACION DE DIVERSIDAD DE SUBTIPOS SEROTONERGICOS, TAMBIEN ABORDAREMOS EL ESTUDIO DE DOS NUEVOS PROGRAMAS DE IDENTIDAD MA, EL DE LAS NEURONAS TIRAMINERGICAS Y OCTOPAMINERGICAS, CUYA REGULACION TRANSCRIPCIONAL EN C,ELEGANS ES DESCONOCIDA,EN LA SEGUNDA PARTE DEL PROYECTO ESTUDIAREMOS EL PROGRAMA GENETICO QUE REGULA LA TRANSCRIPCION DE LOS GENES QUE COMPONEN EL CILIO, EL CILIO ES UNA ESTRUCTURA COMPLEJA Y FILOGENETICAMENTE CONSERVADA CON FUNCIONES DE SEÑALIZACION O MOTORAS, MAS DE 1000 POLIPEPTIDOS DISTINTOS SON NECESARIOS PARA ENSAMBLAR UN CILIO FUNCIONAL (CILIOMA), MUTACIONES EN MUCHOS DE ESTOS COMPONENTES SE ASOCIAN A ENFERMEDADES GENETICAS DENOMINADAS CILIOPATIAS, DESAFORTUNADAMENTE, SE DESCONOCE LAS MUTACIONES CAUSALES DE MUCHAS CILIOPATIAS, ES MUY PROBABLE QUE MUTACIONES EN REGIONES REGULADORAS QUE AFECTEN LA EXPRESION DE ALGUN GEN DEL CILIOMA SEAN LA CAUSA DE MUCHAS DE ESTAS ENFERMEDADES HUERFANAS, SE CONOCE MUY POCO SOBRE EL PROGRAMA GENETICO QUE REGULA LA TRANSCRIPCION COORDINADA DEL CILIOMA, CURIOSAMENTE, EL PRINCIPAL REGULADOR TRANSCRIPCIONAL CONOCIDO PARA EL CILIOMA, EL FT RFX, FUE INICIALMENTE IDENTIFICADO EN C,ELEGANS Y MAS TARDE SE DESCUBRIO SU PAPEL CONSERVADO EN VERTEBRADOS, INCLUIDO HUMANO, EN ESTA PROPUESTA UTILIZAREMOS LA SENCILLEZ DE MANEJO DE C,ELEGANS PARA IDENTIFICAR NUEVOS REGULADORES QUE ACTUAN CONJUNTAMENTE CON RFX EN EL CONTROL DE LA TRANSCRIPCION DEL CILIOMA,ESTE ES UN PROYECTO AMBICIOSO QUE COMBINA DISTINTAS ESTRATEGIAS Y TECNOLOGIAS PUNTERAS PARA ABORDAR NUESTROS OBJETIVOS DE LA MEJOR MANERA POSIBLE, CABE DESTACAR QUE CONTAMOS CON LA COLABORACION Y EL ASESORAMIENTO DE VARIOS EXPERTOS MUNDIALES EN ESTAS NUEVAS TECNOLOGIAS, LO QUE APORTA VIABILIDAD AL PROYECTO, DESDE EL PUNTO DE VISTA DE LA BIOLOGIA FUNDAMENTAL, NUESTROS RESULTADOS PUEDEN GENERAR DATOS IMPORTANTES SOBRE REGLAS GENERALES DEL GENOMA REGULADOR, DESDE EL PUNTO DE VISTA BIOMEDICO NOS PUEDEN AYUDAR A ASIGNAR FUNCION BIOLOGICA A SNPS NO CODIFICANTES ASOCIADOS A ENFERMEDADES RELACIONADAS CON LA SEÑALIZACION MA Y CON CILIOPATIAS, FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN\GENOMA REGULADOR\CILIOPATÍAS\ESPECIFICACIÓN NEURONAL\SEROTONINA\TIRAMINA\OCTOPAMINA\ENHANCER