PROCESAMIENTO DIGITAL DE IMAGENES EN CRIOMICROSCOPIA: ROMPIENDO BARRERAS
LA OBTENCION DE IMAGENES DIGITALES Y EL PROCESAMIENTO COMPUTACIONAL DE LOS DATOS GENERADOS POR LOS MICROSCOPIOS ELECTRONICOS SON LAS PIEDRAS ANGULARES DE LA DETERMINACION DE ESTRUCTURAS EN EL CAMPO DE LA CRIOMICROSCOPIA ELECTRONIC...
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Descripción del proyecto
LA OBTENCION DE IMAGENES DIGITALES Y EL PROCESAMIENTO COMPUTACIONAL DE LOS DATOS GENERADOS POR LOS MICROSCOPIOS ELECTRONICOS SON LAS PIEDRAS ANGULARES DE LA DETERMINACION DE ESTRUCTURAS EN EL CAMPO DE LA CRIOMICROSCOPIA ELECTRONICA (CRIOEM). EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL DESARROLLO TECNOLOGICO DE LOS MICROSCOPIOS ELECTRONICOS, BASADO PRINCIPALMENTE EN EL DESARROLLO DE DETECTORES DIRECTOS DE ELECTRONES, Y LOS NUEVOS ALGORITMOS DE PROCESAMIENTO DE IMAGENES, BASADOS EN ENFOQUES BAYESIANOS Y METODOS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO, HAN REVOLUCIONADO LA DETERMINACION DE ESTRUCTURAS EN SISTEMAS BIOLOGICOS. LOS DETECTORES DIRECTOS DE ULTIMA GENERACION SON CAPACES DE PRODUCIR IMAGENES DIGITALES DE LAS MOLECULAS QUE COMPONEN LOS SERES VIVOS A UN NIVEL DE DETALLE SIN PRECEDENTES. ESTOS DATOS, COMBINADOS CON UN INTENSO PROCESAMIENTO COMPUTACIONAL DE LAS IMAGENES, PERMITEN DETERMINAR LA ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS Y LOS ACIDOS NUCLEICOS A RESOLUCION ATOMICA, LO QUE PERMITE A LOS INVESTIGADORES FORMULAR HIPOTESIS PRECISAS SOBRE LOS MECANISMOS QUE CONTROLAN LOS PROCESOS BIOQUIMICOS O INCLUSO POSIBILITAR EL DESARROLLO DE NUEVOS FARMACOS.COMO SE HA MENCIONADO, UNO DE LOS PILARES SOBRE LOS QUE SE SUSTENTA ESTA REVOLUCION ES EL RECIENTE DESARROLLO DE NUEVAS HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA EL PROCESAMIENTO DIGITAL DE IMAGENES; SIN EMBARGO, EN ESTE ASPECTO, AUN QUEDAN PROBLEMAS POR RESOLVER PARA QUE LA CRIOEM CUMPLA CON SU ENORME POTENCIAL. ENTRE ESTAS BARRERAS, PODRIAMOS DESTACAR DOS QUE SON ESPECIALMENTE IMPORTANTES: LA PRIMERA ES QUE MUCHAS MOLECULAS BIOLOGICAS PRESENTAN UNA VARIEDAD CONFORMACIONAL QUE HACE MUY DIFICIL EL PROCESAMIENTO DE SUS IMAGENES. LA SEGUNDA ES QUE ALGUNOS DE LOS PASOS DEL PROCESAMIENTO DE IMAGENES SIGUEN REQUIRIENDO INVESTIGADORES EXPERIMENTADOS PARA RESOLVERLOS DE FORMA EFICIENTE. EL DESARROLLO DE NUEVOS ALGORITMOS Y PROTOCOLOS DE PROCESAMIENTO DE IMAGENES QUE ELIMINEN ESTAS LIMITACIONES AYUDARA A LA CRIOEM A AMPLIAR SU POTENCIAL COMO HERRAMIENTA DE INVESTIGACION.EL PRESENTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO DESARROLLAR Y MEJORAR HERRAMIENTAS PARA EL PROCESAMIENTO COMPUTACIONAL DE DATOS DE MICROSCOPIA QUE PERMITAN LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS HETEROGENEAS, REDUCIENDO AL MISMO TIEMPO LA EXPERIENCIA NECESARIA PARA LLEVARLO A CABO. TODA LA INVESTIGACION SE REALIZARA TOMANDO COMO BASE EL EJEMPLO REAL DE UN COMPLEJO MACROMOLECULAR DESAFIANTE QUE PRESENTA UNA VARIABILIDAD CONFORMACIONAL CONTINUA, LA RIBONUCLEOPROTEINA DEL VIRUS DE LA GRIPE A (RNP), DANDO ASI UNA APLICACION DIRECTA A LOS RESULTADOS OBTENIDOS.ES IMPORTANTE DESTACAR TAMBIEN LA TRASCENDENCIA QUE TIENE ESTA MUESTRA BIOLOGICA. LAS RNPS SON LOS COMPLEJOS MACROMOLECULARES QUE CONTIENEN EL RNA GENOMICO DEL VIRUS JUNTO CON MULTIPLES COPIAS DE UNA NUCLEOPROTEINA Y LA POLIMERASA VIRAL Y FUNCIONALMENTE SON LAS ENCARGADAS DE LA TRANSCRIPCION Y REPLICACION, ES DECIR, LAS RNPS SON RESPONSABLES ULTIMAS DE LA PROLIFERACION VIRAL. RESOLVER SU ESTRUCTURA A ALTA RESOLUCION CON LA METODOLOGIA AQUI DESARROLLADA SERVIRA PARA ENTENDER MEJOR DICHOS MECANISMOS Y PUEDE AYUDAR AL DESARROLLO DE FARMACOS EN EL FUTURO.
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