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PID2021-126543OB-C22

Financiado

PROCESADO DE SEÑAL EN METABOLOMICA CUANTITATIVA DIRIGIDA Y DESCUBRIMIENTO DE BIO...

PROCESADO DE SEÑAL EN METABOLOMICA CUANTITATIVA DIRIGIDA Y DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES VOLATILES BASADO EN APRENDIZAJE AUTOMATICO: APLICACION A CRIBADO DE CANCER LA METABOLOMICA ES LA ULTIMA DE LAS CIENCIAS OMICAS QUE HAN APARECIDO PARA INTENTAR IMPLEMENTAR LA MEDICINA PERSONALIZADA. SU OBJETIVO ES CARACTERIZAR COMPLETAMENTE EL CONJUNTO DE MOLECULAS PEQUEÑAS PRESENTES EN UN BIOFLUIDO (EL... ver más

01/01/2021

URV

182K€

Presupuesto del proyecto: 182K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD ROVIRA I VIRGILI No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 7

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

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Participantes

URV

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD ROVIRA I VIRGILI

Total investigadores 7

Presupuesto del proyecto 182K€

Descripción del proyecto LA METABOLOMICA ES LA ULTIMA DE LAS CIENCIAS OMICAS QUE HAN APARECIDO PARA INTENTAR IMPLEMENTAR LA MEDICINA PERSONALIZADA. SU OBJETIVO ES CARACTERIZAR COMPLETAMENTE EL CONJUNTO DE MOLECULAS PEQUEÑAS PRESENTES EN UN BIOFLUIDO (EL METABOLOMA). UNA DE LAS PRINCIPALES VENTAJAS DE LA METABOLOMICA ES QUE MIENTRAS OTRAS CIENCIAS "OMICAS" PUEDEN DECIRTE LO QUE PUEDE SUCEDER, CONOCER EL METABOLOMA DE UN ORGANISMO VIVO TE DICE LO QUE REALMENTE ESTA SUCEDIENDO.LA HIPOTESIS SUBYACENTE DE LA METABOLOMICA DEL CANCER ES QUE LA COMPOSICION QUIMICA DE LA MAYORIA DE LOS BIOFLUIDOS ACCESIBLES EN HUMANOS SE ALTERA DE FORMAS DESCONOCIDAS. PARA CARACTERIZAR ESOS CAMBIOS, LAS MEDICIONES EN BIOFLUIDOS HUMANOS CON INSTRUMENTACION QUIMICA DE ULTIMA GENERACION PROPORCIONAN UNA GRAN CANTIDAD DE DATOS SIN PROCESAR QUE SON DIFICILES DE INTERPRETAR CLINICAMENTE.LA METABOLOMICA COMPUTACIONAL NO ORIENTADA TIENE COMO OBJETIVO EXTRAER LA MAYOR CANTIDAD DE INFORMACION POSIBLE DE UNA GRAN CANTIDAD DE DATOS SIN PROCESAR Y TRADUCIR ESA INFORMACION EN BIOMARCADORES CLINICOS PARA EL DIAGNOSTICO DE ENFERMEDADES. ESTO DEPENDE EN GRAN MEDIDA DEL USO DE PROCESAMIENTO DE SEÑALES Y DIFERENTES TIPOS DE ALGORITMOS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO. EXISTE UNA NECESIDAD NO CUBIERTA CONSISTENTE EN EL DESARROLLO DE FLUJOS DE TRABAJO DE PROCESAMIENTO DE DATOS PARA ANALIZAR DATOS BRUTOS CUANDO SE UTILIZA CROMATOGRAFIA DE GASES Y ESPECTROMETRIA DE MASAS. PERO INCLUSO SI SE PUEDE HACER UNA DISTINCION Y SE ENCUENTRAN BIOMARCADORES, EN LA MAYORIA DE LOS CASOS SE DESCONOCE LA IDENTIDAD QUIMICA DEL BIOMARCADOR. ESTA ES UNA DE LAS PRINCIPALES DIFICULTADES PARA TRASLADAR ESTOS RESULTADOS AL AMBITO CLINICO. EN LA MAYORIA DE LOS CASOS, LOS MEDICOS NO SOLO ESTAN INTERESADOS EN MODELOS PREDICTIVOS, SINO TAMBIEN EN LA INTERPRETACION BIOLOGICA DE LOS BIOMARCADORES ENCONTRADOS.POR ESTA RAZON, NUESTRO OBJETIVO EN ESTE PROYECTO ES UTILIZAR INFORMACION DE LA BASE DE DATOS DEL METABOLOMA HUMANO PARA DESARROLLAR UNA BIBLIOTECA EXTENSA DE COMPUESTOS CLAVE EN LA ORINA HUMANA QUE ESTAN ASOCIADOS CON IMPORTANTES PROCESOS METABOLICOS. AQUI, EL MAYOR DESAFIO ES IDENTIFICAR Y CUANTIFICAR COMPUESTOS ESPECIFICOS (UN ENFOQUE DIRIGIDO) DENTRO DE LA MIRIADA DE COMPUESTOS PRESENTES EN EL BIOFLUIDO SELECCIONADO: LA ORINA.DE ESTA MANERA, ESPERAMOS PODER CUANTIFICAR UN CONJUNTO DADO DE METABOLITOS CLAVE, FIJOS Y ESPECIFICOS CON IDENTIDADES QUIMICAS PREVIAMENTE CONOCIDAS. INCLUSO CON UN ENFOQUE DIRIGIDO, EL USO DE METODOS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA EL ANALISIS DE DATOS Y LA SELECCION DE CARACTERISTICAS SIGUE SIENDO UNA GRAN NECESIDAD SI EL PERFIL DE METABOLITOS IDENTIFICADO TIENE UNA ALTA CARDINALIDAD. ADEMAS, UN SUBCONJUNTO DE ENFOQUES DE APRENDIZAJE AUTOMATICO, LAS TECNICAS DE APRENDIZAJE PROFUNDO ESTAN GANANDO MUCHO TERRENO PARA EL PRE-PROCESAMIENTO DE DATOS A BAJO NIVEL, COMO LA DETECCION E IDENTIFICACION DE PICOS.EN ESTE PROYECTO QUEREMOS COMBINAR ESTA CLASIFICACION DE CARACTERISTICAS CON UN ALGORITMO DE BUSQUEDA ADECUADO PARA LA SELECCION FINAL DEL MEJOR SUBCONJUNTO PARA LOS MODELOS DE PREDICCION.UN ASPECTO DESTACADO DE ESTE PROYECTO ES EL USO DE VARIAS TECNICAS DE ANALISIS (CON DIFERENTES INSTRUMENTOS DE ULTIMA GENERACION) EN ALICUOTAS DE LAS MISMAS MUESTRAS. ESPERAMOS ENCONTRAR INFORMACION COMPLEMENTARIA SOBRE LA COMPOSICION DE LA MUESTRA Y, POR LO TANTO, VALE LA PENA INVESTIGAR LAS TECNICAS DE INTEGRACION DE DATOS MULTIOMICA. PRENDIZAJE MAQUINA\BIOMARCADORES VOLATILES\ESPECTROMETRIA DE MASAS\ORBITRAP\CROMATOGRAFIA DE GASES\METABOLOMICA\ORINA\DETECCION DE PICOS\CANCER\HALLAZGO DE BIOMARCADORES

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