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TIN2009-14057-C03-02

Financiado

PLATAFORMA DE DESARROLLO E INTEGRACION DE TECNICAS INFORMADAS DE MINERIA DE DATO...

PLATAFORMA DE DESARROLLO E INTEGRACION DE TECNICAS INFORMADAS DE MINERIA DE DATOS EN AMBITO CLINICO LA BIOLOGIA MOLECULAR HA GENERADO, A PARTIR DE LA ULTIMA DECADA, CANTIDADES INGENTES DE INFORMACION PROVENIENTE DE DIVERSOS PROYECTOS DE SECUENCIACION, LAS TECNOLOGIAS DE ANALISIS DE LA EXPRESION GENETICA MEDIANTE MICROARRAYS DE A... ver más

01/01/2009

UVIGO

115K€

Presupuesto del proyecto: 115K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDADE DE VIGO No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 410

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01

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Participantes

UVIGO

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDADE DE VIGO

Total investigadores 410

Presupuesto del proyecto 115K€

Descripción del proyecto LA BIOLOGIA MOLECULAR HA GENERADO, A PARTIR DE LA ULTIMA DECADA, CANTIDADES INGENTES DE INFORMACION PROVENIENTE DE DIVERSOS PROYECTOS DE SECUENCIACION, LAS TECNOLOGIAS DE ANALISIS DE LA EXPRESION GENETICA MEDIANTE MICROARRAYS DE ADN HAN CONTRIBUIDO AUN MAS, SI CABE, AL CRECIMIENTO CASI EXPONENCIAL DE LA INFORMACION DISPONIBLE, EL PRINCIPAL PROBLEMA DE ESTA TECNICA RADICA EN LA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION QUE PUEDE PROPORCIONAR, SOBRE TODO PORQUE RESULTA NECESARIO DISCRIMINAR AQUELLOS GENES QUE SON CLAVE A LA HORA DEL DIAGNOSTICO DE UNA ENFERMEDAD O EN LA CARACTERIZACION DE UN DETERMINADO PROCESO,EN LA SITUACION ACTUAL, LA EXTRACCION CLARA Y COHERENTE DE HIPOTESIS, A PARTIR DE GRANDES CONJUNTOS DE DATOS PROCEDENTES DEL GENOMA, SIGUE SIENDO UN RETO IMPORTANTE, A ESTE RESPECTO, LA MAYORIA DEL TRABAJO INICIAL EN ESTE CAMPO SE HA CENTRADO EN EL DESARROLLO DE TECNICAS PARA IDENTIFICAR DE FORMA PRECISA GENES EXPRESADOS DE FORMA DIFERENCIAL, ASI COMO SU SIGNIFICANCIA ESTADISTICA EN DISTINTOS DISEÑOS EXPERIMENTALES, SIN EMBARGO, LA MAYOR DIFICULTAD DEL ANALISIS RECAE NO EN LA IDENTIFICACION DE DICHOS GENES (MEDIANTE TECNICAS DE MINERIA DE DATOS), SINO EN SU INTERPRETACION (MEDIANTE TECNICAS DE MINERIA DE TEXTOS), EN ESTE SENTIDO, RECIENTEMENTE SE HAN REALIZADO TRABAJOS RECOPILATORIOS DE TIPO METODOLOGICO QUE TRATAN DE APORTAR ESA NUEVA VISION SOBRE EL CAMPO,POR LO TANTO, EL RETO ACTUAL SE ENCUENTRA EN EL DESARROLLO, POR PARTE DE EQUIPOS MULTIDISCIPLINARES, DE APLICACIONES FLEXIBLES Y ABIERTAS, CAPACES DE INTEGRAR "DATOS" Y "TECNICAS" RELACIONADAS CON UN DOMINIO PARTICULAR, SUPERANDO CON ELLO LAS LIMITACIONES DE LAS APROXIMACIONES EXISTENTES, EN CONCRETO, SE HACE NECESARIO EL DESARROLLO DE NUEVOS MODELOS HIBRIDOS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL, CAPACES DE REPRESENTAR, INTEGRAR Y SINTETIZAR CONOCIMIENTO BIOLOGICO PROVENIENTE DE MUY DIVERSAS FUENTES, CON EL FIN DE MEJORAR LOS RESULTADOS OBTENIDOS POR TECNICAS CLASICAS DE ANALISIS DE MICROARRAYS EN TAREAS DE CLASIFICACION Y AGRUPAMIENTO,EL PRESENTE SUBPROYECTO PERSIGUE LA IMPLEMENTACION DE UNA PLATAFORMA SOFTWARE DE COMPONENTES REUTILIZABLES PARA LA CREACION DE TECNICAS INFORMADAS DE MINERIA DE DATOS CON APLICACION TRASLACIONAL EN EL AMBITO CLINICO, EN CONCRETO, SE ESTUDIARAN LAS DISTINTAS FUENTES DE INFORMACION BIOLOGICA DISPONIBLE, CON EL FIN DE POSIBILITAR LA DEFINICION DE UN MODELO FLEXIBLE CAPAZ DE UTILIZAR ESTE CONOCIMIENTO PARA MEJORAR LOS RESULTADOS DE LAS TECNICAS CLASICAS DE CLASIFICACION Y AGRUPAMIENTO APLICADAS A DATOS PROCEDENTES DE MICROARRAYS DE ADN, LA FINALIDAD ULTIMA SERA LA MEJORA DE LA PROPIA PRECISION DEL MODELO O LA DEFINICION DE UN MECANISMO QUE PERMITA LA GENERACION DE EXPLICACIONES A PARTIR DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS, PARA ELLO, SE INTEGRARAN EN LA PLATAFORMA AQUELLOS ENTORNOS SOFTWARE COMUNMENTE EMPLEADOS EN TRABAJOS DE MINERIA DE DATOS Y TEXTO (GATE, RAPIDMINER Y WEKA, ENTRE OTROS) ADEMAS DE FUENTES DE INFORMACION DE TIPO BIOLOGICO (GENOMICA, PROTEOMICA, REDES DE INTERACCION PROTEICA, RUTAS METABOLICAS Y ANOTACION DE GENES MEDIANTE ONTOLOGIAS), PLATAFORMA SOFTWARE\MINERIA DE DATOS\TECNICAS BASADAS EN CONOCIMIENTO\MEDICINA TRASLACIONAL\AMBITO CLINICO\MICROARRAYS DE ADN\INTEGRACION DE FUENTES DE CONOCIMIENTO\COMPONENTES SOFTWARE REUTILIZABLES

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