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PID2019-108082GA-I00

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BIOLOGIA SINTETICA DE ELEMENTOS REGULADORES DE GENES MEDIANTE GENOMICA DE CELULA...

BIOLOGIA SINTETICA DE ELEMENTOS REGULADORES DE GENES MEDIANTE GENOMICA DE CELULAS INDIVIDUALES DURANTE EL DESARROLLO Y LA DIFERENCIACION CELULAR, LA INFORMACION GENETICA DEBE ACTIVARSE DE MANERA PRECISA Y ALTAMENTE CONTROLADA, POR EJEMPLO, LA DIFERENCIACION DE CELULAS MADRE HEMATOPOYETICAS EN CELULAS SANGUINEAS E INMUNES, N... ver más

01/01/2019

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157K€

Presupuesto del proyecto: 157K€

Líder del proyecto

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TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 157K€

Descripción del proyecto DURANTE EL DESARROLLO Y LA DIFERENCIACION CELULAR, LA INFORMACION GENETICA DEBE ACTIVARSE DE MANERA PRECISA Y ALTAMENTE CONTROLADA, POR EJEMPLO, LA DIFERENCIACION DE CELULAS MADRE HEMATOPOYETICAS EN CELULAS SANGUINEAS E INMUNES, NECESITA DE LA ACTIVACION Y REPRESION COORDINADA DE CIENTOS DE GENES; LOS CUALES POSEEN DISTINTOS PATRONES DE EXPRESION DEPENDIENDO EL TIPO CELULAR Y FASES DE DIFERENCIACION, POR ESO, ES EVIDENTE QUE UNA LOGICA REGULATORIA COMPLEJA CONECTA EL ESTADO ACTUAL DE LA CELULA, SUS SEÑALES EXTERIORES, Y SU EXPRESION GENICA,BASICAMENTE, LA DECISION SOBRE QUE GENES DEBEN ACTIVARSE SE HACE EN CIS, MEDIANTE LA INTEGRACION DE LAS SEÑALES DE LOS PROMOTORES Y ENHANCERS, POR ESO, LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION ACTIVOS EN UNA CELULA DADA INTERACTUAN CON EL ADN MEDIANTE REGLAS COMPLEJAS QUE IMPLICAN COOPERATIVIDAD, SINERGIA Y ANTAGONISMO, SIN EMBARGO, SE TIENE UN ESCASO ENTENDIMIENTO DE ESTAS REGLAS Y NO ES CLARO COMO LA SECUENCIA DEL ADN DE LOS PROMOTORES Y LOS ENHANCERS COORDINAN LA EXPRESION GENICA DURANTE EL DESARROLLO Y LA DIFERENCIACION, EN CONCRETO, FALTA UN CONOCIMIENTO CUANTITATIVO DE LA GRAMATICA DE LA EXPRESION GENICA DURANTE LA DIFERENCIACION CELULAR, POR LO QUE, NO ES POSIBLE DISEÑAR RACIONALMENTE PROMOTORES Y ENHANCERS ARTIFICIALES, AUNQUE ESTA CAPACIDAD SERIA MUY UTIL PARA LA BIOTECNOLOGIA, EL DESARROLLO DE LAS TERAPIAS GENICAS, Y TODA LA DISCIPLINA DE GENETICA,POR LO ANTERIOR, PROPONEMOS QUE LOS ELEMENTOS REGULADORES EN CIS TRADUCEN EL ESTADO CELULAR (PARTICULARMENTE, LA ACTIVIDAD DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION) A LA EXPRESION GENICA MEDIANTE REGLAS QUE PODEMOS DESCRIBIR CON MODELOS PREDICTIVOS, CUANTITATIVOS E INTERPRETABLES, EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES IDENTIFICAR ESTAS REGLAS CARACTERIZANDO LA ACTIVIDAD DE UNA GRAN CANTIDAD DE SECUENCIAS DE PROMOTORES DISEÑADAS ARTIFICIALMENTE EN DIFERENTES ETAPAS DE DIFERENCIACION DE CELULAS MADRE HEMATOPOYETICAS, EN CONCRETO, PROPONEMOS UTILIZAR GENOMICA DE CELULAS INDIVIDUALES COMO UNA HERRAMIENTA POTENTE PARA IDENTIFICAR ELEMENTOS REGULADORES DE GENES ARTIFICIALES CON ALTA ESPECIFICIDAD POR CUALQUIER TIPO DE CELULA O FASE DE DIFERENCIACION, EL ENFOQUE PROPUESTO NOS PERMITIRA CRIBAR UNAS 100,000S SECUENCIAS DE PROMOTORES CANDIDATOS EN UNAS 100,000S CELULAS INDIVIDUALES DE LAS CUALES SE CONOCE LA FASE DE DIFERENCIACION Y LA EXPRESION DE TODOS LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION RELEVANTES, DE ESTA MANERA SE OBTENDRA UN CONJUNTO DE DATOS MASIVO SOBRE LA ACTIVIDAD DE PROMOTORES EN DIFERENTES CONTEXTOS CELULARES, FINALMENTE, LA DISPONIBILIDAD DE ESTOS DATOS PERMITIRA DESARROLLAR MODELOS CUANTITATIVOS SOBRE LA ACTIVIDAD DE CUALQUIER PROMOTOR, Y FACILITARA EN ULTIMA INSTANCIA LA INGENIERIA RACIONAL DE PROMOTORES Y ENHANCERES ESPECIFICOS PARA CUALQUIER TIPO DE CELULA, SINGLE CELL GENOMICS\BIOLOGIA SINTETICA\REGULACION DE GENES\HEMATOPOYESIS\CELULAS MADRE

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