Pirosecuenciador para ultrasecuenciación Escala Media
El Servicio de Secuenciación de DNA de la EEZ ha comenzado a funcionar en Enero de 2010 dentro del Plan Estratégico del Centro (2010-13) en base a la tecnología clásica Sanger, No obstante el Servicio tiene la vocación de desarro...
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Fecha límite participación
Sin fecha límite de participación.
Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2010-01-01
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Descripción del proyecto
El Servicio de Secuenciación de DNA de la EEZ ha comenzado a funcionar en Enero de 2010 dentro del Plan Estratégico del Centro (2010-13) en base a la tecnología clásica Sanger, No obstante el Servicio tiene la vocación de desarrollarse en base a la incorporación de las tecnologías de ultrasecuenciación con objeto de dar soporte a la investigación que se desarrolla en las distintas líneas de investigación, relacionadas con la diversidad de microorganismos, genómica de novo, metagenómica, transcriptómica, detección de patógenos, etc , La demanda inicial, sobre todo interna, esta contribuyendo a la implantación de este servicio, y se considera que la incorporación de esta nuevas tecnología en formatos adecuados (mediana escala de lecturas ~100,000) servirá para dar respuesta tanto a la demanda interna como a la externa, que en muchas ocasiones no tiene respuesta de las empresas que tienen Pirosecuenciadores a gran escala, Estamos interesados en equipos basados en la tecnología de pirosecuenciación 454 GLX Titanium, adaptados a proyectos a menor escala de los aparatos utilizados hasta ahora y que ofrezcan: -La misma longitud de lectura (400-800b),-Protocolos de software rápidos para ensamblar y adaptarlos a distintos proyectos de secuenciación a gran escala,Las prestaciones del equipo, a su vez, deben permitir:-Secuenciación de alto rendimiento: en cada run se debe leer un mínimo de 35 Mb de alta calidad (con una fiabilidad superior al 99%),