PEPTIDOS E INTERACCIONES MOLECULARS: ESTRATEGIAS DE CALCULO Y SOLIDEZ COMPUTACIO...
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Descripción del proyecto
NUESTRO ULTIMO PROYECTO HACIA ESPECIAL ENFASIS EN EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE NUEVAS HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA EL ANALISIS DE LOS RESULTADOS DE CALCULOS AB INITIO EN TERMINOS GENUINAMENTE QUIMICOS, ACTUALMENTE NOS ENCONTRAMOS EN EL PUNTO ESPERADO EN QUE DISPONEMOS DE UNA METODOLOGIA SUFICIENTEMENTE MADURA COMO PARA PLANTEAR SU USO EXTENSIVO A UN AMPLIO ESPECTRO DE PROBLEMAS DE DIVERSA INDOLE RELACIONADOS CON LA CARACTERIZACION DE INTERACCIONES INTER E INTRAMOLECULARES Y PROCESOS REACTIVOS, DE TODO EL ABANICO DE POSIBILIDADES NOS DECANTAMOS ESPECIALMENTE POR EL ESTUDIO DE BIOMOLECULAS, CON EL FIN DE CONTRIBUIR A UN MAYOR CONOCIMIENTO DE LA NATURALEZA DE LAS INTERACCIONES MOLECULARES QUE DETERMINAN LA ESTRUCTURA DE LOS AMINOACIDOS Y OLIGOPEPTIDOS, COMO OBJETIVOS PRIMORDIALES PRETENDEMOS ESTABLECER UNA ESCALA ENERGETICA UNICA PARA INTERACCIONES POR PUENTE DE HIDROGENO, TANTO INTRA- COMO INTERMOLECULARES Y PREDECIR LOS PATRONES DE FRAGMENTACION DE AMINOACIDOS Y OLIGOPEPTIDOS IONIZADOS HACIENDO USO DE LAS HERRAMIENTAS DE ANALISIS DESARROLLADAS POR EL GRUPO, ASI COMO DE OTRAS ESTRATEGIAS PREESTABLECIDAS O ESTANDAR DE CALCULO,POR OTRO LADO DEDICAREMOS ESFUERZOS PARA AVANZAR EN EL ESTABLECIMIENTO DE CORRELACIONES CUANTITATIVAS ENTRE LA MAGNITUD DE LAS CONSTANTES DE ACOPLAMIENTO SPIN-SPIN Y LOS PARAMETROS GEOMETRICOS DE LOS PEPTIDOS QUE CARACTERIZAN SU ESTRUCTURA SECUNDARIA, ASI COMO EN LA ELUCIDACION DEL MECANISMO DE ACCION ANTIMICROBIANA DE PEPTIDOS CICLICOS QUE PERMITA EN UN FUTURO APLICAR EL CONOCIMIENTO ADQUIRIDO AL DISEÑO EFECTIVO DE NUEVOS BIOFARMACOS CON POTENCIAL ACTIVIDAD BIOLOGICA,FINALMENTE, PRETENDEMOS CONFECCIONAR UN PROGRAMA DE CALCULO GENERAL QUE RECOJA TODOS LOS NUEVOS AVANCES METODOLOGICOS Y TECNICOS CON EL FIN DE DOTAR A LA COMUNIDAD CIENTIFICA CON UNA HERRAMIENTA SENCILLA Y EFICIENTE PARA EL ANALISIS E INTERPRETACION DE LOS RESULTADOS DE LOS CALCULOS AB INITIO, Descomposición de la Energía\BSSE\Enlaces de Hidrógeno\Interacciones Intermoleculares\Interacciones Intramoleculares\Fragmentacions\Péptidos
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