Descripción del proyecto
LOS METALES PARTICIPAN EN NUMEROSOS PROCESOS MOLECULARES DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR, REACCIONES CATALITICAS Y COMO ESTABILIZADORES ESTRUCTURALES, EL ESTUDIO DE SUS MECANISMOS A ESCALA ATOMICA SUELE SER COMPLEJO EXPERIMENTALMENTE, LA MODELIZACION MOLECULAR ES UNA HERRAMIENTA MUY UTIL PARA LA COMPRENSION DE ESTOS SISTEMAS, Y A PESAR DE LOS EXITOS LOGRADOS, HAY CIERTOS ASPECTOS QUE SIGUEN SUPONIENDO UN DESAFIO,NUESTRA PRINCIPAL ACTIVIDAD HISTORICAMENTE SE HA CENTRADO EN EL ESTUDIO DE LA CATALISIS HOMOGENEA Y COMPUESTOS DE COORDINACION, LA APLICACION DE LA MECANICA CUANTICA (SOBRE TODO METODOS DFT), HA SIDO CLAVE EN LA COMPRENSION DE MECANISMOS CATALITICOS Y MODELOS BIOINORGANICOS, EN LA ULTIMA DECADA, HEMOS INCORPORADO METODOS COMO LA DINAMICA MOLECULAR AB INITIO (AIMD), METODOS DE MECANICA MOLECULAR (COMO DINAMICA MOLECULAR CLASICA, DOCKING, ANALISIS DE MODOS NORMALES, ETC,) Y ENFOQUES DE QUIMIO Y BIOINFORMATICA, ESTA EXPERIENCIA NOS HA DADO LA OPORTUNIDAD DE AVANZAR EN LA APLICACION DE LA QUIMICA COMPUTACIONAL A PROCESOS MEDIADOS POR METALES, INCLUYENDO 1) EL ESTUDIO DE PROCESOS DE CATALISIS HOMOGENEA MAS COMPLEJOS, 2) EL ESTUDIO Y DISEÑO DE SISTEMAS OBTENIDOS POR LA INSERCION DE ESPECIES METALICAS EN PROTEINAS (METALOPEPTIDOS Y METALOENZIMAS ARTIFICIALES) Y 3) EL ESTUDIO DE PROCESOS CATALITICOS EN NANOCAJAS SUPRAMOLECULARES,EN ESTE PROYECTO, SE PRETENDE IR UN PASO MAS ALLA CON EL OBJETIVO DE: 1) APLICAR LA METODOLOGIA ADECUADA PARA EL DISEÑO COMPUTACIONAL DE PROCESOS MEDIADOS POR METALES (JUGANDO UN PAPEL IMPORTANTE EN LA FASE DE DISEÑO DE LOS EXPERIMENTOS, Y NO SOLO EN LA EXPLICACION POSTERIOR DE LOS MISMOS, 2) AMPLIAR NUESTRA CAPACIDAD PARA TRABAJAR EN PROCESOS HOST-GUEST TANTO DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR COMO CATALITICOS, LA MAYORIA DE LOS TRABAJOS SE REALIZARAN CON ENFOQUES QUE COMBINAN DIVERSAS METODOLOGIAS (DFT, MD CLASICO, DOCKING, ,,,) Y/O METODOS PROPIOS (GAUDIMM Y ALGUNAS EXTENSIONES RECIENTES COMO GPATHFINDER O BIOMETALL),LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO SE HAN DIVIDIDO EN TRES SECCIONES, LA PRIMERA TRATA SOBRE CATALISIS: 1) CATALISIS ORGANOMETALICA CON EL OBJETIVO DE DESARROLLAR CATALIZADORES BASADOS TANTO EN ELEMENTOS DE LA PRIMERA SERIE DE TRANSICION, COMO EL COBRE, Y ELEMENTOS DE LOS GRUPOS PRINCIPALES (COMO EL SILICIO Y ALUMINIO); 2) CATALISIS EN ESPACIOS CONFINADOS GENERADOS POR METALOCAJAS Y 3) EL DISEÑO DE METALOENZIMAS ARTIFICIALES QUE INCLUYEN COMPLEJOS METALICOS NO NATURALES DE ORO O MONOOXIGENASAS DE HIERRO NO HEMINICAS, LA SEGUNDA SECCION SE CENTRA EN PROCESOS DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR MEDIADOS POR METALES COMO: 1) POTENCIALES FARMACOS CONTRA LA LEISHMANIA BASADOS EN PALADIO Y 2) METALOCAJAS CON CAPACIDAD DE DESARROLLAR ANISOTROPIA, NUESTRO OBJETIVO ES PROPORCIONAR INFORMACION MOLECULAR UTIL QUE PUEDA USARSE PARA DESCUBRIR, DISEÑAR Y/U OPTIMIZAR ESTOS SISTEMAS, EN ESTRECHA COLABORACION CON GRUPOS EXPERIMENTALES EN TODO EL MUNDO, LA TERCERA SECCION ESTA DEDICADA A DESARROLLOS COMPUTACIONALES NECESARIOS PARA NUESTRO TRABAJO QUE IMPLICAN 1) ACTUALIZACIONES NECESARIAS EN GAUDIMM QUE INCLUYEN UNA VERSION MAS EFICIENTE DEL SOFTWARE Y 2) UN NUEVO OBJETIVO QUE CONSISTIRA EN DESARROLLAR INTERFACES GRAFICAS BASADAS EN LA WEB QUE DEBERIAN MEJORAR LA VISIBILIDAD Y LA FACILIDAD DE USO DE NUESTRO SOFTWARE, QUIMICA COMPUTACIONAL\DFT\MD\DOCKINGS\METALOENZIMAS ARTIFICIALES\NANOCAJAS\CATALISIS\RECONOCIMIENTO\DESARROLLO DE PROGRAMAS