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PID2020-115040GB-I00

Financiado

PAISAJES EVOLUTIVOS DE LA TRANSICION MATERNO-CIGOTICA EN METAZOOS

UNO DE LOS POCOS PROCESOS UNIVERSALES EN EL DESARROLLO DE LOS ANIMALES ES LA TRANSICION MATERNO-CIGOTICA (MZT), A TRAVES DE LA CUAL LA EMBRIOGENESIS DEJA DE ESTAR ORQUESTADA POR LOS TRANSCRITOS Y PROTEINAS DEPOSITADOS POR LA MADRE... ver más

01/01/2020

FUNDACIO PRIVADA C...

290K€

Presupuesto del proyecto: 290K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 290K€

Descripción del proyecto UNO DE LOS POCOS PROCESOS UNIVERSALES EN EL DESARROLLO DE LOS ANIMALES ES LA TRANSICION MATERNO-CIGOTICA (MZT), A TRAVES DE LA CUAL LA EMBRIOGENESIS DEJA DE ESTAR ORQUESTADA POR LOS TRANSCRITOS Y PROTEINAS DEPOSITADOS POR LA MADRE DURANTE LA OVOGENESIS Y PASA AL CONTROL DEL GENOMA CIGOTICO MEDIANTE SU TRANSCRIPCION ACTIVA, EN TODAS LAS ESPECIES, ESTA TRANSICION COMPRENDE LOS MISMOS PASOS BASICOS: (I) LA CONTRIBUCION MATERNA ES ELIMINADA PARCIALMENTE (PASIVA O ACTIVAMENTE) Y (II) EL GENOMA CIGOTICO ES ACTIVADO, NORMALMENTE A TRAVES DE UNA PRIMERA "OLA MENOR" DE UNOS POCOS GENES CLAVES Y LUEGO UNA SEGUNDA "OLA MAYOR", EN LA QUE CIENTOS O MILES DE GENES SE COMIENZAN A EXPRESAR, LA ACTIVACION DEL GENOMA CIGOTICO (ZGA) ES, POR TANTO, UN PASO FUNDAMENTAL PARA LA POSTERIOR DIFERENCIACION CELULAR Y ORGANOGENESIS, SIN EMBARGO, EL ESTADIO EN EL QUE OCURRE ESTA ZGA Y LOS CAMBIOS TRANSCRIPTOMICOS ASOCIADOS A ELLA SE DESCONOCEN PARA LA GRAN MAYORIA DE LOS LINAJES ANIMALES, YA QUE HASTA AHORA SOLO SE HAN ESTUDIADO EN UNOS POCOS ORGANISMOS MODELO, EN ESTE PROYECTO, PRIMERO IDENTIFICAREMOS EL ESTADIO DEL DESARROLLO EN EL QUE SE PRODUCE LA OLA PRINCIPAL DE ZGA EN CASI 40 ESPECIES ANIMALES DE 13 FILOS DISTINTOS, CUBRIENDO UN RANGO EVOLUTIVO DE MAS DE 700 MILLONES DE AÑOS (DESDE ESPONJAS HASTA HUMANOS), PARA ELLO, IMPLEMENTAREMOS UNA ESTRATEGIA NOVEDOSA DE SECUENCIACION MASIVA DE RNA (RNA-SEQ) CONSISTENTE EN AGRUPAR MUESTRAS INDIVIDUALES DE DISTINTOS ESTADIOS PARA MULTIPLES ESPECIES Y LUEGO ASIGNAR LAS SECUENCIAS OBTENIDAS A CADA ESPECIE A TRAVES DE UN ALGORITMO DE ALINEAMIENTO ESPECIALIZADO (OBJETIVO 1), TRAS ELLO, SELECCIONAREMOS TRES ESTADIOS CLAVE EN RELACION A LA ZGA (ANTES, DURANTE Y DESPUES) Y GENERAREMOS RNA-SEQ CON MAS PROFUNDIDAD PARA ANALIZAR LOS GENES REGULADOS EN LA ZGA DESDE UNA AMPLIA PERSPECTIVA FILOGENETICA (OBJETIVO 2), ADEMAS, DADO QUE LA ZGA TIENE UN IMPACTO EN OTRAS CAPAS DE LA REGULACION GENOMICA, LAS CUALES APENAS SE HAN ESTUDIADO HASTA AHORA, USAREMOS ESTOS DATOS DE RNA-SEQ DE GRAN PROFUNDIDAD PARA INVESTIGAR, POR PRIMERA VEZ EN LA GRAN MAYORIA DE ORGANISMOS, LOS CAMBIOS QUE SE PRODUCEN EN EL SPLICING ALTERNATIVO (OBJETIVO 3) Y EN LA EXPRESION DE ELEMENTOS GENETICOS MOVILES (OBJETIVO 4) DURANTE LA MZT, EN RESUMEN, LOS RESULTADOS QUE ESPERAMOS OBTENER EN ESTE PROYECTO APORTARAN UNA CANTIDAD DE INFORMACION SIN PRECEDENTES SOBRE LOS TIEMPOS, MODOS Y EVOLUCION DE LA MZT Y LA ZGA, PROCESOS CLAVE PARA EL DESARROLLO TEMPRANO DE LOS ANIMALES, TRANSCRIPTOMICA\EVOLUCION\TRANSICION MATERNO-CIGOTICA\SPLICING ALTERNATIVO\ELEMENTOS GENETICOS MOBILES.

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