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PDC2022-133147-I00

Financiado

OSCAR, AN OBJECT SEGMENTATION, COUNTER, ANALYSIS RESOURCE

JUNTO CON LAS TECNICAS -OMICAS, UNA DE LAS PRINCIPALES REVOLUCIONES CIENTIFICAS EN LOS CAMPOS DE LA BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR SON LOS AVANCES EN MICROSCOPIA. SIMULTANEAMENTE CON ESTA REVOLUCION, HA HABIDO UN CAMBIO EN EL ENFOQU... ver más

01/01/2022

UAM

132K€

Presupuesto del proyecto: 132K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 3182

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2022-01-01

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Participantes

UAM

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID

Total investigadores 3182

Presupuesto del proyecto 132K€

Descripción del proyecto JUNTO CON LAS TECNICAS -OMICAS, UNA DE LAS PRINCIPALES REVOLUCIONES CIENTIFICAS EN LOS CAMPOS DE LA BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR SON LOS AVANCES EN MICROSCOPIA. SIMULTANEAMENTE CON ESTA REVOLUCION, HA HABIDO UN CAMBIO EN EL ENFOQUE DE COMO SE DISEÑAN E IMPLEMENTAN LOS ESTUDIOS BIOLOGICOS. ESTA CLARO QUE LAS CELULAS CULTIVADAS UTILIZANDO SISTEMAS CLASICOS DE CULTIVO DE TEJIDOS 2D NO RESPONDEN A LOS ESTIMULOS DE FORMA SIMILAR A COMO LO HACEN EN SU NICHO BIOLOGICO, Y ESTA DIFERENCIA COMPROMETE FUERTEMENTE LA TRADUCCION DE IN VITRO A IN VIVO. HOY EN DIA, TODAVIA SURGEN MUCHOS ESTUDIOS Y AVANCES POTENCIALES DE LOS ESTUDIOS IN VITRO, PERO LOS CIENTIFICOS ESTAN PASANDO DE ESTE ENFOQUE ALTAMENTE ARTIFICIAL QUE ES EL CULTIVO DE TEJIDOS EN 2D A UNO UN POCO MAS REALISTA: EL CULTIVO DE CELULAS EN 3D.ESTA REVOLUCION 3D DA COMO RESULTADO UNA FORMA MAS REALISTA Y POTENTE DE ESTUDIAR LOS PROCESOS BIOLOGICOS, PERO CON UNA COMPLICACION ADICIONAL: LA OBTENCION DE IMAGENES IN VIVO O IN VITRO DE TEJIDOS TRIDIMENSIONALES GRUESOS NO ES TAN SIMPLE COMO LA OBTENCION DE IMAGENES BIDIMENSIONALES. ADEMAS, LA EXTRACCION DE DATOS CUANTITATIVOS DE IMAGENES DE MUESTRAS BIOLOGICAS ES MUCHO MAS COMPLICADA QUE EN IMAGENES EN DOOS DIMENSIONES, Y INVOLUCRA CONCEPTOS TANTO DE MICROSCOPIA COMO DE COMPUTACION.EN NUESTRO PROYECTO RTI2018-096953-B-I00, PROPUSIMOS CARACTERIZAR LA DINAMICA DE DIFERENCIACION DE LAS CELULAS EN LA RETINA DE VERTEBRADOS, COMO PARTE DE NUESTRA CARACTERIZACION DEL PAPEL DE LA VIA DE SEÑALIZACION DE TGFß EN LA REGULACION DEL EQUILIBRIO ENTRE LA PROLIFERACION Y DIFERENCIACION. BASANDONOS EN LAS LIMITACIONES DE LAS SOLUCIONES DISPONIBLES COMERCIALMENTE PARA LA SEGMENTACION 3D, DISEÑAMOS OSCAR (OBJECT SEGMENTATION, COUNTER AND ANALYSIS RESOURCE), UNA HERRAMIENTA QUE ESTA ESPECIFICAMENTE DISEÑADA PARA TRABAJAR CON IMAGENES DE MUESTRAS BIOLOGICAS DENSAMENTE EMPAQUETADAS CON UNA RELACION SEÑAL-RUIDO REDUCIDA. OSCAR PUEDE TOMAR COMO ENTRADA IMAGENES TRIDIMENSIONALES RECONSTRUIDAS A PARTIR DE SECCIONES 2D CONFOCALES, MICROSCOPIOS DE DISCO GIRATORIO Y DE LAMINA DE LUZ, Y SUPERA A TODAS LAS SOLUCIONES DE SOFTWARE PROBADAS EN LA CUANTIFICACION DE IMAGENES 3D REALISTAS. ESTO ES POSIBLE PORQUE OSCAR PUEDE ELUDIR LOS ERRORES POTENCIALES EN LA SEGMENTACION UTILIZANDO UNA COMBINACION DE ALGORITMOS Y FILTROS QUE ELUDEN LOS ESTOS FALLOS, LO QUE DA COMO RESULTADO UNA CUANTIFICACION MUCHO MAS PRECISA QUE OTRAS SOLUCIONES.SE ESTA PRODUCIENDO UNA TRANSICION DEL 2D AL 3D EN BIOLOGIA Y CREEMOS QUE OSCAR PUEDE POSICIONARSE COMO UNA HERRAMIENTA DE REFERENCIA, DEBIDO A SU SIMPLICIDAD DE USO Y ROBUSTEZ. LA PRESENTE PROPUESTA ESTA DISEÑADA PARA HACER AVANZAR NUESTRA TECNOLOGIA HACIA UN PRODUCTO FINAL MAS LISTO PARA EL MERCADO. NUESTRO TRL ES 4-5, TENEMOS UN MVP QUE ACTUALMENTE ESTA FUNCIONANDO Y HA SIDO PROBADO EN ORGANOIDES, TEJIDOS EN DESARROLLO, MICROTEJIDOS TRIDIMENSIONALES Y CULTIVOS 3D DE CELULAS DE CANCER.EN ESTE PUNTO, CREEMOS SINCERAMENTE QUE LA OBTENCION DE APOYO FINANCIERO NOS PERMITIRA LLEGAR AL MERCADO EN UN PERIODO DE DOS AÑOS. LA PRESENTE CONVOCATORIA COMPETITIVA PRUEBA DE CONCEPTO ENCAJA PERFECTAMENTE, YA QUE ESTA DISEÑADA PARA AYUDAR A AVANZAR IDEAS Y CONCEPTOS HACIA UNA SITUACION LISTA PARA EL MERCADO. PARA ELLO, NOS ENFOCAMOS EN TRES OBJETIVOS PRINCIPALES.1: MEJORAR LA USABILIDAD Y ROBUSTEZ DE OSCAR2: GENERAR INTERFAZ GRAFICA DE USUARIO, VISUALIZACION Y PARALELIZACION3: PLAN DE NEGOCIOS Y HOJA DE RUTA LISTA PARA EL MERCADO.

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