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ORIGEN DE LA ESTRUCTURA 3D DE LA CROMATINA: NUEVAS RESPUESTAS USANDO MICROSCOPIA DE SUPER-RESOLUCION Y ANALISIS DE LAS INTERACCIONES DE LA CROMATINA EN EMBRIONES TOTIPOTENTES
ESTUDIOS RECIENTES HAN MOSTRADO UNA INESPERADA CONEXION ENTRE LA ESTRUCTURA DE LA CROMATINA Y LA ACTIVIDAD GENICA, LA GENERACION DE MAPAS DE INTERACCION DE CROMATINA DE ALTA RESOLUCION HA REVELADO QUE EL GENOMA SE PLIEGA EN DISTIN...
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Descripción del proyecto
ESTUDIOS RECIENTES HAN MOSTRADO UNA INESPERADA CONEXION ENTRE LA ESTRUCTURA DE LA CROMATINA Y LA ACTIVIDAD GENICA, LA GENERACION DE MAPAS DE INTERACCION DE CROMATINA DE ALTA RESOLUCION HA REVELADO QUE EL GENOMA SE PLIEGA EN DISTINTOS MODULOS DE APROXIMADAMENTE UNA MEGABASE DENOMINADOS DOMINIOS DE ASOCIACION TOPOLOGICA (TADS) LA REGULACION DE LOS CUALES PRESENTA UNA RELACION DIRECTA CON LA EXPRESION GENICA, CTCF ES UNA PROTEINA ARQUITECTURAL ALTAMENTE CONSERVADA Y EXPRESADA DE FORMA UBICUA QUE SE ENCUENTRA ENRIQUECIDA EN LOS BORDES DE ESTOS DOMINIOS, SORPRENDENTEMENTE, LA ORGANIZACION DE LOS TAD ES ESTABLE PRACTICAMENTE EN TODOS LOS TIPOS CELULARES Y ESTADIOS DEL DESARROLLO INDEPENDIENTEMENTE DE LA ACTIVIDAD GENICA, Y ADEMAS MUESTRAN UNA ELEVADA CONSERVACION EVOLUTIVA EN SU ESTRUCTURA, DEL MISMO MODO, LA AUSENCIA DE CTCF U OTRAS PROTEINAS ESTRUCTURALES NO CAUSAN UN DESMORONAMIENTO DRAMATICO DE LA ORGANIZACION DEL GENOMA, EN CONJUNTO, ESTAS OBSERVACIONES PLANTEAN LA CUESTION DE CUANDO Y POR QUE EL GENOMA SE ORGANIZA DE ESTA MANERA, Y ASIMISMO, SI LA ESTRUCTURA DE LOS TAD ES NECESARIA ANTES DE LA ACTIVACION DEL GENOMA O SI LA ACTIVIDAD GENICA AYUDA AL ESTABLECIMIENTO DE ESTOS, EN ESTA PROPUESTA, PRETENDEMOS ESTUDIAR CUANDO SE ESTABLECE LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LA CROMATINA Y EL REQUERIMIENTO DE CTCF, DADA LA NATURALEZA RELATIVAMENTE ESTABLE DE LA ORGANIZACION DE LOS TAD, QUEREMOS EXAMINAR ESTE PROCESO EN EL MOMENTO MAS TEMPRANO DEL DESARROLLO CUANDO EL GENOMA EUCARIOTA DIPLOIDE SE FUSIONA PARA GENERAR UN EMBRION DE UNA CELULA TRAS LA FERTILIZACION, PARA ELLO ANALIZAREMOS EMBRIONES DE RATON EN PREIMPLANTACION TANTO SALVAJES COMO MUTANTES CON CTCF DELECIONADO Y, USANDO TECNICAS DE ULTIMA GENERACION COMO EL ANALISIS GENOMICO DE INTERACCIONES DE CROMATINA Y LA MICROSCOPIA DE SUPER-RESOLUCION EXAMINAREMOS EL PROCESO DE ESTRUCTURACION DEL GENOMA DESDE EL CIGOTO DE UNA CELULA HASTA EL BLASTOCISTO TEMPRANO DONDE RESIDEN LAS CELULAS PLURIPOTENTES, GENOMA\CROMATINA\EMBRIÓN\CÉLULAS PLURIPOTENTES\HI-C\MICROSCOPÍA DE SUPER-RESOLUCIÓN\CTCF
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