Descripción del proyecto
LA ARQUITECTURA TRIDIMENSIONAL DEL GENOMA CONTROLA LA MAYORIA DE LOS PROCESOS CELULARES, LA ACTIVACION O REPRESION TRANSCRIPCIONAL A LO LARGO DEL COMPROMISO CELULAR DE GENES ASOCIADOS AL DESARROLLO FRECUENTEMENTE SE LOGRA MEDIANTE INTERACCIONES DE CROMATINA ESPECIFICAS DEL TIPO Y ESTADIO CELULAR, SIN EMBARGO, TODAVIA NO TENEMOS UNA COMPRENSION COMPLETA DE LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE CONTROLAN LA DIFERENCIACION CELULAR, ADEMAS DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION Y LAS MARCAS EPIGENETICAS, ¿QUE RIGE EL HECHO DE QUE ALGUNOS GENES SE EXPRESEN O NO, Y POR LO TANTO DEFINE EL FENOTIPO CELULAR? ¿CUAL ES LA DINAMICA DE LA ORGANIZACION DEL GENOMA A LO LARGO DEL COMPROMISO CELULAR? LA MAYORIA DE LOS POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEOTIDO Y VARIANTES ESTRUCTURALES QUE CONFIEREN SUSCEPTIBILIDAD A ENFERMEDADES, ASI COMO MUTACIONES Y EPIMUTACIONES ASOCIADAS A PATOLOGIAS, SE ENCUENTRAN EN REGIONES NO CODIFICANTES DEL GENOMA, HECHO QUE DIFICULTA SU INTERPRETACION FUNCIONAL, ESPECIFICAMENTE, CON FRECUENCIA SE UBICAN EN REGIONES REGULADORAS Y POTENCIALMENTE EJERCEN SUS FUNCIONES ALTERANDO LA REGULACION DE LOS GENES DIANA QUE ESTAN EN CONTACTO FISICO, POR LO TANTO, LA DESCRIPCION DE LOS REPERTORIOS ESPECIFICOS DE CADA TIPO CELULAR DE SECUENCIAS REGULADORAS QUE CONTROLAN LA ACTIVIDAD DE CADA UNO DE LOS GENES ES NECESARIA PARA COMPRENDER LA CONTRIBUCION DE VARIANTES GENETICAS, MUTACIONES O EPIMUTACIONES NO CODIFICANTES AL DESARROLLO DE LAS ENFERMEDADES, BASANDOME EN DATOS PRELIMINARES GENERADOS POR MI GRUPO DE INVESTIGACION RECIEN ESTABLECIDO, HIPOTETIZO QUE LOS CAMBIOS EN LAS INTERACCIONES DE LA CROMATINA QUE AFECTAN A PROMOTORES GENICOS Y ELEMENTOS REGULADORES DETERMINAN LAS DECISIONES TRANSCRIPCIONALES QUE ASI MISMO GOBIERNAN LA HEMATOPOYESIS EN HUMANOS, POR LO TANTO, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTA PROPUESTA ES DESCRIBIR EL INTERACTOMA DE PROMOTORES, TERMINO REFERIDO A LAS INTERACCIONES DE LA CROMATINA EN LAS QUE PARTICIPAN TODOS LOS PROMOTORES DEL GENOMA, DE CELULAS MADRE HEMATOPOYETICAS Y PROGENITORES COMUNES CON EL FIN DE COMPRENDER LOS MECANISMOS PATOGENICOS ASOCIADOS A VARIANTES GENETICAS, MUTACIONES Y EPIMUTACIONES NO CODIFICANTES EN EL DESARROLLO DE ENFERMEDADES HEMATOLOGICAS, EN PRIMER LUGAR, DESARROLLAREMOS UNA NUEVA METODOLOGIA EXPERIMENTAL Y COMPUTACIONAL PARA DETECTAR EN TIPOS CELULARES POCO ABUNDANTES Y CON UNA RESOLUCION MEJORADA LAS REGIONES EN CONTACTO FISICO CON CADA UNO DE LOS PROMOTORES DEL GENOMA HUMANO, EN SEGUNDO LUGAR, UTILIZANDO ESTA NUEVA METODOLOGIA, DESENTRAÑAREMOS EL CABLEADO DINAMICO QUE CONSTITUYE EL INTERACTOMA DE PROMOTORES EN LA TRANSICION DE CELULAS MADRE HEMATOPOYETICAS A PROGENITORES COMUNES LINFOIDES Y MIELOIDES EN DOS ETAPAS ONTOGENICAS: RECIEN NACIDOS Y ADULTOS, EN TERCER LUGAR, VINCULAREMOS POLIMORFISMOS, MUTACIONES Y EPIMUTACIONES NO CODIFICANTES A SUS GENES DIANA, DESCRIBIENDO LOS GENES Y LAS VIAS DE SEÑALIZACION POTENCIALMENTE ASOCIADOS CON LOS TRASTORNOS SANGUINEOS, EN RESUMEN, ESTE PROYECTO INTERDISCIPLINARIO PROPORCIONARA UN CONOCIMIENTO SIN PRECEDENTES EN NUESTRA COMPRENSION DE LA HEMATOPOYESIS HUMANA CON UN TREMENDO IMPACTO EN LA MEDICINA REGENERATIVA Y LAS NEOPLASIAS SANGUINEAS, HEMATOPOIESIS\ARQUITECTURA TRIDIMENSIONAL GENÓMICA\POTENCIADORES\SNPS/MUTACIONES NO CODIFICANTES\CÁNCER