Descripción del proyecto
LA MEDICINA TRASLACIONAL ES UN ESFUERZO EMERGENTE EN LA PRACTICA MEDICA QUE BUSCA TRASLADAR LOS DESCUBRIMIENTOS CIENTIFICOS DESDE LOS LABORATORIOS A LA PRACTICA CLINICA PARA EL DIAGNOSTICO Y TRATAMIENTO DE LOS PACIENTES (CONOCIDO EN INGLES CON LA EXPRESION ¿BENCH-TO-BEDSIDE), EL CAMBIO DE PERSPECTIVA SE HA PRODUCIDO RECIENTEMENTE COMO RESULTADO DE LA REVOLUCION GENOMICA Y BIOINFORMATICA, SIN EMBARGO, ESA MISMA REVOLUCION HA VENIDO ACOMPAÑADA DE UN GRAVE PROBLEMA: LA GENERACION DE GRAN CANTIDAD DE INFORMACION QUE ESTA PRODUCIENDO UN IMPORTANTE CUELLO DE BOTELLA EN LA INVESTIGACION MEDICA Y SU APLICACION, ESTA INFORMACION SE ENCUENTRA TANTO EN FORMATO ESTRUCTURADO, FUNDAMENTALMENTE RELACIONADA CON LAS INVESTIGACIONES EN BIOLOGIA MOLECULAR, COMO TEXTO, PROCEDENTE DE RESULTADOS DE INVESTIGACION, LA FINALIDAD DE ESTA PROPUESTA ES MEJORAR EL PROCESO DE BUSQUEDA DE DOCUMENTACION CIENTIFICA Y PROPONER NUEVOS METODOS DE PRESENTACION DE LA INFORMACION QUE FACILITEN LA COMPRENSION DE LA MISMA EN EL DOMINIO BIOMEDICO, LA APROXIMACION QUE SE PROPONE ES UTILIZAR TECNICAS DE MINERIA DE TEXTO APLICADAS A DOCUMENTACION CIENTIFICA E HISTORIALES MEDICOS DE PACIENTES, EN COLABORACION CON LOS OTROS DOS SUBPROYECTOS, MEDICAL-BENCH Y MEDICAL-TD-MINER, PROPONEMOS UNA SOLUCION INTEGRAL DE MINERIA DE TEXTO Y DATOS PARA DESCUBRIR NUEVO CONOCIMIENTO Y, ADEMAS, SER CAPAZ DE ENCONTRAR EXPLICACIONES A LOS RESULTADOS OBTENIDOS, EN DEFINITIVA, GENERAR UN CONJUNTO DE HERRAMIENTAS UTILES QUE FACILITE A LOS MEDICOS LLEVAR A CABO UNA MEDICINA TRASLACIONAL, LAS TECNICAS DE MINERIA DE TEXTO QUE SE EXPLORARAN SON LA GENERACION AUTOMATICA DE RESUMENES DE TEXTO, EL RECONOCIMIENTO DE ENTIDADES CON NOMBRE (REN) Y LA DETECCION DE LA NEGACION, RESPECTO A LA GENERACION DE RESUMENES, SE PRETENDE AVANZAR EN LA EFECTIVIDAD ALCANZADA EN TRABAJOS ANTERIORES EN LA GENERACION DE RESUMENES MONO Y MULTIDOCUMENTO EN TEXTOS DEL DOMINIO DE LA BIOMEDICINA, PROPONEMOS UNA METODOLOGIA DE GENERACION AUTOMATICA DE RESUMENES BASADA EN CONOCIMIENTO ESTRUCTURADO (UMLS) Y GRAFOS PARA REPRESENTAR LOS CONCEPTOS Y LAS RELACIONES SEMANTICAS ENTRE ELLOS, PARA EL REN INTEGRAREMOS LA INGENIERIA DE ATRIBUTOS CON TECNICAS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO Y LA UTILIZACION DE ONTOLOGIAS Y OTROS RECURSOS LEXICOS, FINALMENTE, PARA LA DETECCION DE LA NEGACION, NUESTRO OBJETIVO ES MEJORAR LOS RESULTADOS OBTENIDOS POR LOS SISTEMAS BASADOS EN EXPRESIONES REGULARES, QUE SON EL FUNDAMENTO DE LOS SISTEMAS ACTUALES, NUESTRA PROPUESTA SE BASA EN LA UTILIZACION DEL BIOSCOPE CORPUS PARA, APLICANDO APRENDIZAJE AUTOMATICO Y RECURSOS LEXICOS (UMLS), CONSTRUIR UN CLASIFICADOR CAPAZ DE IDENTIFICAR LAS NEGACIONES Y LOS CONCEPTOS NEGADOS, TODAS ESTAS TECNICAS SE APLICARAN TANTO AL INGLES COMO AL ESPAÑOL, MINERIA DE TEXTO\ACCESO A LA INFORMACION\RECUPERACION DE INFORMACION\PROCESAMIENTO DEL LENGUAJE NATURAL\GENERACION DE RESUMENES\RECONOCIMIENTO DE ENTIDADES CON NOMBRE\IDENTIFICACION DE LA NEGACION\DOMINIO BIOMEDICO\MEDICINA TRASLACIONAL