Descripción del proyecto
LA EFICIENCIA ALIMENTARIA Y LA ROBUSTEZ SON CARACTERES CLAVE PARA LA SOSTENIBILIDAD DE LOS SISTEMAS DE PRODUCCION PORCINA, LA MICROBIOTA GASTROINTESTINAL ES UN ECOSISTEMA COMPLEJO QUE INTERACTUA SIMBIOTICAMENTE CON EL HUESPED, Y AFECTA ENTRE OTROS ASPECTOS EL DESARROLLO DEL SISTEMA IMMUNITARIO, LA EFICIENCIA ALIMENTARIA Y EL COMPORTAMIENTO DE LOS ANIMALES, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTA PROPUESTA ES INTEGRAR DATOS DEL MICROBIOMA CON INFORMACION OMICA Y FENOTIPICA PARA LA PREDICCION MOLECULAR DE LA EFICIENCIA Y LA ROBUSTEZ EN PORCINO, CENTRANDOSE EN CARACTERES DE EFICIENCIA ALIMENTARIA, IMMUNIDAD INNATA, COMPORTAMIENTO Y RESPUESTA AL ESTRES, EL PROYECTO ADEMAS PRETENDE ESTUDIAR LA BASE GENETICA DE LA VARIACION DEL MICROBIOMA INTESTINAL, ANALIZAR LA INTERACCION DEL MICROBIOMA CON LA GENETICA DEL HUESPED Y CON LOS CARACTERES ESTUDIADOS, E IDENTIFICAR PREDICTORES Y POTENCIALES BIOMARCADORES MICROBIANOS ASOCIADOS CON ESTOS FENOTIPOS, PARA ABORDAR ESTOS OBJETIVOS, SE GENERARAN DATOS DE LA MICROBIOTA INTESTINAL DE 600 INDIVIDUOS PERTENECIENTES A PROYECTOS ACTUALMENTE EN EJECUCION, EN EL MARCO DE LOS CUALES SE HAN REGISTRADO NUMEROSOS FENOTIPOS DE EFICIENCIA ALIMENTARIA, IMMUNIDAD INNATA E INDICADORES DE ESTRES, ASIMISMO SE REALIZARA UN ENSAYO CON 240 ANIMALES PARA OBTENER INFORMACION SOBRE EL COMPORTAMIENTO SOCIAL Y LA RESPUESTA AL ESTRES JUNTAMENTE CON LOS CARACTERES DE EFICIENCIA ALIMENTARIA Y CAPACIDAD IMMUNE; DE ESTOS ANIMALES SE ANALIZARA TAMBIEN LA MICROBIOTA Y SE REALIZARA UN GENOTIPADO MASIVO, LA CARACTERIZACION DE LA MICROBIOTA INTESTINAL SE REALIZARA MEDIANTE SECUENCIACION DE LOS GENES RIBOSOMICOS 16S, INICIALMENTE SE ESTIMARAN LOS PARAMETROS GENETICOS DE LA MICROBIOTA INTESTINAL DE ESTOS ANIMALES, POSTERIORMENTE SE REALIZARAN ESTUDIOS DE ASOCIACION MASIVOS Y MAPEO FINO DE QTLS PARA IDENTIFICAR REGIONES DEL GENOMA Y GENES CANDIDATOS ASOCIADOS CON LA VARIACION INDIVIDUAL EN LA ABUNDANCIA DE LA MICROBIOTA, FINALMENTE, CON EL OBJETIVO DE INTEGRAR LOS DIFERENTES TIPOS DE DATOS (COMPOSICION DE LA MICROBIOTA, GENOMICA Y FENOTIPICA) SE IMPLEMENTARA UN ENFOQUE HOLISTICO MEDIANTE LA COMBINACION DE ANALISIS MULTIVARIANTES Y DE REDES DE INTERACCION MICROBIANA, LOS RESULTADOS GENERADOS REPRESENTARAN UN IMPORTANTE AVANCE EN EL CONOCIMIENTO SOBRE LAS BASES GENETICAS DE LA COMPOSICION DE LA MICROBIOTA Y SU CONTRIBUCION EN LA DETERMINACION DE EFICIENCIA ALIMENTARIA, LA ROBUSTEZ Y EL COMPORTAMIENTO EN CERDOS, CABE SEÑALAR ADEMAS QUE LAS METODOLOGIAS Y HERRAMIENTAS DE INTEGRACION DE DATOS GENERADAS EN EL PROYECTO PODRIAN SER APLICADAS A OTRAS ESPECIES ANIMALES CON OBJETIVOS SIMILARES, PORCINO\ROBUSTEZ\EFICIENCIA ALIMENTICIA\MICROBIOTA\BIOLOGÍA DE SISTEMAS\BIOLOGÍA COMPUTACIONAL\BIENESTAR ANIMAL