METRES (METABOLIC RECONSTRUCTION SERVER DESARROLLO Y APLICACION EN EN ESTUDIO DE...
METRES (METABOLIC RECONSTRUCTION SERVER DESARROLLO Y APLICACION EN EN ESTUDIO DE PRINCIPIOS DE DISEÑO BIOLOGICO
UNO DE LOS PRINCIPALES OBJETIVOS/PROBLEMAS A LOS QUE HOY AFRONTA LA BIOLOGIA DE SISTEMAS ES EL HALLAZGO DE PRINCIPIOS DE DISEÑO EN CIRCUITOS MOLECULARES Y CELULARES, ESTOS PRINCIPIOS RELACIONAN LA SELECCION NATURAL DE LOS CIRCUITO...
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Descripción del proyecto
UNO DE LOS PRINCIPALES OBJETIVOS/PROBLEMAS A LOS QUE HOY AFRONTA LA BIOLOGIA DE SISTEMAS ES EL HALLAZGO DE PRINCIPIOS DE DISEÑO EN CIRCUITOS MOLECULARES Y CELULARES, ESTOS PRINCIPIOS RELACIONAN LA SELECCION NATURAL DE LOS CIRCUITOS CON SU EFECTO EN LA ¿FITNESS¿ DE UN ORGANISMO, ESTA RELACION PERMITE ENTENDER PORQUE LA SELECCION NATURAL HA RESULTADO EN QUE CIRCUITOS UN POCO DISTINTO ENTRE SI CUMPLAN LA MISMA FUNCION EN ORGANISMOS DIFERENTES, ADEMAS, EL CONOCIMIENTO DE LOS PRINCIPIOS DE DISEÑO PERMITE CONSTRUIR CIRCUITOS BIOLOGICOS ARTIFICIALES DIRIGIDOS A OBTENER UN DETERMINADO TIPO DE COMPORTAMIENTO, SIN EMBARGO, LA IDENTIFICACION DE PRINCIPIOS DE DISEÑO EN CIRCUITOS BIOLOGICOS REQUIERE EN PRIMER LUGAR EL ESTUDIO PORMENORIZADO DE SU FUNCIONAMIENTO, SE VERIFICO QUE, EN MEDIA, EL 20% DEL GENOMA ESTA CONSTITUIDO POR GENES DE FUNCION DESCONOCIDA [DATOS PROPIOS, ANALISIS DE 1006 GENOMAS], ESTO IMPLICA QUE EXISTE UNA CANTIDAD CONSIDERABLE DE CIRCUITOS BIOLOGICOS PRACTICAMENTE DESCONOCIDOS A NIVEL MOLECULAR Y DE LOS QUE TENEMOS ESCASA INFORMACION, ASI, ANTES DE ESTUDIAR LOS PRINCIPIOS DE DISEÑO DE UN CIRCUITO POCO CONOCIDO, ES NECESARIO RECONSTRUIRLO, POR CONSIGUIENTE, ANTES DE INVESTIGAR PRINCIPIOS DE DISEÑO DE CIRCUITOS MOLECULARES, OTRO DE LOS PROBLEMAS PUNTEROS DE LA BIOLOGIA DE SISTEMAS ES LA RECONSTRUCCION DE DICHOS CIRCUITOS CUANDO SON POCO CONOCIDOS, A PARTIR DE DATOS DE DIFERENTES TIPOS, CON ORIGENES DIVERSOS Y DE CALIDAD VARIABLE,EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES CONTRIBUIR CON NUEVAS PROPUESTAS A LA SOLUCION DE LOS DOS PROBLEMAS DESCRITOS ANTERIORMENTE, POR UN LADO SE PRETENDE CONTINUAR EL DESARROLLO DE UN CONJUNTO DE METODOLOGIAS IN SILICO PARA INTEGRAR DATOS DE DISTINTAS FUENTES Y TIPOS, DE MODO QUE PERMITAN LA RECONSTRUCCION SISTEMICA DE REDES MOLECULARES IMPLICADAS EN LA EJECUCION Y REGULACION DE PROCESOS BIOLOGICOS POCO CARACTERIZADOS A NIVEL MOLECULAR, POR OTRO LADO, SE PRETENDE APLICAR ESTAS METODOLOGIAS PARA IDENTIFICAR TOPOLOGIAS ALTERNATIVAS DE UNOS CIRCUITOS MOLECULARES POCO CONOCIDOS, QUE EJECUTAN Y REGULAN LA BIOSINTESIS DE CENTROS FE-S EN DIFERENTES ORGANISMOS, ADEMAS, SE PRETENDE ENTENDER ALGUNOS DE LOS PRINCIPIOS DE DISEÑO BIOLOGICO A LOS QUE OBEDECEN ESTOS CIRCUITOS,
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