Descripción del proyecto
EL PROYECTO SAMANTHA CONTRIBUIRA CON NUEVAS METODOLOGIAS EN ANALISIS DE SUPERVIVENCIA, ENSAYOS CLINICOS, DATOS MULTI-OMICOS Y ANALISIS INTEGRATIVO DE DATOS CLINICOS Y OMICOS Y DESARROLLARA HERRAMIENTAS INFORMATICAS DE LIBRE ACCESO, MEDIANTE LA COLABORACION INTERDISCIPLINAR CON FIGHT AIDS FOUNDATION, AIDS RESEARCH INSTITUTE Y VALL DHEBRON RESEARCH INSTITUTE, ENTRE OTROS, NUESTROS RESULTADOS SE MATERIALIZARAN EN SOLUCIONES BIOESTADISTICAS Y BIOINFORMATICAS A PROBLEMAS RELEVANTES EN LAS SIGUIENTES AREAS: VIH-SIDA, CANCER, NEUROCIENCIA Y CIENCIAS DEL DEPORTE, ESTAS ACCIONES ABORDAN DIRECTAMENTE LAS PRIORIDADES ESTABLECIDAS EN RETO 1: SALUD, CAMBIO DEMOGRAFICO Y BIENESTAR, PLANTEAMOS AVANCES METODOLOGICOS PARA DATOS DE TIEMPO A UN EVENTO, ABARCANDO DESDE LA INVESTIGACION FUNDAMENTAL SOBRE LAS BASES TEORICAS DE LA CENSURA EN UN INTERVALO HASTA INVESTIGACIONES MAS APLICADAS, COMO LA ESTIMACION DE LA FUNCION DE SUPERVIVENCIA PARA TIEMPOS TRUNCADOS POR LA IZQUIERDA Y CENSURADOS POR LA DERECHA CUANDO EL INICIO ESTA CENSURADO EN UN INTERVALO; DESARROLLO DE PROCEDIMIENTOS Y HERRAMIENTAS DE BONDAD DE AJUSTE PARA DATOS CENSURADOS EN UN INTERVALO; ESTUDIO DE MODELOS BIDIRECCIONALES MULTIESTADO; PRUEBAS QUE COMBINEN SUPERVIVENCIA Y DATOS BINARIOS CONSIDERANDO LA POSIBLE CORRELACION ENTRE ELLOS; EXTENSION DE LA METRICA AÑOS-DE-VIDA-PERDIDOS TENIENDO EN CUENTA CONDICIONES CAMBIANTES EN EL TIEMPO Y ACOMODANDO POSIBLES FACTORES DE CONFUSION, CONTINUAREMOS NUESTRA INVESTIGACION SOBRE VARIABLES COMPUESTAS DESARROLLANDO NUEVAS FORMULAS PARA CALCULAR EL TAMAÑO MUESTRAL CUANDO LOS RIESGOS NO SON PROPORCIONALES, AGREGANDO NUEVAS CARACTERISTICAS AL WEB-APP COMPARE Y PROPONIENDO UNA NUEVA MEDIDA ARE PARA COMPARAR LA EFICIENCIA DE POSIBLES DISEÑOS PARA ENSAYOS CLINICOS, UN TEMA MUY IMPORTANTE PARA LA INDUSTRIA FARMACEUTICA ES LA PLANIFICACION DE ENSAYOS DE BIOEQUIVALENCIA (BE), NUESTRO OBJETIVO ES DESARROLLAR UN NUEVO ENFOQUE PARA CONTROLAR EL ERROR DE TIPO I AL ESCALAR LOS METODOS DE BE PARA MEDICAMENTOS ALTAMENTE VARIABLES Y BAJO AMPLIAS CLASES DE DISEÑOS ADAPTATIVOS, TAMBIEN NOS PROPONEMOS MEDIR LA HETEROGENEIDAD EN ENSAYOS CLINICOS ALEATORIZADOS CON EL OBJETIVO DE MEJORAR LAS GUIAS DE PUBLICACION, SE DESARROLLARAN NUEVOS METODOS PARA EL ANALISIS DE MEDIACION TENIENDO EN CUENTA LA NO LINEALIDAD DEL MODELO DE RIESGOS PROPORCIONALES,INVESTIGAREMOS COMO EXTENDER LOS RESULTADOS DE FACTORIZACIONES MATRICIALES Y TENSORIALES INCOMPLETA A DATOS CON ESTRUCTURA DE BLOQUES FALTANTES, DONDE ALGUNAS FUENTES DE DATOS NO HAN SIDO OBSERVADAS PARA CIERTOS GRUPOS DE MUESTRAS, EXTENDEREMOS NUESTROS RESULTADOS SOBRE ANALISIS DE LISTAS DE GENES A OTRAS DISTANCIAS Y OTRAS ONTOLOGIAS, ESTO SE APLICARA PARA OBTENER NUEVOS METODOS PARA ENLAZAR Y COMBINAR CONJUNTOS DE DATOS MULTI-OMICOS UTILIZANDO ANOTACIONES BIOLOGICAS, SE UTILIZARA APRENDIZAJE PROFUNDO PARA INTEGRAR IMAGENES RADIOLOGICAS DEL PROYECTO GTEX DESCUBRIENDO PRIMERO LAS CORRELACIONES CRUZADAS DE LOS DATOS Y CONSTRUYENDO DESPUES UNA FIRMA HISTOPATOLOGICA A NIVEL DE IMAGEN, DESARROLLAREMOS METODOS PARA ANALISIS DEL MICROBIOMA ADAPTANDO LA REGRESION KERNEL MACHINE Y/O LA REGRESION PENALIZADA TENIENDO EN CUENTA LA ESTRUCTURA COMPOSICIONAL DEL MICROBIOMA, SE CREARA UNA PLATAFORMA PARA LA GESTION Y ANALISIS DE DATOS MULTIMODALES PARA ADMINISTRAR DIFERENTES TIPOS DE DATOS Y ANALIZARLOS UTILIZANDO FLUJOS DE TRABAJO, EN GALAXY, COMBINANDO SOFTWARE ESTANDAR CON LO QUE SE HA DESARROLLADO EN ESTE PROYECTO, EFICIENCIA RELATIVA ASINTOTICA\ENSAYOS DE BIOEQUIVALENCIA\ANOTACIONES BIOLOGICAS\ENSAYOS CLINICOS\ANALISIS INTEGRATIVO DE DATOS OMICOS\CENSURA POR INTERVALO\MODELOS MULTIESTADO\ESTADISTICA MULTIVARIANTE\ANALISIS DE SUPERVIVENCIA