Descripción del proyecto
GENCLINLAB ES UNA PROPUESTA COORDINADA ALTAMENTE INTERDISCIPLINAR QUE DESARROLLARA MECANISMOS PARA LA GESTION SEGURA Y EFICIENTE DE LA INFORMACION GENOMICA ADAPTADA A LOS LABORATORIOS CLINICOS. ESTE PROYECTO SURGE DE TRES ESCENARIOS CRITICOS IDENTIFICADOS DENTRO DE UN LABORATORIO CLINICO: EL CASO INTRA-ANALISIS, QUE CONSIDERA UNA MUESTRA DE DATOS GENOMICOS DE UN SOLO PACIENTE; EL INTRA-LABORATORIO, QUE CONSIDERA MULTIPLES MUESTRAS GENERADAS DENTRO DEL LABORATORIO; Y EL CASO INTERLABORATORIO, QUE CONSIDERA EL ANALISIS CONJUNTO DE MULTIPLES MUESTRAS GENERADAS EN DIFERENTES LABORATORIOS. POR LO TANTO, PARA MEJORAR LA FORMA EN QUE LOS LABORATORIOS CLINICOS MANEJAN LOS DATOS EN ESTOS TRES ESCENARIOS, NUESTRA HIPOTESIS CENTRAL ES QUE LOS DATOS GENOMICOS DE GRAN TAMAÑO SE PUEDEN REPRESENTAR DE MANERA EFICIENTE Y SEGURA UTILIZANDO METODOS ESTANDARIZADOS. DADO QUE LOS ESTANDARES PERMITEN UN SOPORTE A LARGO PLAZO Y UN ECOSISTEMA QUE PROMUEVE LA COMPETENCIA Y LA INTER-OPERACION ENTRE DIFERENTES SOLUCIONES, LAS SOLUCIONES PROPUESTAS SE BASARAN EN ESTANDARES Y, POR LO TANTO, SE CONTRIBUIRA A NUEVOS ESTANDARES CUANDO SEA APROPIADO. ESTO PRODUCIRA UNA SOLUCION IMPLEMENTABLE QUE SERA COMPATIBLE CON LOS DIVERSOS ESTANDARES QUE YA EXISTEN O QUE ESTAN ACTUALMENTE EN DESARROLLO.EN CONCRETO, EN ESTE SUBPROYECTO (GENCLINLAB-TRA) SE PONDRA A PRUEBA EL SISTEMA DESARROLLADO DENTRO DEL PROYECTO COORDINADO EN EL ENTORNO CLINICO DE LA CLINICA UNIVERSIDAD DE NAVARRA. EL OBJETIVO ES INTEGRAR LAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS DESARROLLADAS EN LOS OTROS DOS SUBPROYECTOS EN LOS PROCESOS CLINICOS ACTUALMENTE UTILIZADOS, Y PROBAR LAS NUEVAS CARACTERISTICAS DESARROLLADAS EN LOS TRES ESCENARIOS MENCIONADOS ANTERIORMENTE. ADEMAS, OBTENDREMOS COMENTARIOS DE PRIMERA MANO DE LOS MEDICOS, TALES COMO: UTILIDAD DEL SISTEMA, CARACTERISTICAS QUE FALTAN, FACILIDAD DE USO, ETC. LES PROPORCIONAREMOS INSTRUCCIONES DETALLADAS SOBRE COMO UTILIZAR LAS DIFERENTES FUNCIONES.EN RESUMEN:1) PROBAREMOS LOS MECANISMOS DE SEGURIDAD DE LA INFORMACION GENOMICA;2) PROBAREMOS LOS MECANISMOS DE COMPRESION PARA EL MANEJO EFICIENTE DE ARCHIVOS GENOMICOS; Y3) RECOPILAR COMENTARIOS VALIOSOS DE LOS MEDICOS Y TRANSMITIRLOS A LOS OTROS DOS SUBPROYECTOS.DEBIDO A SU CARACTER ALTAMENTE INTERDISCIPLINAR, EL EQUIPO DE ESTE SUBPROYECTO ESTA COMPUESTO POR INVESTIGADORES CON UNA SOLIDA FORMACION Y CONOCIMIENTOS COMPLEMENTARIOS: DESDE BIOLOGOS COMPUTACIONALES HASTA GENETISTAS. ENOMICA\SECUENCIACION MASIVA (NGS)\COMPRESION\GA4GH\ISO\ESTANDARIZACION\PRIVACIDAD\SEGURIDAD\LABORATORIOS CLINICOS\SALUD