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SAF2017-89450-R

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MAS ALLA DE LA IDENTIFICACION Y CLASIFICACION DE VARIACIONES ESTRUCTURALES EN TU...

MAS ALLA DE LA IDENTIFICACION Y CLASIFICACION DE VARIACIONES ESTRUCTURALES EN TUMORES: NUEVAS APROXIMACIONES Y LA TRASLACION A LA CLINICA EL PRESENTE PROYECTO CONTRIBUYE AL CAMPO DE LA GENOMICA DEL CANCER, A TRAVES DEL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA EL ANALISIS DE GENOMAS, Y DE ESTUDIAR CUESTIONES CONCRETAS RELACIONADAS CON LA APARICION Y LA PROGRES... ver más

01/01/2017

BARCELONA SUPERCOM...

121K€

Presupuesto del proyecto: 121K€

Líder del proyecto

BARCELONA SUPERCOMPUTING CENTERCENTRO NACIONA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 118M€

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Líder del proyecto

BARCELONA SUPERCOMPUTING CENTERCENTRO NACIONA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 118M€

Presupuesto del proyecto 121K€

Descripción del proyecto EL PRESENTE PROYECTO CONTRIBUYE AL CAMPO DE LA GENOMICA DEL CANCER, A TRAVES DEL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA EL ANALISIS DE GENOMAS, Y DE ESTUDIAR CUESTIONES CONCRETAS RELACIONADAS CON LA APARICION Y LA PROGRESION DE TUMORES, NUESTRA PROPUESTA CONSTITUYE UNA CONTINUACION NATURAL DE LOS RESULTADOS Y LAS ACTIVIDADES REALIZADAS DENTRO DEL PROYECTO NACIONAL PREVIO (TODAVIA EN CURSO HAS EL FINAL DEL 2017), ESTOS RESULTADOS, Y LOS NUEVOS OBJETIVOS, SE ENMARCAN EN NUESTRO INTERES POR LA IDENTIFICACION Y EL ESTUDIO DE LA VARIACION ESTRUCTURAL ASOCIADA AL GENOMA DE TUMOR, DES DE UN PUNTO DE VISTA GENOMICO Y DE SUS IMPLICACIONES FUNCIONALES Y CLINICAS, LA PRESENTE PROPUESTA CONSTA DE TRES SUB-PROYECTOS RELACIONADOS: (1) COMO CONTINUACION DE NUESTRO RECIENTE ESTUDIO DE DELECIONES SOMATICAS ASOCIADAS A LA EXPRESION DEL GEN PGBD5 EN CANCER PEDIATRICO (HENSSEN ET AL, NATURE GENETICS 2017), NOS PROPONEMOS EXPANDIR ESTE ANALISIS A LOS 2800 GENOMAS DE DIFERENTES TIPOS DE GENOMAS, INCLUIDOS EN EL PROYECTO ICGC-PANCANCER, DEL CUAL FORMAMOS PARTE ACTIVA, RESULTADOS PRELIMINARES SUGIEREN QUE EXISTEN DIFERENTES TIPOS DE DELECIONES, CON DIFERENTES MOTIVOS ASOCIADOS Y CON DIFERENTES NIVELES DE REINCIDENCIA ENTRE TIPOS DE TUMOR, NUESTRA PROPUESTA CONSISTE EN HACER UN ESTUDIO COMPLETO DE LOS DIFERENTES TIPOS DE DELECIONES SOMATICAS USANDO INFORMACION GENOMICA, ASI COMO INTERPRETACIONES FUNCIONALES, ADEMAS, (2) SIGUIENDO EL ESTUDIO DE VARIACION ESTRUCTURAL QUE REALIZAMOS EN EL CONTEXTO DEL CONSORCIO ICGC-CLL (PUENTE ET AL, NATURE 2017), NOS PROPONEMOS BUSCAR PATRONES DE REORDENACION CROMOSOMICA EN GENOMAS DE ICGC-PANCANCER USANDO TECNICAS DE MACHINELEARNING EN COLABORACION CON EL DEPARTAMENTO DE COMPUTER SCIENCE DEL BSC, EN PARALELO, TAMBIEN NOS DISPONEMOS A CARACTERIZAR EXHAUSTIVAMENTE UN PATRON CONCRETO DE TRANSLOCACION CROMOSOMICA QUE IDENTIFICAMOS INICIALMENTE EN CLL Y QUE ES CONSISTENTE CON CONFIGURACIONES CONCRETAS DE LA CROMATINA, NUESTRO OBJETIVO ES CARACTERIZAR ESTE PATRON, ASI COMO LOS QUE PODAMOS IDENTIFICAR DE NUEVO, A NIVEL DE GENOMA Y DE SUS IMPLICACIONES FUNCIONALES Y CLINICAS, MAS ALLA DE ESTOS ESTUDIOS, NUESTRO TERCER OBJETIVO (3) CONSISTE EN EL DESARROLLO DE UNA PLATAFORMA COMPUTACIONAL PARA EL ANALISIS GENOMICO EN UN ENTORNO CLINICO, PROPONEMOS COMBINAR ESTA INICIATIVA CON UNA EXISTENTE DE LA QUE FORMAMOS PARTE Y QUE CONSISTE EN EL DESARROLLO DE LA METODOLOGIA NECESARIA PARA LA TRANSLACION DE LOS ANALISIS GENOMICOS A LA CLINICA PARA LA TOMA DE DECISIONES EN LOS TRATAMIENTOS DE PACIENTES ONCOLOGICOS, LOS RESULTADOS ESPERADOS EN ESTE PROYECTO PUEDEN TENER UN GRAN IMPACTO EN LA COMPRENSION DE LOS PROCESOS GENOMICOS RELACIONADOS CON CANCER, ASI COMO EN EL CONTEXTO DEL SISTEMA SANITARIO GENÓMICA COMPUTACIONAL\MEDICINA PERSONALIZADA Y DE PRECISIÓN

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