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PID2021-128956NB-I00

Financiado

MAPAS GENETICOS Y EPIGENETICOS A LO LARGO DE LA FILOGENIA EUCARIOTA

DURANTE LOS PROXIMOS DIEZ AÑOS, SE SECUENCIARA EL GENOMA DE APROXIMADAMENTE 1,8 MILLONES DE ESPECIES EUCARIOTAS. ESTOS DATOS PROPORCIONARAN UNA VISION SIN PRECEDENTES DE LA VIDA Y SU HISTORIA SOBRE LA TIERRA, Y CONTRIBUIRAN A CARA... ver más

01/01/2021

FUNDACIO PRIVADA C...

351K€

Presupuesto del proyecto: 351K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

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Participantes

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE R...

Lider

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 351K€

Descripción del proyecto DURANTE LOS PROXIMOS DIEZ AÑOS, SE SECUENCIARA EL GENOMA DE APROXIMADAMENTE 1,8 MILLONES DE ESPECIES EUCARIOTAS. ESTOS DATOS PROPORCIONARAN UNA VISION SIN PRECEDENTES DE LA VIDA Y SU HISTORIA SOBRE LA TIERRA, Y CONTRIBUIRAN A CARACTERIZAR LOS PRINCIPIOS GENERALES SUBYACENTES A LOS PROCESOS BIOLOGICOS FUNDAMENTALES. EL PRIMER PASO PARA RELACIONAR LA SECUENCIA DE UN GENOMA CON LA BIOLOGIA DE LA ESPECIE, ES IDENTIFICAR LOS GENES CODIFICADOS EN ESE GENOMA. DADA LA COMPLEJIDAD TRANSCRIPCIONAL DE LOS GENOMAS EUCARIOTAS, ESTA ES UNA TAREA DIFICIL, Y AUN SE DESCONOCE HOY EN DIA, EL NUMERO EXACTO DE GENES HUMANOS. ADEMAS, LOS RECURSOS NECESARIOS PARA PRODUCIR ANOTACIONES DE ALTA CALIDAD, COMO LAS QUE EXISTEN PARA EL GENOMA HUMANO Y DE OTRAS ESPECIES, DIFICILMENTE VAN A ESTAR DISPONIBLES PARA LA MAYORIA DE LAS ESPECIES EUCARIOTAS. SIN EMBARGO, INVESTIGACIONES RECIENTES SUGIEREN QUE LA MAYOR PARTE DE LA BIOLOGIA DE UNA DETERMINADA ESPECIE ES CAPTURADA POR LA ISOFORMA PRINCIPAL DE LOS GENES QUE CODIFICAN PARA PROTEINAS; UNA PEQUEÑA FRACCION (MENOS DEL 8% EN HUMANOS) DE TODOS LOS TRANSCRITOS CODIFICADOS EN UN GENOMA. EN CONSECUENCIA, EL PRIMER OBJETIVO DE NUESTRA PROPUESTA ES DESARROLLAR METODOS COMPUTACIONALES EFICIENTES PARA IDENTIFICAR LA PRINCIPAL ISOFORMA DE TODOS LOS GENES EUCARIOTAS QUE CODIFICAN PARA PROTEINAS. PLANEAMOS DESARROLLAR METODOS INNOVADORES PARA PREDECIR GENES CON UNA PRECISION COMPARABLE A LA DE OTROS METODOS EXISTENTES, PERO ORDENES DE MAGNITUD MAS RAPIDOS, DE MANERA QUE PUEDAN ENFRENTARSE EFICAZMENTE A LA TAREA DE ANOTAR 1.8 MILLONES DE GENOMAS. ADEMAS, EMPLEAREMOS METODOS DE RNASEQ DE TRANSCRITOS LARGOS QUE HEMOS DESARROLLADO RECIENTEMENTE, PARA PRODUCIR UNA ANOTACION EXHAUSTIVA EN UNAS POCAS ESPECIES EN TAXONES ESTRATEGICAMENTE SITUADOS, LA CUAL SERA POSTERIORMENTE PROPAGADA A ESPECIES CERCANAS. EL CONJUNTO DE LOS GENOMAS EUCARIOTAS Y DE SUS ANOTACIONES, CONSTITUIRA UN RECURSO SIN PRECEDENTES, QUE PERMITIRA INVESTIGAR LOS FENOMENOS BIOLOGICOS DESDE UN ANGULO EVOLUTIVO PRIVILEGIADO. ENTRE ESTOS FENOMENOS, NUESTRO GRUPO SE HA CENTRADO ULTIMAMENTE EN LA INVESTIGACION DEL PAPEL DE LA CROMATINA EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA. CON ESE FIN, ESTAMOS DESARROLLANDO UN PROTOCOLO DE CHIPSEQ APLICABLE A MINIMAS CANTIDADES DE MATERIAL BIOLOGICO. EN BASE A ESTE DESARROLLO, EL SEGUNDO OBJETIVO DE NUESTRA PROPUESTA CONSISTE EN PRODUCIR MAPAS GENOMICOS DE MODIFICACIONES DE HISTONAS EN LAS ESPECIES FILOESTRATEGICAS SELECCIONADAS ANTERIORMENTE. ESTOS DATOS CONSTITUIRAN UN RECURSO UNICO PARA INVESTIGAR EL PAPEL DE LA CROMATINA EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA. NUESTRO OBJETIVO ES DESARROLLAR MODELOS GENERALES SOBRE LA RELACION ENTRE EL EPIGENOMA Y EL TRANSCRIPTOMA DURANTE LA EVOLUCION DE LOS METAZOOS. MAS ALLA DE SU INTERES CIENTIFICO INTRINSECO, LA CARACTERIZACION DE LA DIVERSIDAD GENOMICA DE LA TIERRA TENDRA UN IMPACTO EN MUCHAS AREAS SOCIALES Y ECONOMICAS, INCLUIDA LA MEDICINA. COMO APLICACION ESPECIFICA, PROPONEMOS ANALIZAR LOS GENOMAS Y LAS ANOTACIONES A LO LARGO DEL ARBOL FILOGENETICO EUCARIOTA CON EL OBJETIVO DE IDENTIFICAR LAS ESPECIES QUE CONSTITUYEN MODELOS ANIMALES OPTIMOS PARA CONDICIONES HUMANAS ESPECIFICAS, Y, POR TANTO, ALTERNATIVAS PREFERIBLES A LOS MODELOS ANIMALES TRADICIONALES. ESTE ANALISIS SE BASARA EN NUESTRO TRABAJO PREVIO QUE MUESTRA QUE LAS COMPARACIONES TRANSCRIPTOMICAS AYUDAN A IDENTIFICAR LAS REDES GENICAS PARA LAS QUE UNA ESPECIE DETERMINADA ES UN BUEN MODELO DE UNA CONDICION HUMANA ESPECIFICA. IOLOGIA COMPUTACIONAL\FILOGENETICA\EVOLUCION\TRANSCRIPTOMICA\EPIGENETICA\GENOMICA

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