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BFU2011-30476

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GENOMICA COMPARADA Y FUNCIONAL DE DROSOPHILA: BASE GENETICA DE LA ADAPTACION ECO...

GENOMICA COMPARADA Y FUNCIONAL DE DROSOPHILA: BASE GENETICA DE LA ADAPTACION ECOLOGICA SE PROPONE LA SECUENCIACION DEL GENOMA Y DEL TRANSCRIPTOMA DE DROSOPHILA BUZZATII UTILIZANDO PLATAFORMAS DE SECUENCIACION DE SEGUNDA GENERACION. ESTE DIPTERO HA SIDO EL OBJETO DE NUMEROSOS ESTUDIOS PREVIOS DE NUESTRO GRUPO DE INVE... ver más

01/01/2011

UAB

105K€

Presupuesto del proyecto: 105K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1266

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1266

Presupuesto del proyecto 105K€

Descripción del proyecto SE PROPONE LA SECUENCIACION DEL GENOMA Y DEL TRANSCRIPTOMA DE DROSOPHILA BUZZATII UTILIZANDO PLATAFORMAS DE SECUENCIACION DE SEGUNDA GENERACION. ESTE DIPTERO HA SIDO EL OBJETO DE NUMEROSOS ESTUDIOS PREVIOS DE NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION, MUCHOS DE ELLOS ORIENTADOS A COMPRENDER LAS CAUSAS Y CONSECUENCIAS MOLECULARES DE LAS INVERSIONES CROMOSOMICAS NATURALES. EN ESTE PROYECTO SE PRETENDE COMPLETAR Y EXTENDER LOS ESTUDIOS PREVIOS MEDIANTE LA SECUENCIACION COMPLETA DE SU GENOMA Y LA CARACTERIZACION DE SU TRANSCRIPTOMA. D. BUZZATII PERTENECE AL GRUPO REPLETA (SUBGENERO DROSOPHILA) AL QUE TAMBIEN PERTENECE D. MOJAVENSIS CUYO GENOMA HA SIDO SECUENCIADO RECIENTEMENTE. AMBAS ESPECIES SON CACTOFILAS Y SU ECOLOGIA ES BIEN CONOCIDA. EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES INVESTIGAR LA BASE GENETICA DE LA ADAPTACION ECOLOGICA. LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON: (I) ENSAMBLAR EL GENOMA DE D. BUZZATII Y ANOTAR TODOS LOS GENES QUE CIFRAN PROTEINAS; (II) LLEVAR A CABO UN ANALISIS EVOLUTIVO DE LOS GENES QUE CODIFICAN PROTEINAS CON EL FIN DE DETECTAR LOS QUE HAN EXPERIMENTADO SELECCION POSITIVA Y HAN ESTADO IMPLICADOS EN LA ADAPTACION ECOLOGICA; (III) CARACTERIZAR EL TRANSCRIPTOMA DE EMBRIONES, LARVAS, PUPAS Y ADULTOS DE D. BUZZATII CON EL FIN DE CORROBORAR (O CORREGIR) LAS ANOTACIONES GENICAS Y TAMBIEN DE DETECTAR CAMBIOS EN LA EXPRESION GENICA DE VALOR ADAPTATIVO; (IV) ANOTAR, CLASIFICAR Y ANALIZAR LA DINAMICA EVOLUTIVA DE TODOS LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES, CON ESPECIAL REFERENCIA A AQUELLOS QUE SABEMOS HAN GENERADO INVERSIONES CROMOSOMICAS. ESTE PROYECTO REPRESENTA LA CULMINACION DE MUCHOS AÑOS DE TRABAJO Y PERMITIRA RESPONDER A MUCHAS DE LAS PREGUNTAS PLANTEADAS DURANTE ESTOS AÑOS. ES ADEMAS UNO DE LOS PRIMEROS PROYECTOS DE SECUENCIACION "DE NOVO" DE UN GENOMA EUCARIOTA REALIZADOS INTEGRAMENTE EN NUESTRO PAIS. ENOMICA\ELEMENTOS TRANSPONIBLES\DROSOPHILA\ADAPTACION ECOLOGICA\SELECCION NATURAL\EVOLUCION MOLECULAR\TRANSCRIPTOMA\SECUENCIACION

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