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BFU2009-09504

Financiado

ANALISIS GENOMICO DEL POLIMORFISMO Y LA DIVERGENCIA EN DROSOPHILA MELANOGASTER

ESTE PROYECTO SURGE A PARTIR DE LA PARTICIPACION DEL SOLICITANTE EN THE DROSOPHILA GENETIC REFERENCE PANEL, UNA INICIATIVA DE DROSOFILISTAS AL THE US NATIONAL HUMAN GENOME RESEARCH INSTITUTE EN BETHESDA PARA LA SECUENCIACION DE 19... ver más

01/01/2009

UAB

73K€

Presupuesto del proyecto: 73K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1262

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01

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Participantes

UAB

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA

Total investigadores 1262

Presupuesto del proyecto 73K€

Descripción del proyecto ESTE PROYECTO SURGE A PARTIR DE LA PARTICIPACION DEL SOLICITANTE EN THE DROSOPHILA GENETIC REFERENCE PANEL, UNA INICIATIVA DE DROSOFILISTAS AL THE US NATIONAL HUMAN GENOME RESEARCH INSTITUTE EN BETHESDA PARA LA SECUENCIACION DE 192 GENOMAS DE UNA POBLACION NATURAL DE DROSOPHILA MELANOGASTER, CUYA FINANCIACION FUE APROBADA EN JUNIO DE 2008, ENTRE LOS VARIOS OBJETIVOS, EL GRUPO DE INVESTIGACION DEL SOLICITANTE SE ENCARGARA DE CREAR Y MANTENER LA BASE DE DATOS DEL MAPA DE ALTA RESOLUCION DE POLIMORFISMOS DEL GENOMA, Y LLEVARA A CABO PARTE DEL ANALISIS POBLACIONAL DE LA VARIACION GENOMICA DE D, MELANOGASTER,HASTA LA FECHA, LOS ESTUDIOS GENETICOS POBLACIONALES SE HAN EFECTUADO A PARTIR DE MUESTRAS FRAGMENTARIAS Y NO ALEATORIAS DE LOS GENOMAS, PROPORCIONANDO UNA VISION PARCIAL Y CON FRECUENCIA SESGADA DE LOS PROCESOS POBLACIONALES, EL DISPONER DE SECUENCIAS DE GENOMAS COMPLETOS DE UN NUMERO ELEVADO DE INDIVIDUOS DE UNA ESPECIE QUE TIENE UN GENOMA DE REFERENCIA BIEN ANOTADO, COMO EL DE D, MELANOGASTER, PERMITIRA OBTENER UNA VISION GLOBAL DE LA VARIACION GENOMICA Y COMPRENDER LAS FUERZAS RESPONSABLES DE LOS PATRONES DEL POLIMORFISMO Y LA DIVERGENCIA A LO LARGO DEL GENOMA,PARA ALMACENAR Y MANEJAR LOS DATOS DE LAS SECUENCIAS ENSAMBLADAS Y PARA ESTIMAR LA VARIACION A LO LARGO DE CADA CROMOSOMA, SE CREARA UN SERVIDOR WEB QUE AUTOMATICE LAS ESTIMAS Y FACILITE SU CONSULTA, SE ESPERA QUE ESTE RECURSO SEA UTILIZADO AMPLIAMENTE POR LOS DROSOFILISTAS Y OTROS INVESTIGADORES INTERESADOS EN LA VARIACION GENETICA, LA GENOMICA FUNCIONAL, O EN ESTUDIOS DE ASOCIACION GENOTIPO-FENOTIPO,LOS 192 GENOMAS PERMITIRAN REALIZAR EL ESTUDIO MAS COMPLETO DE GENOMICA POBLACIONAL DISPONIBLE HASTA LA FECHA DE UNA ESPECIE ANIMAL, Y SERVIRA DE MODELO PARA LOS ESTUDIOS GENOMICOS DE OTRAS ESPECIES, INCLUIDA LA ESPECIE HUMANA, MEDIANTE EL USO DE UNA BATERIA DE METODOS COMPARATIVOS DE DATOS DE POLIMORFISMO Y DIVERGENCIA, SE INTENTARA RESPONDER A CUESTIONES DE INTERES FUNDAMENTAL EN GENOMICA DE POBLACIONES, TALES COMO: ¿QUE GRADIENTE SIGUE LA VARIABILIDAD GENETICA A LO LARGO DE LOS CROMOSOMAS? ¿COMO SE CORRELACIONA CON LOS COMPARTIMENTOS O REGIONES ESTRUCTURALES DEL GENOMA? ¿QUE PROPORCION DEL GENOMA NO CODIFICADOR ESTA SOMETIDO A SELECCION PURIFICADORA, NEUTRA O POSITIVA? ¿COMO SE CORRELACIONA LA VARIACION NUCLEOTIDICA Y LA ESTRUCTURAL? ¿EXPERIMENTAN LA VARIACION NUCLEOTIDICA Y ESTRUCTURAL EL MISMO TIPO DE SELECCION?ESTE CONJUNTO DE SECUENCIAS GENOMICAS DE UN NUMERO TAN ELEVADO DE INDIVIDUOS DE UNA POBLACION NATURAL ES UN MATERIAL VALIOSISIMO, Y SU ANALISIS PRIMARIO SUPONE UNA OPORTUNIDAD UNICA PARA DESCRIBIR Y COMPRENDER, POR PRIMERA VEZ, LOS PROCESOS EVOLUTIVOS QUE HAN MODELADO EL GENOMA DE UN ORGANISMO MODELO TAN IMPORTANTE COMO D, MELANOGASTER, DROSOPHILA MELANOGASTER\GENOMICA POBLACIONES\POLIMORFISMO\DIVERGENCIA\VARIACION\SNP\INDEL\SELECCION NATURAL\DERIVA

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