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BIO2015-70777-P

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LOS DETERMINANTES TRANSCRIPTOMICS DE LOS FENOTIPOS HUMANOS

LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL Y EL PROCESAMIENTO POS-TRANSCRIPCIONAL SUBYACEN LOS FENOTIPOS DE CELULAS Y ORGANISMOS, EL TRANSCRIPTOMA CELULAR, EN CONSECUENCIA, MEDIA NECESARIAMENTE LOS CAMBIOS FENOTIPICOS EN EL ORGANISMO PRODUCIDO... ver más

01/01/2015

FUNDACIO PRIVADA C...

409K€

Presupuesto del proyecto: 409K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 409K€

Descripción del proyecto LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL Y EL PROCESAMIENTO POS-TRANSCRIPCIONAL SUBYACEN LOS FENOTIPOS DE CELULAS Y ORGANISMOS, EL TRANSCRIPTOMA CELULAR, EN CONSECUENCIA, MEDIA NECESARIAMENTE LOS CAMBIOS FENOTIPICOS EN EL ORGANISMO PRODUCIDOS POR CAMBIOS EN LA SECUENCIA DEL ADN DEL GENOMA, EL PROYECTO GENOTYPE-TISSUE EXPRESSION (GTEX) HA PUESTO EN MARCHA UNA LOGISTICA COMPLEJA PARA LA RECOLECCION DE MULTIPLES ORGANOS DE MULTIPLES DONANTES, EL GENOMA DE LOS DONANTES, ASI COMO EL RNA EXTRAIDO DE SUS ORGANOS, SON SECUENCIADOS, A SU FINALIZACION, A PRINCIPIOS DEL 2017, EL PROYECTO GTEX HABRA GENERADO RNASEQ A PARTIR DE 25,000 MUESTRAS DE 900 INDIVIDUOS DE HASTA 53 ORGANOS POR INDIVIDUO, INVESTIGACIONES RECIENTES EN LA FASE PILOTO BASADAS EN 1,641 MUESTRAS DE 175 INDIVIDUOS HAN CONDUCIDO A LA IDENTIFICACION DE NUMEROSAS VARIANTES GENICAS QUE AFECTAN LA EXPRESION DE LOS GENES Y A LA CARACTERIZACION DE LOS PATRONES DE VARIACION DE LA EXPRESION GENICA ENTRE ORGANOS Y ENTRE INDIVIDUOS, SIN EMBARGO, A PESAR DE QUE SE DISPONE DE INFORMACION FENOTIPICA SOBRE LOS DONANTES EN GTEX, QUE INCLUYE CARACTERISTICAS GENERALES, TALES COMO SEXO, ETNICIDAD, EDAD, ETC, ASI COMO CONDICIONES MEDICAS Y CLINICAS, EL NUMERO DE DONANTES EN LA FASE PILOTO ES INSUFICIENTE PARA INVESTIGAR DE MANERA ROBUSTA LA RELACION ENTRE LA EXPRESION GENICA EN LOS ORGANOS Y EL FENOTIPO DE LOS INDIVIDUOS, TAL INVESTIGACION SERA POSIBLE TRAS LA COMPLECION DEL PROYECTO GTEX, EN CONSECUENCIA, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE NUESTRA PROPUESTA ES EL DESARROLLO Y LA APLICACION DE METODOS ESTADISTICOS PARA ESTABLECER LA RELACION ENTRE EXPRESION GENICA Y FENOTIPOS, CONCRETAMENTE, QUEREMOS IDENTIFICAR LOS GENES, LA EXPRESION DE LOS CUALES EN UN ORGANO DETERMINADO ESTA ASOCIADA A UN FENOTIPO ESPECIFICO (POR EJEMPLO, DIABETES, ALTURA, ABUSO DE SUBSTANCIAS, ETC,), PROPONEMOS TAMBIEN EL DESARROLLO DE METODOS PARA LA AGRUPACION SIMULTANEA DE GENES, TEJIDOS Y FENOTIPOS Y PARA VISUALIZAR SUS INTERRELACIONES EN UN ESPACIO DE DIMENSION REDUCIDA, APLICAREMOS ESTOS METODOS A LOS DATOS PRODUCIDOS POR GTEX, PROPONEMOS LLEVAR A CABO ESTUDIOS MECANISTICOS Y DE VALIDACION DE ALGUNOS DE LOS GENES POTENCIALMENTE ASOCIADOS A FENOTIPOS CLINICOS, EN PARTICULAR, DE LONG NON-CODING RNAS DE FUNCION DESCONOCIDA, AUNQUE LA MONITORIZACION DEL TRANSCRIPTOMA EN MULTIPLES ORGANOS NO PUEDE OBVIAMENTE SER LLEVADA A LA PRACTICA EN ENTORNOS CLINICOS, LA SECUENCIACION DEL RNA EN LA SANGRE PODRIA SER FACILMENTE INCLUIDA EN LOS ANALISIS DE SANGRE RUTINARIOS, EN CONSECUENCIA, UN SEGUNDO OBJETIVO DE NUESTRO PROYECTO ES LA EXPLORACION DE LA UTILIZACION DE RNASEQ EN SANGRE PARA PREDECIR FENOTIPOS DE IMPORTANCIA CLINICA, CONCRETAMENTE, UTILIZAREMOS METODOS ESTADISTICOS CON EL OBJETIVO DE CONSTRUIR PREDICTORES QUE APROVECHEN LA DISPONIBILIDAD DE LOS VALORES DE EXPRESION DE MILES DE GENES, COMO DEMOSTRACION PRACTICA, PROPONEMOS LLEVAR A CABO RNASEQ EN SANGRE EN UNA COHORTE DE TRABAJADORES EN TURNO DE NOCHE DE LA COMPAÑIA DE AUTOMOVILES SEAT, EXISTE SUFICIENTE EVIDENCIA QUE EL TRABAJO EN TURNOS DE NOCHE FAVORECE LA APARICION DE DETERMINADAS PATOLOGIAS, AUNQUE EL EFECTO DE LA PRIVACION DEL SUEÑO EN EL TRANSCRIPTOMA DE LA SANGRE HA SIDO INVESTIGADO, NO EXISTEN DATOS SOBRE SU EFECTO TRAS PROLONGADOS CAMBIOS EN LOS TURNOS DE TRABAJO, NUESTRA INVESTIGACION CONTRIBUIRA A COMPRENDER LAS BASES MOLECULARES QUE SUBYACEN LAS MANIFESTACIONES CLINICAS ASOCIADAS AL TRABAJO EN TURNOS DE NOCHE Y EVENTUALMENTE A MEJORAR LAS CONDICIONES DE LOS TRABAJADORES, TRANSCRIPTOMA\FENOTIPOS CLÍNICOS\MÉTODOS ESTADÍSTICOS\ANÁLISIS DE SANGRE

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