INTERACCIONES BIO-MACROMOLECULARES: UNA APROXIMACION ESTRUCTURAL POR RMN
LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE GOBIERNAN LAS INTERACCIONES ENTRE MACROMOLECULAS BIOLOGICAS SON DE EXTRAORDINARIA IMPORTANCIA PARA DESCRIBIR MUCHOS DE LOS PROCESOS ESENCIALES Y CARACTERISTICOS DE LOS ORGANISMOS VIVOS, PARA COMPREND...
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Descripción del proyecto
LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE GOBIERNAN LAS INTERACCIONES ENTRE MACROMOLECULAS BIOLOGICAS SON DE EXTRAORDINARIA IMPORTANCIA PARA DESCRIBIR MUCHOS DE LOS PROCESOS ESENCIALES Y CARACTERISTICOS DE LOS ORGANISMOS VIVOS, PARA COMPRENDER, Y EN SU CASO ACTUAR, EN LOS PROCESOS DE RECONOCIMIENTO ENTRE BIO-MACROMOLECULAS ES PRECISA UNA DESCRIPCION DETALLADA A NIVEL DE RESOLUCION ATOMICA DE LAS INTERACCIONES RESPONSABLES DE ESTOS COMPLEJOS, DEBIDO A LAS SINGULARIDADES QUE OFRECE, LA RMN ES PARTICULARMENTE ADECUADA PARA EL ESTUDIO DE ESTE TIPO DE SISTEMAS, EN ESTE CONTEXTO, PLANTEAMOS DOS OBJETIVOS GENERALES, POR UNA PARTE PROPONEMOS IMPLEMENTAR NUEVAS TECNICAS DE RMN Y RECURSOS DE CALCULO NECESARIOS PARA LA CARACTERIZACION A NIVEL DE RESOLUCION ATOMICA DE INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA, PROTEINA-ACIDO NUCLEICO Y PROTEINA-LIPIDO, ESTAS TECNICAS, JUNTO A OTRAS BIEN ESTABLECIDAS EN EL GRUPO, SE APLICARAN A UNOS SISTEMAS CONCRETOS QUE SE HAN ESCOGIDO EN FUNCION DE SU RELEVANCIA BIOLOGICA ASI COMO DE SU VERSATILIDAD EN CUANTO AL DISEÑO DE NUEVOS EXPERIMENTOS DE RMN, LA ELUCIDACION DE LAS BASES ESTRUCTURALES DE TODAS ESTAS INTERACCIONES Y SU RELACION CON LOS PROCESOS BIOLOGICOS EN LOS QUE SE ENMARCAN ESTOS SISTEMAS, ES EL SEGUNDO DE LOS OBJETIVOS, LOS SISTEMAS ESCOGIDOS PARA EL ESTUDIO DE INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA IMPLICAN LA CADENA LIGERA DE DINEINA DLC8, EL DOMINIO PHD DE DIDO, EL FACTOR DE CRECIMIENTO DEL ENDOTELIO VASCULAR VEGF Y SU RECEPTOR KDR, TODOS ESTOS SISTEMAS TIENEN RELEVANCIA EN ESTADOS FISIOLOGICOS Y/O PATOLOGICOS, POR LO QUE CONSTITUYEN BUENAS DIANAS PARA EL DISEÑO Y DESARROLLO DE AGENTES TERAPEUTICOS, DIVERSAS PROTEINAS IMPLICADAS EN LA FORMACION DE RIBONUCLEOPARTICULAS, QUE SON ESENCIALES PARA LA ESTABILIDAD Y LOCALIZACION DEL RNA EN LA CELULA, SERAN OBJETO DE ESTUDIO DE INTERACCIONES PROTEINA-ACIDO NUCLEICO, ESTAS PROTEINAS SON ALTAMENTE DINAMICAS CON REGIONES NATIVAMENTE DESORDENADAS QUE JUEGAN UN PAPEL IMPORTANTE EN EL RECONOCIMIENTO DEL RNA Y QUE SON UN RETO PARA EL ESTUDIO POR RMN, FINALMENTE, PARA EL ESTUDIO DE INTERACCIONES PROTEINA-LIPIDO SE HAN SELECCIONADO PROTEINAS QUE PRESENTAN ACTIVIDAD HEMOLITICA (ESTICOLISINAS) O ANTIMICROBIANA (RIBONUCLEASA ECP Y PEPTIDOS CATIONICOS) Y QUE ACTUAN A NIVEL DE MEMBRANA, RMN\detección 13C\reconocimiento molecular\interacciones macromoleculares\interacciones proteína-proteína\interacciones proteína-ácido nucleico\interacciones proteína-lípido\estructura 3D de complejos\9
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