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PID2021-127792NB-I00

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INTEGRATIVE GENIC ANALYSIS OF LONGEVITY IN HUMANS, PRIMATES, AND MAMMALS: FROM A...

INTEGRATIVE GENIC ANALYSIS OF LONGEVITY IN HUMANS, PRIMATES, AND MAMMALS: FROM AMINO ACID CHANGES TO EPISTATIC INTERACTIONS ESTE PROYECTO BUSCA IDENTIFICAR Y COMPRENDER VARIANTES DE AMINO-ACIDO (SUSTITUCIONES CONVERGENTES DE AMINOACIDOS O CAAS) QUE AFECTAN LA SENESCENCIA Y FENOTIPOS RELACIONADOS EN PRIMATES, MAMIFEROS Y HUMANOS. LA LONGEVIDAD Y LA SENE... ver más

01/01/2021

UPF

242K€

Presupuesto del proyecto: 242K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 322

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 322

Presupuesto del proyecto 242K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto ESTE PROYECTO BUSCA IDENTIFICAR Y COMPRENDER VARIANTES DE AMINO-ACIDO (SUSTITUCIONES CONVERGENTES DE AMINOACIDOS O CAAS) QUE AFECTAN LA SENESCENCIA Y FENOTIPOS RELACIONADOS EN PRIMATES, MAMIFEROS Y HUMANOS. LA LONGEVIDAD Y LA SENESCENCIA HAN SIDO OBJETO DE INTENSA INVESTIGACION TEORICA Y EXPERIMENTAL DURANTE LAS ULTIMAS DECADAS. SIN EMBARGO, SIGUE SIENDO UN MISTERIO POR QUE ESPECIES TAN RELACIONADAS (CON TAMAÑOS, PLANES CORPORALES, BIOQUIMICAS Y FISIOLOGIAS MUY SIMILARES) ENVEJECEN A TASAS TAN DIFERENTES Y PRESENTAN CORRELACIONES TAN VARIABLES CON OTRAS MEDIDAS FENOTIPICAS (COMO LA MASA CORPORAL O LA TASA METABOLICA). LA SENESCENCIA Y EL RIESGO DE ENFERMEDADES ASOCIADAS A LA EDAD SON FENOMENOS AMPLIAMENTE ESTUDIADOS, PERO LOS ENFOQUES BASADOS EN LA GENOMICA COMPARATIVA SIGUEN SIENDO POCO EXPLOTADOS. NOS CENTRAREMOS EN DICHOS ENFOQUES, EN BASE A NUESTRA EXPERIENCIA PREVIA (PGC2018-101927-B-I00) Y COMBINANDO TECNICAS DE BIOINFORMATICA, EVOLUCION MOLECULAR Y ANALISIS DE REDES CON ENSAYOS FUNCIONALES. ESTUDIAREMOS EL ENVEJECIMIENTO Y LAS ENFERMEDADES DESDE UNA PERSPECTIVA NOVEDOSA QUE EXPLOTA METODOS BASADOS EN FILOGENIAS (ALGUNOS GENERADOS POR NOSOTROS), LLEVANDOLOS DESDE LAS SUSTITUCIONES DE AMINOACIDOS INDIVIDUALES HASTA LAS INTERACCIONES.PARA ELLO, OBTENDREMOS DOS GRANDES CONJUNTOS DE DATOS. PRIMERO, RECOPILAREMOS UN DETALLADO CONJUNTO DE DATOS FENOTIPICOS DE ESPECIES DE PRIMATES Y MAMIFEROS, INCLUIDAS >200 MEDIDAS FENOTIPICAS DE ALTA CALIDAD QUE CUBREN MORFOLOGIA, COMPORTAMIENTO, ECOLOGIA, FISIOLOGIA Y ESTRATEGIAS DE HISTORIA DE VIDA. EN SEGUNDO LUGAR, REUNIREMOS TODOS LOS CONJUNTOS DE GENOMAS DISPONIBLES DE ESTAS ESPECIES. ESTIMAMOS QUE PARA 2022, ESTARAN DISPONIBLES > 600 GENOMAS DE PRIMATES Y MAMIFEROS, LA MAYORIA GENERADOS POR CONSORCIOS EN LOS QUE PARTICIPAMOS. APROVECHANDO LAS ENORMES DIFERENCIAS DE VIDA DE ESTOS LINAJES (CON >100 VECES DE DIFERENCIA EN LONGEVIDAD, DESDE LOS 2 AÑOS DE LAS MUSARAÑAS DE COLA CORTA HASTA LOS 211 DE LAS BALLENAS DE GROENLANDIA), UTILIZAREMOS LA FILOGENOMICA PARA DESCUBRIR Y VALIDAR LAS CAAS QUE PUEDEN SER LA BASE DE LAS DIFERENCIAS DE LONGEVIDAD ENTRE ESPECIES, ASI COMO INVESTIGAR POSIBLES INTERACCIONES EPISTATICAS ENTRE ELLAS. A CONTINUACION, ESTUDIAREMOS ESTAS CAAS Y SUS GENES DESDE LAS PERSPECTIVAS FUNCIONAL, MOLECULAR, EVOLUTIVA Y DE RED, INCLUIDOS SUS VINCULOS CON EL ENVEJECIMIENTO HUMANO Y LAS ENFERMEDADES RELACIONADAS CON LA EDAD. FINALMENTE, LLEVAREMOS LOS CANDIDATOS MAS PROMETEDORES A LA VALIDACION EXPERIMENTAL PRELIMINAR, UTILIZANDO EXPERIMENTOS DE SOBREEXPRESION EN FIBROBLASTOS Y CENTRANDONOS EN LECTURAS DE TRANSCRIPTOMICA UTILIZANDO RNA-SEQ.LA INTEGRACION DE ESTOS DIFERENTES ANALISIS NOS PERMITIRA (1) DESVELAR EL PAPEL DE DIFERENTES VARIANTES GENICAS EN LA LONGEVIDAD EN LOS LINAJES DE HUMANOS, PRIMATES Y MAMIFEROS; ASI COMO EN ENFERMEDADES RELACIONADAS CON LA EDAD EN HUMANOS; Y (2) DESCUBRIR Y VALIDAR NUEVOS GENES Y VIAS QUE NUNCA SE HAN ESTUDIADO EN ESTE CONTEXTO. ESTA PROPUESTA PROPORCIONARA INFORMACION SOBRE VARIANTES GENICAS VINCULADAS A LA LONGEVIDAD Y RASGOS RELACIONADOS QUE HASTA AHORA HAN PERMANECIDO INVISIBLES PARA LOS ESTUDIOS DE LONGEVIDAD REALIZADOS SOLO CON INDIVIDUOS HUMANOS (PRINCIPALMENTE GWAS), YA QUE LA MAYOR PARTE DE LA VARIABILIDAD QUE ESTUDIAREMOS NO SEGREGA EN NUESTRA ESPECIE. ESTA PROPUESTA PROPORCIONARA CONOCIMIENTOS FUNDAMENTALES CON POTENCIAL PARA TRANSFORMAR EL DESARROLLO DE INTERVENCIONES DESTINADAS A MEJORAR LA SALUD HUMANA Y LA LONGEVIDAD. ENOME-PHENOME ANALYSIS\SENESCENCE.\LONGEVITY\GENOMICS\GWAS\MOLECULAR EVOLUTION\PHYLOGENY\EPISTASIS\CONVERGENT AMINO-ACID SUBSTITUTIONS

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