IDENTIFICACION DE PERFILES DE UBICUITILACION ASSOCIADOS A PROCESOS FISIOLOGICOS...
IDENTIFICACION DE PERFILES DE UBICUITILACION ASSOCIADOS A PROCESOS FISIOLOGICOS O PATOLOGICOS: HUELLAS DE UBICUITILACION COMO FUENTE DE DIANAS TERAPEUTICAS
EL SISTEMA UBICUITINA-PROTEASOMA (UPS) CONTROLA MULTIPLES PROCESOS CELULARES VITALES, COMO EL CICLO CELULAR, LA APOPTOSIS Y LA REPARACION DEL ADN. LA UNION COVALENTE DE LA UBICUITINA Y MODIFICADORES DE TIPO UBIQUITINA COMO SUMO, A...
EL SISTEMA UBICUITINA-PROTEASOMA (UPS) CONTROLA MULTIPLES PROCESOS CELULARES VITALES, COMO EL CICLO CELULAR, LA APOPTOSIS Y LA REPARACION DEL ADN. LA UNION COVALENTE DE LA UBICUITINA Y MODIFICADORES DE TIPO UBIQUITINA COMO SUMO, A PROTEINAS SUBSTRATO PROMUEVE CAMBIOS ESTRUCTURALES QUE REGULAN ENTRE OTRAS FUNCIONES, LA VIDA MEDIA DE PROTEINAS Y SU ACTIVIDAD. DEBIDO A LA ALTA REVERSIBILIDAD DE ESTAS MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES, EL ESTUDIO DE LOS EVENTOS DE POST-MODIFICACION SIEMPRE HA REPRESENTADO UN DESAFIO TECNICO. PARA SUPERARLO, HEMOS DESARROLLADO RECIENTEMENTE TRAMPAS MOLECULARES, CUYOS PROTOTIPOS LLAMADOS TUBES, RECONOCEN ESPECIFICAMENTE A LA UBICUITINA, MUESTRAN GRAN AFINIDAD POR LAS PROTEINAS POLIUBICUITILADAS Y LAS PROTEGE DE LA ACCION DEL PROTEASOME Y DE LAS ENZIMAS DE DESUBICUITILACION (DUBS). ESTA PROPUESTA TIENE POR OBJETO UTILIZAR ESTAS TRAMPAS MOLECULARES PARA ESTUDIAR LAS RESPUESTAS GLOBALES Y ESPECIFICAS DE SUSTRATOS REGULADOS POR UBICUITILACION. LA IDENTIFICACION DE PROTEINAS UBICUITILADAS (UBICUITOMAS) Y FACTORES QUE INTERACCIONAN CON ELLAS (INTERACTOMAS) SERAN DE GRAN UTILIDAD PARA DEFINIR LA FIRMA DE UBICUITILACION QUE PUEDE ASOCIARSE ESPECIFICAMENTE, COMO HUELLAS DIGITALES, A RESPUESTAS FISIOLOGICAS O PATOLOGICAS. LA PRUEBA DE PRINCIPIO DE LAS HUELLAS DE UBICUITILACION SE ESTABLECERA CON LOS PERFILES DE LA UBICUITILACION DE A) LINFOMAS DE CELULAS DEL MANTO (MCL) RESISTENTES A LOS INHIBIDORES DEL PROTEASOMA Y B) DOS SUBSTRATOS MODELO UTILIZADOS EN NUESTRO GRUPO, EL SUPRESOR DE TUMORES P53 (EN RESPUESTA AL DAÑO DEL ADN) Y EL INHIBIDOR DE NF-κB, IκBα (EN RESPUESTA A UNA ESTIMULACION CON TNFα). CON ESTE OBJETIVO SE LLEVARAN A CABO TRES SUBPROGRAMAS INTERACTIVOS: I) DESARROLLO Y CARACTERIZACION DE NUEVAS TRAMPAS MOLECULARES. EL DESARROLLO DE TRAMPAS DE UBICUITINA QUE RECONOZCAN DISTINTOS TIPOS DE CADENA Y DE TRAMPAS PARA CAPTURAR LAS MOLECULAS DE TIPO UBICUITINA, SE LLEVARA A CABO EN FORMA SIMILAR A LO ANTERIORMENTE PUBLICADO POR NUESTRO GRUPO; II) IDENTIFICACION DE LAS HUELLAS DE UBICUITILACION PARA LOS MODELOS ANTERIORMENTE INDICADOS. LA IDENTIFICACION DE LAS PROTEINAS UBICUITILADAS Y FACTORES QUE INTERACTUAN CON ESTAS SE LLEVARA A CABO POR MEDIO DE UNA ESTRATEGIA TUBES-ESPECTROMETRIA DE MASAS (MS) EN COLABORACION CON EL SERVICIO DE PROTEOMICA DEL CICBIOGUNE (PARA LC-MS/MS) O DEL INSTITUTO CURIE DE PARIS (PARA SILAC-LC-MS/MS); III) DESARROLLO TECNOLOGICO CON LA FINALIDAD DE APLICAR LAS TRAMPAS MOLECULARES PARA EL ESTUDIO DE DISTINTAS FUNCIONES CELULARES Y PARA METODOS DE CRIBADO A ALTO RENDIMIENTO (HT). LAS TUBES PROTOTIPO HAN SIDO UTILIZADAS PARA DESARROLLAR MULTIPLES APLICACIONES QUE SE ENCUENTRAN DISPONIBLES COMERCIALMENTE. NUEVAS APLICACIONES COMO LAS CHUPS QUE UTILIZA TUBES ASOCIADAS A LA INMUNOPRECIPITACION DE CROMATINA PARA ESTUDIAR LA TRANSCRIPCION DEPENDIENTE DE UBICUITILACION O ULISA UN SISTEMA HT QUE COMBINA TUBES A LA TECNICA DE ELISA PARA ANALIZAR EN FORMA RUTINARIA/RAPIDA, SUSTRATOS UBICUITILADOS DE UNA MEZCLA COMPLEJA DE PROTEINAS PROCEDENTE DE EXTRACTOS CELULARES. ESTE PROYECTO CONTRIBUIRA NO SOLO A COMPRENDER COMO SE REGULAN FUNCIONES GLOBALES COORDINADAS POR UBICUITILACION, SINO QUE TAMBIEN PROVEERA LAS BASES MOLECULARES DE PROCESOS FISOLOGICOS O PATOLOGICOS DEPENDIENTES DE UBICUITILACION. DICHA INFORMACION SERA DE GRAN UTILIDAD PARA LA IDENTIFICACION DE DIANAS POTENCIALES PARA EL DESARROLLO DE FARMACOS. BICUITILACION\IKBA\NF-KB\P53\LINFOMA CELULAS MANTO\DEGRADACION\PROTEASOMA\SUMOILACIONver más
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