Descripción del proyecto
LA INCORPORACION DE LAS HERRAMIENTAS DE GENOMICA FUNCIONAL ESTA PERMITIENDO MEJORAR RAPIDAMENTE NUESTRA COMPRENSION SOBRE MUCHOS PROCESOS BIOTECNOLOGICOS, ESPECIALMENTE AQUELLOS EN LOS QUE PARTICIPA SACCHAROMYCES CEREVISIAE, COMO LA VINIFICACION, EN CONCRETO, EL PROCESO DE VINIFICACION SE HA ESTUDIADO CON BASTANTE PROFUNDIDAD EN LOS ULTIMOS AÑOS MEDIANTE ANALISIS TRANSCRIPTOMICO, TANTO DEL PROCESO DE FERMENTACION COMO DE LA RESPUESTA DE LAS LEVADURAS A DIFERENTES FACTORES DE ESTRES RELACIONADOS CON LA FERMENTACION ALCOHOLICA DEL MOSTO DE UVA, SIN EMBARGO ESTE TIPO DE APROXIMACION PRESENTA LIMITACIONES PARA IDENTIFICAR TODOS LOS GENES IMPLICADOS EN EL PROCESO, YA QUE ESTA DEMOSTRADO QUE NO TODOS LOS GENES RELEVANTES PARA UN PROCESO PUEDEN SER IDENTIFICADOS POR SU PATRON DE TRANSCRIPCION, NI UNA RESPUESTA TRANSCRIPCIONAL ANTE UNA CONDICION AMBIENTAL SE CORRELACIONA SIEMPRE CON LA RELEVANCIA DE ESE GEN PARA SU ADAPTACION A LA MISMA, LA ESTRATEGIA HIP-HOP (HAPLOINSUFICIENCY PROFILING-HOMOZYGOUS DELETION PROFILING), BASADA EN EXPERIMENTOS DE COMPETICION ENTRE COLECCIONES DE CEPAS DE DELECION DE S, CEREVISIAE, MARCADAS CON ¿CODIGOS DE BARRAS MOLECULARES¿ Y EL ANALISIS DE LA ABUNDANCIA DE TODAS LAS CEPAS MEDIANTE MICROARRAYS DE DNA ESPECIFICOS CONSTITUYE UNA INTERESANTE ALTERNATIVA PARA LA IDENTIFICACION DE LOS GENES NECESARIOS PARA EL BUEN DESARROLLO DE LA LEVADURA EN DETERMINADAS CONDICIONES DE CULTIVO, RECIENTEMENTE SE HA DEMOSTRADO QUE EL POTENCIAL DE ESTA TECNICA ES AUN MAYOR SI SE COMBINA CON EL CULTIVO CONTINUO DE LAS LEVADURAS EN LAS CONDICIONES DE INTERES, AUMENTANDO ASI EL NUMERO DE GENERACIONES, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS UTILIZAR ESTA COMBINACION DE TECNICAS PARA IDENTIFICAR GENES DE S, CEREVISIAE IMPLICADOS EN LA ADAPTACION A LAS CONDICIONES DE FERMENTACION, PARA ELLO SE UTILIZARAN CONDICIONES DE CULTIVO CONTINUO QUE EMULEN DIFERENTES ETAPAS DE LA VINIFICACION, O FACTORES DE ESTRES CARACTERISTICOS DE LA FERMENTACION ALCOHOLICA, Y SE LLEVARAN A CABO EXPERIMENTOS DE COMPETICION EN DICHAS CONDICIONES, DADO QUE ESTA APROXIMACION TAMBIEN TIENE ALGUNAS LIMITACIONES, FUNDAMENTALMENTE DERIVADAS DE QUE EL GENOTIPO BASAL DE LAS CEPAS DE DELECION NO CORRESPONDE A UNA CEPA ENOLOGICA, SE PROPONE HACER TAMBIEN APROXIMACIONES DE GENOMICA FUNCIONAL Y DE INGENIERIA GENETICA COMPLEMENTARIAS, PARA PODER LLEGAR A CONCLUSIONES MAS SOLIDAS, SACCHAROMYCES CEREVISIAE\VINO\GENOMICA FUNCIONAL\HAPLOINSUFICIENCY PROFILING (HIP)\HOMOZYGOUS PROFILING (HOP)\CULTIVO CONTINUO