HOMEOSTASIS MOLECULAR EN EL DOGMA CENTRAL: RECAMBIO DE MRNAS Y PROTEINAS Y LOS M...
HOMEOSTASIS MOLECULAR EN EL DOGMA CENTRAL: RECAMBIO DE MRNAS Y PROTEINAS Y LOS MECANISMOS DE COMUNICACION CRUZADA ENTRE ELLOS
EL ENFOQUE REDUCCIONISTA DE LA BIOLOGIA MOLECULAR HA APORTADO UNA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION SOBRE LOS MECANISMOS CELULARES, PERO SUS RESULTADOS SON DEMASIADO LIMITADOS PARA ENTENDER COMO FUNCIONA UNA CELULA EN SU CONJUNTO. SE R...
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Descripción del proyecto
EL ENFOQUE REDUCCIONISTA DE LA BIOLOGIA MOLECULAR HA APORTADO UNA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION SOBRE LOS MECANISMOS CELULARES, PERO SUS RESULTADOS SON DEMASIADO LIMITADOS PARA ENTENDER COMO FUNCIONA UNA CELULA EN SU CONJUNTO. SE REQUIERE UNA VISION INTEGRADORA QUE DESCUBRA LOS NIVELES SUPERIORES DE RELACION ENTRE MOLECULAS, RUTAS Y ESTRUCTURAS CELULARES. LAS CIENCIAS OMICAS Y LA BIOLOGIA DE SISTEMAS PROPORCIONAN LAS HERRAMIENTAS Y LA VISION GLOBAL NECESARIA PARA CAPTAR LAS PROPIEDADES EMERGENTES DE LA CELULA. DESDE ESA PERSPECTIVA, QUEREMOS CONTRIBUIR A RE-EXAMINAR LA EXPRESION GENICA, ENTENDIENDO POR TAL EL PROCESO QUE CONVIERTE LA INFORMACION GENETICA EN ELEMENTOS FENOTIPICOS ACTIVOS (PROTEINAS). EN EL PARADIGMA CLASICO, EL EQUILIBRIO DINAMICO DE LOS ELEMENTOS DE LA CELULA (HOMEOSTASIA) SE CONSIGUE GRACIAS AL BALANCE ENTRE SINTESIS Y DEGRADACION, Y MEDIANTE MECANISMOS DE CONTROL QUE REGULAN UNO DE ESOS DOS PROCESOS. SEGUN ESA VISION, EL LLAMADO DOGMA CENTRAL ES UN CAMINO LINEAL EN EL QUE EL MRNA JUEGA UN PAPEL DE MERO INTERMEDIARIO. EN LOS ULTIMOS AÑOS NUESTRO EQUIPO HA CONTRIBUIDO A DEMOSTRAR QUE EXISTE UN CONTROL GENERAL DE LA CONCENTRACION CELULAR DE MRNA (HOMEOSTASIA DEL MRNA) EN SACCHAROMYCES CEREVISIAE QUE ES FRUTO DE LA COMUNICACION CRUZADA ENTRE LAS MAQUINARIAS DE TRANSCRIPCION Y DEGRADACION (MRNA-CROSSTALK, CT). ESTA IMPLICA TANTO LA IMPRONTA QUE LOS MRNAS RECIBEN EN SU SINTESIS, COMO LA RETROALIMENTACION QUE SOBRE LA MAQUINARIA DE TRANSCRIPCION EJERCEN LOS PROPIOS FACTORES DE DEGRADACION DEL MRNA. DURANTE PROYECTO EN CURSO HEMOS IDENTIFICADO LA ETAPA DE ELONGACION DE LA TRANSCRIPCION, Y MAS CONCRETAMENTE EL FENOMENO DE MARCHA ATRAS DE LA RNA POLIMERASA II (RNA POL II BACKTRACKING), COMO UN ELEMENTO CLAVE DEL MRNA-CT. HEMOS DEMOSTRADO ASIMISMO QUE LAS TASAS DE TRANSCRIPCION Y DEGRADACION DE MRNA CAMBIAN DE FORMA PARALELA CON LA VELOCIDAD DE PROLIFERACION CELULAR, MANTENIENDO CONSTANTE LA CONCENTRACION DE MRNA PARA UNA MAYORIA DE GENES. COMO CONSECUENCIA DE ELLO, ES EL RECAMBIO DE MRNA (MRNA-TURNOVER) LO QUE VARIA CON LA PROLIFERACION PARA GARANTIZAR SU HOMEOSTASIA. EN EL PRESENTE PROYECTO QUEREMOS PROFUNDIZAR EN EL CONOCIMIENTO DEL MRNA-CT, IDENTIFICAR LOS MECANISMOS QUE ACOPLAN EL MRNA-TURNOVER A LA TASA DE PROLIFERACION CELULAR, MODELAR MATEMATICAMENTE ESTE ACOPLAMIENTO Y COMPROBAR SI TAMBIEN TIENE LUGAR EN LAS CELULAS HUMANAS. QUEREMOS ASIMISMO EXPLORAR LA POSIBLE EXISTENCIA DE COMUNICACION CRUZADA ENTRE LA TRADUCCION DE LOS MRNAS A PROTEINAS Y LA DEGRADACION DE ESTAS (PROTEIN-CROSSTALK). NUESTROS DATOS PRELIMINARES ASI LO SUGIEREN Y, CASO DE DEMOSTRARLO, QUEREMOS ENTENDER LOS MECANISMOS QUE LO SUSTENTAN Y EXPLORAR SI TAMBIEN EXISTE UN ACOPLAMIENTO DEL RECAMBIO DE PROTEINAS (PROTEIN-TURNOVER) A LA PROLIFERACION CELULAR. POR ULTIMO QUEREMOS EXPLICAR LA PARTICIPACION EN EL PROCESO DE ELONGACION TRANSCRIPCIONAL DE LAS PREFOLDINAS, UNAS CO-CHAPERONAS QUE TRABAJAN EN EL PLEGAMIENTO DE ACTINAS Y TUBULINAS DURANTE EL ENSAMBLAJE DEL CITOESQUELETO. LOS RESULTADOS DEL PROYECTO EN CURSO INDICAN QUE CONTRIBUYEN A LA DINAMICA TRANSCRIPCIONAL DE LAS HISTONAS A TRAVES DE REMODELADORES DE CROMATINA QUE CONTIENEN ACTINA. QUEREMOS ENTENDER ESE MECANISMO Y COMPROBAR SI LAS PREFOLDINAS ESTAN MEDIANDO LA COMUNICACION ENTRE LA DINAMICA CITOPLASMICA Y LA EXPRESION DE LOS GENES. EN DEFINITIVA, ESTE PROYECTO PRETENDE INVESTIGAR TRES FENOMENOS DE HOMEOSTASIA MOLECULAR QUE LA VISION REDUCCIONISTA DEL DOGMA CENTRAL NO HA PERMITIDO ENTENDER. XPRESIÓN GÉNICA\RECAMBIO PROTEÍNAS\RECAMBIO RNA\CROMATINA\SACCHAROMYCES\RESPUESTA AL ESTRES\ESTABILIDAD DE MRNA\HOMOEOSTASIS\RNA POLYMERASA II\TRANSCRIPCION
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