Descripción del proyecto
LA HOMEOSTASIS DEL OXIGENO ESTA SEVERAMENTE COMPROMETIDA EN VARIAS PATOLOGIAS PREVALENTES ENTRE LAS QUE SE INCLUYEN ENFERMEDADES CARDIORESPIRATORIAS Y CANCER, EN RESPUESTA A LA HIPOXIA, DEFINIDA COMO UN DESBALANCE ENTRE LA DEMANDA Y EL APORTE DE OXIGENO, LAS CELULAS ACTIVAN UN PATRON DE EXPRESION GENICO CARACTERISTICO CUYO FIN ES RESTAURAR LA HOMEOSTASIS MEDIANTE LA REPROGRAMACION DEL METABOLISMO Y LA INDUCCION DE LA ANGIOGENESIS, ESTA RESPUESTA TRANSCRIPCIONAL ESTA CONTROLADA POR LOS FACTORES INDUCIBLES POR HIPOXIA (HIF), QUE MEDIAN LA ADAPTACION A FLUCTUACIONES EN LA TENSION DE OXIGENO, PESE A QUE LOS ELEMENTOS CENTRALES DE ESTA RUTA SE HAN CARACTERIZADO CON DETALLE, AUN NO TENEMOS UNA DESCRIPCION COMPLETA DE LA RESPUESTA DE ADPTACION A LA HIPOXIA, NI COMO AFECTA LA VARIABILIDAD GENETICA INTERINDIVIDUO A ESTA RESPUESTA, POR ELLO, EL PAPEL DE LA ACTIVACION HIF EN CONTEXTOS FISIOLOGICOS Y PATOLOGICOS ES, EN GRAN MEDIDA, DESCONOCIDO,BASANDONOS EN LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN EL PROYECTO SAF ANTERIOR, LA PRESENTE PROPUESTA SE CENTRA EN PROFUNDIZAR EN LA RESPUESTA ADAPTATIVA A LA HIPOXIA CONSIDERANDO TRES OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1) DILUCIDAR LAS REDES DE REGULACION GENICA (GRN) RESPONSABLES DE LA RESPUESTA A LA HIPOXIA CONTINUA O INTERMITENTE, EL DESARROLLO DE ESTE OBJETIVO, BASADO EN SECUENCIACION MASIVA DE RNA (RNA-SEQ) Y ANALISIS COMPUTACIONAL, NOS PERMITIRA IDENTIFICAR LOS MOTIVOS DE RED RELEVANTES PARA LA ADAPTACION A DIFERENTES TIPOS DE HIPOXIA, ASI COMO SU PAPEL EN LA INDUCCION DE ANGIOGENESIS Y EN LA VARIABILIDAD FENOTIPICA EN PATOLOGIAS RESPIRATORIAS CRONICAS, 2) IDENTIFICAR LOS GENES INDUCIDOS POR HIF QUE CONTROLAN LA PROLIFERACION DE LAS CELULAS ENDOTELIALES DURANTE LA ANGIOGENESIS INDUCIDA POR LA HIPOXIA, UTILIZAREMOS UN MODELO DE ANGIOGENESIS BASADO EN CELULAS MADRE DE RATON Y UNA ESTRATEGIA DE BUSQUEDA FUNCIONAL A ESCALA GENOMICA BASADA EN CRISPR/CAS9 EN CELULAS ENDOTELIALES, LOS RESULTADOS DE ESTE OBJETIVO PODRIAN PERMITIR DESARROLLAR NUEVAS ESTRATEGIAS PARA IMPEDIR LA NEOVASCULARIZACION PATOLOGICA INDUCIDA EN CONDICIONES DE HIPOXIA, 3) IMPLEMENTAR UNA NUEVA ESTRATEGIA, BASADA EN LA COMPARACION DE DATOS DE CHIP-SEQ Y SECUENCIACION GENOMICA, PARA IDENTIFICAR REGIONES POLIMORFICAS QUE ALTERAN LA RESPUESTA A LA HIPOXIA, LA IDENTIFICACION DE POLIMORFISMOS EN REGIONES NO CODIFICANTES DEL GENOMA Y SU ASOCIACION CON VARIABILIDAD FENOTIPICA CONSTITUYE UN AVANCE SIGNIFICATIVO HACIA LA MEDICINA PERSONALIZADA, EN EL CONTEXTO DE ENFERMEDADES CARDIORESPIRATORIAS Y CANCER, PATRONES DE EXPRESION DIVERGENTES EN RESPUESTA A HIPOXIA PODRIAN CONTRIBUIR A EXPLICAR DIFERENCIAS EN LA PROGRESION Y/O RESPUESTA AL TRATAMIENTO OBSERVADA ENTRE PACIENTES,EN RESUMEN, TENIENDO COMO BASE NUESTRA EXPERIENCIA EN LOS CAMPOS DE HIPOXIA Y ANGIOGENESIS, ESTA PROPUESTA ESTA ENCAMINADA A RESOLVER ASPECTOS CENTRALES AUN POR DILUCIDAR, QUE PERMITAN UNA MEJOR COMPRENSION GLOBAL DE LA RESPUESTA ADAPTATIVA A LAS FLUCTUACIONES EN LA TENSION DE OXIGENO Y QUE POTENCIALMENTE PUEDAN TRADUCIRSE EN UNA MEJOR ATENCION A PACIENTES QUE SUFREN DE ENFERMEDADES EN LAS QUE LA HIPOXIA JUEGA UN PAPEL RELEVANTE, HYPOXIA\ANGIOGENESIS\GENE REGULATORY NETWORKS\PRECISION MEDICINE\STEM CELL ANGIOGENESIS MODELS\GENOMICA\BIOINFORMÁTICA\ENFERMEDADES RESPIRATORIAS\CÁNCER