Descripción del proyecto
LAS HELICES DE POLIPROLINA II (PPII) SON UNA CLASE IMPORTANTE DE ESTRUCTURA SECUNDARIA DE PROTEINAS, PERO LAS BASES DE SU PLEGAMIENTO SON POCO CONOCIDAS, POR LO TANTO, LAS HELICES PPII HAN SIDO IGNORADAS EN EL CAMPO FLORECIENTE DEL DISEÑO DE PROTEINAS, RECIENTEMENTE, CARACTERIZAMOS CON EXITO LA ESTRUCTURA, DINAMICA Y ESTABILIDAD DE UNA PROTEINA ANTICONGELANTE (SFAFP), QUE SE COMPONE DE UN MANOJO DE 6 HELICES PPII (TREVIÑO ET AL, -2018- JACS), AHORA, PROPONEMOS OBTENER MAS CONOCIMIENTOS AL CARACTERIZAR LAS CONTRIBUCIONES ENERGETICAS DE LA ENTROPIA CONFORMACIONAL Y DE LAS REDES DE ENLACES DE H NO ORTODOXAS DE CAH··O=C, ESTA COMPRENSION AÑADIDA NOS APORTARA CONOCIMIENTOS ESENCIALES QUE NOS PERMITIRA DISEÑAR MATERIALES NOVEDOSOS Y HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS BASADAS EN HELICES PPII, ESTAS INCLUYEN VARIANTES DE SFAFP DE ALTO RENDIMIENTO PARA EL MERCADO DE PROTEINAS ANTICONGELANTES Y UNA VARIANTE DE SFAFP DISEÑADA PARA FACILITAR LA LISIS CELULAR EN CONDICIONES SUAVES,LAS HELICES PPII PODRIAN SER CLAVES PARA LA FORMACION DE CONDENSADOS BIOMOLECULARES, EL DESCUBRIMIENTO DE UNA DOCENA DE CONDENSADOS BIOMOLECULARES FUNCIONALES FORMADOS POR SEPARACION DE FASE LIQUIDO-LIQUIDO HA REVOLUCIONADO LA BIOLOGIA CELULAR, PREDECIMOS QUE CIERTAS ZONAS DE PROTEINAS QUE SE CONSIDERAN DESORDENADAS ADOPTAN HELICES PPII, PRONOSTICAMOS QUE ESTOS SEGMENTOS PUEDEN ASOCIARSE E IMPULSAR LA FORMACION DEL CONDENSADO Y, POSTERIORMENTE, DESENCADENAR LA AMILOIDOGENESIS, ADEMAS, LA RECIENTE ELUCIDACION DE LA 1A ESTRUCTURA DE UN AMILOIDE HIBRIDO (MOMPEAN EL AL, -2018- CELL) SIGNIFICA QUE DISTINTOS SEGMENTOS AMILOIDOGENICOS PUEDEN IMPULSAR SINERGICAMENTE LA FORMACION DE AMILOIDE, HIPOTETIZAMOS QUE ESTO PODRIA OCURRIR EN SOLUCION ACUOSA O DENTRO DE UN CONDENSADO PROMOVIDO POR ASOCIACIONES DE HELICES DE PPII, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS COMPROBAR ESTAS HIPOTESIS CON SEGMENTOS DE AMILOIDES FUNCIONALES O PATOLOGICOS, CON LA INFORMACION OBTENIDA, DISEÑAREMOS CONDENSADOS BASADOS EN LA ASOCIACION TRANSITORIA DE HELICES PPII Y MATERIALES SOLIDOS CASI-AMILOIDE, AL COMBINAR TODOS NUESTROS HALLAZGOS, DESARROLLAREMOS UNA APLICACION DE SERVIDOR WEB DE ACCESO ABIERTO, DADO QUE ESTA APLICACION PREDECIRA SI UNA SECUENCIA ADOPTA UNA HELICE PPII O UN MANOJO DE HELICES PPII, SERA UTIL PARA EL DISEÑO DE PROTEINAS, NUESTRO EQUIPO CONSOLIDADO: D, LAURENTS, D, PANTOJA, S, FELIX Y M, MOMPEAN, ES EXPERTO EN LA ESPECTROSCOPIA DE RMN EN ESTADO LIQUIDO, LA EXPRESION DE PROTEINAS RECOMBINANTES, LA BIOFISICA Y LA QUIMICA COMPUTACIONAL, EN ESTE NUEVO PROYECTO MULTIDISCIPLINAR, LA NUEVA EXPERIENCIA QUE ADQUIRIREMOS EN LA RMN DE ESTADO SOLIDO, LA MICROSCOPIA, RMN EN CELULAS Y LA BIOINFORMATICA SERVIRA PARA FORTALECER NUESTRA ICTS PARA LA RMN BIOMOLECULAR,LOS RESULTADOS SOBRE HELICES PPII QUE OBTENDREMOS TENDRAN UN IMPACTO EXTRAORDINARIO YA QUE PERMITIRAN EL USO DE HELICES PPII PARA DISEÑAR PROTEINAS ANTICONGELANTES MEJORADAS, SISTEMAS PARA FACILITAR LA LISIS CELULAR, ASI COMO NUEVOS CONDENSADOS Y SOLIDOS DE TIPO AMILOIDE Y CATALIZADORES, ESTOS AVANCES ESTARAN PROTEGIDOS POR HASTA 3 PATENTES, ADEMAS, EL RECONOCIMIENTO DE LOS AMILOIDES HIBRIDOS EN LAS DEMENCIAS CONDUCIRIA AL DESARROLLO DE FARMACOS CON UN PROFUNDO IMPACTO SOCIOECONOMICO, EL IMPACTO EXCEPCIONAL DEL PROYECTO SE VERA MAGNIFICADO POR UN PLAN DE DIFUSION EFICAZ QUE INCLUYE LA PUBLICACION EN REVISTAS DE ALTO IMPACTO EN ACCESO ABIERTO, LA PARTICIPACION EN CONFERENCIAS INTERNACIONALES Y LA APLICACION DEL SERVIDOR WEB PARA PREDECIR HELICES PPII, HELICES DE POLIPROLINA II\ESPECTROSCOPIA DE RMN\DISEÑO DE PROTEINAS\CONDENSADOS BIOMOLECULARES\AMILOIDE