GWAS SPECIFICOS DE TEJIDO PARA EL ESTUDIO DE LA PREDISPOCICION GENETICA AL CANCE...
DESDE LA APARICION DE CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE (3C) EN 2002, ESTA METODOLOGIA SE A COMPLEMENTADO CON UNA GRAN CANTIDAD DE METODOS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES LOS CUALES PERMITEN, HOY EN DIA, EL USO GENERALIZADO DE TE...
DESDE LA APARICION DE CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE (3C) EN 2002, ESTA METODOLOGIA SE A COMPLEMENTADO CON UNA GRAN CANTIDAD DE METODOS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES LOS CUALES PERMITEN, HOY EN DIA, EL USO GENERALIZADO DE TECNOLOGIAS PARA ESTUDIAR LA ORGANIZACION DEL GENOMA EN EL ESPACIO Y EL TIEMPO (EL LLAMADO 4DNUCLEOME), NUESTRO LABORATORIO HA CONTRIBUIDO AL CAMPO DESDE 2006, CUANDO EMPEZAMOS A TRABAJAR EN METODOS COMPUTACIONALES PARA LA DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA DEL GENOMA, AHORA ES EL MOMENTO DE QUE NUESTRA COMUNIDAD COMIENCE A ABORDAR DESAFIOS EN SALUD HUMANA, ESTA PROPUESTA DE INVESTIGACION DA UN PASO EN ESA DIRECCION AL IMPLEMENTAR Y APLICAR UNA NUEVA CLASE DE METODOS DE GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES (GWAS), NUESTRO NUEVO ENFOQUE, LLAMADO TISSUE AWARE GWAS O TAGWAS, SE INFORMA LA ORGANIZACION TRIDIMENSIONAL (3D) DEL GENOMA PARA IDENTIFICAR GENES Y VARIANTES GENICAS QUE INCREMENTAN EL RIESGO DE ENFERMEDAD, EN CONCRETO, ESTA PROPUESTA TIENE TRES OBJETIVOS, LOS DOS PRIMEROS OBJETIVOS, QUE ESTAN DEDICADOS A DESARROLLOS COMPUTACIONALES, SE CENTRAN EN LA IMPLEMENTACION DE TAGWAS A TRAVES DE UN ENFOQUE GENERALIZADO LLAMADO METALOCI , TAGWAS SERA COMPLEMENTADO CON UN POLYGENIC RISK SCORE BASADO EN TAGWAS (TAGWASRS) PARA PREDECIR EL RIESGO DE ENFERMEDAD DE INDIVIDUOS GENOTIPADOS, EL TERCER OBJETIVO, QUE ES MITAD EXPERIMENTAL Y MITAD COMPUTACIONAL, APLICARA TAGWAS/RS EN TRES DIFERENTES ESCENARIOS PARA: (1) IDENTIFICAR GENES DE RIESGO DEL CANCER DE PANCREAS; (2) IDENTIFICAR GENES DE PREDISPOSICION A LA METASTASIS DE CANCER DE COLON Y; (3) DISCERNIR LAS DIFERENCIAS GENETICAS DE PACIENTES CON CLL, LOS TRES OBJETIVOS COINCIDEN CON LA FINALIDAD DE NUESTRO GRUPO DE DESARROLLAR, APLICAR Y PROPORCIONAR METODOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES PARA EL ANALISIS DE GENOMAS Y DOMINIOS GENOMICOS EN SU TERCERA DIMENSION, GENOMICA 3D\NUCLEOMICA 4D\HI-C\GWAS\CANCERver más
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