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PID2020-115696RB-I00

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GWAS SPECIFICOS DE TEJIDO PARA EL ESTUDIO DE LA PREDISPOCICION GENETICA AL CANCE...

GWAS SPECIFICOS DE TEJIDO PARA EL ESTUDIO DE LA PREDISPOCICION GENETICA AL CANCER (TAGWAS) DESDE LA APARICION DE CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE (3C) EN 2002, ESTA METODOLOGIA SE A COMPLEMENTADO CON UNA GRAN CANTIDAD DE METODOS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES LOS CUALES PERMITEN, HOY EN DIA, EL USO GENERALIZADO DE TE... ver más

01/01/2020

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303K€

Presupuesto del proyecto: 303K€

Líder del proyecto

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TRL 4-5 | 50K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 303K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto DESDE LA APARICION DE CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE (3C) EN 2002, ESTA METODOLOGIA SE A COMPLEMENTADO CON UNA GRAN CANTIDAD DE METODOS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES LOS CUALES PERMITEN, HOY EN DIA, EL USO GENERALIZADO DE TECNOLOGIAS PARA ESTUDIAR LA ORGANIZACION DEL GENOMA EN EL ESPACIO Y EL TIEMPO (EL LLAMADO 4DNUCLEOME), NUESTRO LABORATORIO HA CONTRIBUIDO AL CAMPO DESDE 2006, CUANDO EMPEZAMOS A TRABAJAR EN METODOS COMPUTACIONALES PARA LA DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA DEL GENOMA, AHORA ES EL MOMENTO DE QUE NUESTRA COMUNIDAD COMIENCE A ABORDAR DESAFIOS EN SALUD HUMANA, ESTA PROPUESTA DE INVESTIGACION DA UN PASO EN ESA DIRECCION AL IMPLEMENTAR Y APLICAR UNA NUEVA CLASE DE METODOS DE GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES (GWAS), NUESTRO NUEVO ENFOQUE, LLAMADO TISSUE AWARE GWAS O TAGWAS, SE INFORMA LA ORGANIZACION TRIDIMENSIONAL (3D) DEL GENOMA PARA IDENTIFICAR GENES Y VARIANTES GENICAS QUE INCREMENTAN EL RIESGO DE ENFERMEDAD, EN CONCRETO, ESTA PROPUESTA TIENE TRES OBJETIVOS, LOS DOS PRIMEROS OBJETIVOS, QUE ESTAN DEDICADOS A DESARROLLOS COMPUTACIONALES, SE CENTRAN EN LA IMPLEMENTACION DE TAGWAS A TRAVES DE UN ENFOQUE GENERALIZADO LLAMADO METALOCI , TAGWAS SERA COMPLEMENTADO CON UN POLYGENIC RISK SCORE BASADO EN TAGWAS (TAGWASRS) PARA PREDECIR EL RIESGO DE ENFERMEDAD DE INDIVIDUOS GENOTIPADOS, EL TERCER OBJETIVO, QUE ES MITAD EXPERIMENTAL Y MITAD COMPUTACIONAL, APLICARA TAGWAS/RS EN TRES DIFERENTES ESCENARIOS PARA: (1) IDENTIFICAR GENES DE RIESGO DEL CANCER DE PANCREAS; (2) IDENTIFICAR GENES DE PREDISPOSICION A LA METASTASIS DE CANCER DE COLON Y; (3) DISCERNIR LAS DIFERENCIAS GENETICAS DE PACIENTES CON CLL, LOS TRES OBJETIVOS COINCIDEN CON LA FINALIDAD DE NUESTRO GRUPO DE DESARROLLAR, APLICAR Y PROPORCIONAR METODOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES PARA EL ANALISIS DE GENOMAS Y DOMINIOS GENOMICOS EN SU TERCERA DIMENSION, GENOMICA 3D\NUCLEOMICA 4D\HI-C\GWAS\CANCER

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