GENOMICA POBLACIONAL DE LA HETEROGENEIDAD INTRATUMORAL
LOS TUMORES NO SON MASAS HOMOGENEAS DE CELULAS SI NO QUE A MENUDO MUESTRAN UNA GRAN HETEROGENEIDAD FENOTIPICA Y GENOTIPICA EN PRINCIPIO RESULTANTE DE LA ADAPTACION DE LAS CELULAS TUMORALES A SU ENTORNO INMEDIATO, ENTENDER COMO SE...
LOS TUMORES NO SON MASAS HOMOGENEAS DE CELULAS SI NO QUE A MENUDO MUESTRAN UNA GRAN HETEROGENEIDAD FENOTIPICA Y GENOTIPICA EN PRINCIPIO RESULTANTE DE LA ADAPTACION DE LAS CELULAS TUMORALES A SU ENTORNO INMEDIATO, ENTENDER COMO SE GENERA ESTA HETEROGENEIDAD INTRATUMORAL ES FUNDAMENTAL PARA EL DIAGNOSTICO, TRATAMIENTO Y PRONOSTICO PERSONALIZADO, PERO LOS MECANISMOS RESPONSABLES DE SU ORIGEN Y MANTENIMIENTO SON POCO CONOCIDOS, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS DESCIFRAR LA ESTRUCTURA POBLACIONAL Y LA HISTORIA ADAPTATIVA DEL CANCER DE COLON COLORRECTAL DENTRO DE INDIVIDUOS, YA QUE LA ORGANIZACION DEL INTESTINO PROPORCIONA UN MODELO MUY INTERESANTE PARA EL ESTUDIO DE LA EVOLUCION DE LOS TUMORES SOLIDOS, DE MANERA SIGNIFICATIVA, CONSIDERAREMOS COMO LA VARIACION MICROAMBIENTAL DENTRO DEL TUMOR PODRIA ESTAR SELECCIONANDO DISTINTAS MUTACIONES QUE FAVOREZCAN LA SUPERVIVENCIA Y LA EXPANSION DE CLONES EN EL ENTORNO LOCAL, GENERANDO HETEROGENEIDAD INTRATUMORAL, MIENTRAS QUE LA MAYORIA DE LAS INFERENCIAS EVOLUTIVAS EN CANCER HAN SIDO CUALITATIVAS, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS USAR LA SOFISTICADA MAQUINARIA DE LA GENOMICA POBLACIONAL PARA ENTENDER LA EVOLUCION Y ADAPTACION TUMORAL A PARTIR DE LA VARIACION GENOMICA ESPACIAL, ASI, APLICAREMOS, Y EN ALGUNOS CASOS DESARROLLAREMOS, UN MARCO FORMAL ESTADISTICO PARA EL ANALISIS DE DATOS DE SECUENCIACION MASIVA DE CONJUNTOS DE CELULAS (POOL SEQUENCING), DE MODO QUE PODAMOS OBTENER ESTIMAS CUANTITATIVAS DE PARAMETROS EVOLUTIVOS RELACIONADOS CON LA DIVERSIDAD, ESTRUCTURA Y MEZCLA POBLACIONAL, DEMOGRAFIA, TIEMPOS DE DIVERGENCIA Y SELECCION EN POBLACIONES TUMORALES, ADEMAS, TRATAREMOS DE RELACIONAR ESTAS ESTIMAS CON EL MICROAMBIENTE TUMORAL Y CON EL FENOTIPO DE DISTINTAS POBLACIONES TUMORALES, AL DESCIFRAR LA HISTORIA Y EL PROCESO DE ADAPTACION LOCAL DEL CANCER DEBERIAMOS SER CAPACES DE IDENTIFICAR LOS EVENTOS CONDUCTORES Y LOS PROCESOS MUTACIONALES QUE CONTRIBUYEN A LA FORMACION, MANTENIMIENTO Y PROGRESION TUMORAL, ASI COMO A LA DIVERSIFICACION CLONAL, Y POR LO TANTO A IDENTIFICAR ALGUNOS DE LOS MECANISMOS GENETICOS QUE SUBYACEN A LA RESPUESTA ADAPTATIVA DE LAS CELULAS TUMORALES A SU ENTORNO, EVOLUCIÓN DEL CÁNCER\GENÓMICA DEL CÁNCER\ADAPTACIÓN TUMORAL\SECUENCIACIÓN MULTIREGIONAL\CÁNCER COLORRECTALver más
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