Descripción del proyecto
ENTENDER LA BASE GENOMICA DE LA EVOLUCION ADAPTATIVA ES RELEVANTE NO SOLO PARA COMPRENDER ESTE PROCESO CENTRAL EN LA EVOLUCION, SINO TAMBIEN PARA MEJORAR LA PRODUCCION ANIMAL Y VEGETAL Y CON APLICACIONES EN GENETICA MEDICA, LAS APROXIMACIONES ACTUALES AL ESTUDIO DE LA GENOMICA DE LA ADAPTACION SE CENTRAN PRINCIPALMENTE EN POBLACIONES NATURALES, SIN EMBARGO, COMPRENDER COMO LOS ORGANISMOS SE ADAPTAN A LOS ENTORNOS URBANOS ES TAMBIEN MUY RELEVANTE, ESPECIALMENTE PARA LAS ESPECIES QUE SON VECTORES DE ENFERMEDADES HUMANAS, COMO LOS MOSQUITOS ANOPHELES, A PESAR DE LOS AVANCES RECIENTES, NUESTRO CONOCIMIENTO ACTUAL SOBRE LA BASE GENOMICA DE LA ADAPTACION ES TODAVIA LIMITADO, YA QUE LA MAYORIA DE LAS APROXIMACIONES CONTINUAN CENTRANDOSE EN UN SOLO TIPO DE VARIANTE GENETICA: LOS POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEOTIDO, SIN EMBARGO, CADA VEZ HAY MAS DATOS EN DIFERENTES ORGANISMOS QUE DEMUESTRAN QUE LAS VARIANTES ESTRUCTURALES CONTRIBUYEN MAS DIVERSIDAD A NIVEL NUCLEOTIDICO QUE LOS POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEOTIDO Y QUE ESTA VARIACION ES FUNCIONALMENTE RELEVANTE, NUESTRO LABORATORIO ESTA EN LA VANGUARDIA DE LA INVESTIGACION SOBRE EL PAPEL DE LOS ELEMENTOS MOVILES EN LA EVOLUCION ADAPTATIVA, EN ESTE PROYECTO, AVANZAREMOS LA FRONTERA DEL CONOCIMIENTO APLICANDO TECNOLOGIAS DE VANGUARDIA PARA RESOLVER CUATRO PREGUNTAS MUY RELEVANTES E INTERCONECTADAS: (I) ¿CUAL ES EL PAPEL DE LOS ELEMENTOS MOVILES EN LA CAPACIDAD INVASORA DE ESPECIES DE DROSOPHILA?; (II) ¿CUAL ES LA INTERACCION ENTRE ELEMENTOS MOVILES Y CAMBIOS EPIGENETICOS EN LA ESPECIE D, MELANOGASTER ?; (III) ¿CUAL ES EL PAPEL DE LA VARIACION DEL NUMERO DE COPIAS (CNVS, DE SUS SIGLAS EN INGLES) EN LA ADAPTACION AMBIENTAL DE D, MELANOGASTER ?; Y (IV) ¿CUAL ES LA BASE GENOMICA DE LA ADAPTACION URBANA DE MOSQUITOS DEL GENERO ANOPHELES? PARA RESPONDER A ESTAS PREGUNTAS, UTILIZAREMOS LOS DATOS GENOMICOS YA DISPONIBLES EN NUESTRO LABORATORIO, DATOS GENOMICOS Y MUESTRAS COMPARTIDAS EXCLUSIVAMENTE CON NOSOTROS POR NUESTROS COLABORADORES EN LA UNIVERSIDAD DE STANFORD Y EN EL INSTITUT DE RECHERCHE POUR LE DEVELOPPEMENT (IRD), Y TAMBIEN GENERAREMOS NUEVOS DATOS QUE ESTARAN DISPONIBLES PARA LA COMUNIDAD, NUESTRA PROBADA EXPERIENCIA EN GENOMICA DE POBLACIONES, EPIGENETICA, DINAMICA DE ELEMENTOS MOVILES Y APROXIMACIONES FUNCIONALES NOS COLOCA EN LA MEJOR POSICION PARA AVANZAR CON EXITO EN EL CAMPO DE LA GENOMICA DE LA ADAPTACION, ESTE PROYECTO NOS PERMITIRA ABRIR UNA NUEVA LINEA DE INVESTIGACION EN ESPAÑA SOBRE EL PAPEL DE LOS ELEMENTOS MOVILES EN LA CAPACIDAD INVASORA DE LAS ESPECIES, ESTE ES UN TEMA DE GRAN RELEVANCIA, YA QUE ES MUY PROBABLE QUE EL CAMBIO GLOBAL AFECTE LA DISTRIBUCION GEOGRAFICA DE LAS ESPECIES, Y EL AUMENTO DEL COMERCIO Y EL TRANSPORTE INTERNACIONALES HA ACELERADO EL MOVIMIENTO DE ESPECIES NO AUTOCTONAS ENTRE CONTINENTES, ADEMAS, INTEGRAREMOS POR PRIMERA VEZ EL ANALISIS DE VARIANTES DE NUMERO DE COPIAS (CNVS) EN NUESTROS ESTUDIOS DE GENOMICA DE LA ADAPTACION, LO QUE NOS PERMITIRA TENER UNA VISION GLOBAL DEL PROCESO ADAPTATIVO, ESTE PROYECTO PERMITIRA ADEMAS ESTABLECER UNA NUEVA COLABORACION INTERNACIONAL (UNIVERSIDAD DE STANFORD) Y CONTINUAR CON UNA EN CURSO (IRD), Y CONTRATAR A DOS INVESTIGADORES POSTDOCTORALES QUE JUNTO CON LOS MIEMBROS DE NUESTRO LABORATORIO ASEGURARAN LA MASA CRITICA NECESARIA PARA LLEVAR A CABO CON EXITO ESTE PROYECTO Y ASI AVANZAR SUSTANCIALMENTE EL CONOCIMIENTO CIENTIFICO, GENOMICA\VARIANTES ESTRUCTURALES\TRANSCRIPTOMICA\EPIGENOMICA\ADAPTACION\SELECCION NATURAL\ANOPHELES\DROSOPHILA\ELEMENTOS MOVILES\SECUENCIACION DE LECTURAS LARGAS