Descripción del proyecto
LA IDENTIFICACION DE LA BASE GENOMICA DE LA ADAPTACION AMBIENTAL ES UN CAMPO CRECIENTE DE INVESTIGACION, LOS AVANCES EN LA SECUENCIACION DE GENOMAS COMPLETOS Y OTRAS TECNOLOGIAS MASIVAS NOS PERMITEN IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR LOS GENES Y CARACTERES MAS RELEVANTES PARA LA ADAPTACION AMBIENTAL, LA MAYOR PARTE DE NUESTRO CONOCIMIENTO HASTA AHORA PROVIENE DEL ANALISIS DE UN TIPO DE VARIANTE GENETICA: POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEOTIDO (SNPS), OTROS TIPOS DE VARIANTES COMO LAS INSERCIONES DE ELEMENTOS TRANSPONIBLES, QUE SON MUTACIONES COMPLEJAS QUE MUY PROBABLEMENTE DESEMPEÑAN UN PAPEL EN LA ADAPTACION, SE IGNORAN EN GRAN MEDIDA, NUESTRO LABORATORIO ESTA A LA VANGUARDIA DE LA INVESTIGACION ENCAMINADA A CUANTIFICAR LA CONTRIBUCION DE LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES A LA ADAPTACION, SOMOS EXPERTOS EN GENOMICA POBLACIONAL, DINAMICA DE ELEMENTOS TRANSPONIBLES, Y EN LA DETECCION DE LA SELECCION NATURAL, EN ESTE PROYECTO, VAMOS A APLICAR NUESTRA PROBADA EXPERIENCIA EN ESTOS CAMPOS DE INVESTIGACION PARA ELUCIDAR EL PAPEL DE LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES EN LA ADAPTACION EN ANOPHELES Y EN HUMANOS, HEMOS SELECCIONADO CARACTERES QUE YA SE SABE QUE ESTAN INVOLUCRADOS EN LA ADAPTACION EN ESTOS DOS ORGANISMOS: LA CAPACIDAD DE ANOPHELES PARA PROSPERAR EN ENTORNOS URBANOS, Y LA CAPACIDAD DE LAS POBLACIONES HUMANAS PARA SOBREVIVIR EN GRANDES ALTITUDES, ENTORNOS TOXICOS, ALTAS TEMPERATURAS Y PATOGENOS, ENTENDER LA ADAPTACION A LOS AMBIENTES URBANOS EN MOSQUITOS ANOPHELES ES MUY RELEVANTE PORQUE TIENE CONSECUENCIAS DIRECTAS PARA LA CAPACIDAD DE ESTOS MOSQUITOS DE TRANSMITIR LA MALARIA, LA ADAPTACION DE LAS POBLACIONES HUMANAS A GRANDES ALTITUDES, ENTORNOS TOXICOS, ALTAS TEMPERATURAS Y PATOGENOS IMPLICA VARIAS VIAS DE RESPUESTA A ESTRES: HIPOXIA, METALES PESADOS, XENOBIOTICOS, CALOR, INMUNIDAD Y ESTRES OXIDATIVO, ESTAS VIAS ESTAN DIRECTAMENTE RELACIONADAS CON MULTIPLES ENFERMEDADES HUMANAS INCLUYENDO PATOLOGIAS NEURODEGENERATIVAS Y CANCER, UTILIZAREMOS LOS ULTIMOS AVANCES TECNOLOGICOS EN TECNICAS DE SECUENCIACION DE "LONG READS" PARA GENERAR LA ANOTACION "DE NOVO" DE ELEMENTOS TRANSPONIBLES EN LOS GENOMAS DE ANOPHELES, A CONTINUACION, UTILIZAREMOS METODOLOGIAS DE VANGUARDIA PARA BUSCAR SEÑALES DE SELECCION QUE SUGIERAN QUE LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES IDENTIFICADOS SON REALMENTE ADAPTATIVOS, PARA IDENTIFICAR EL PAPEL DE LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES EN LA ADAPTACION AMBIENTAL HUMANA, APROVECHAREMOS LA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION YA DISPONIBLE PARA NUESTRA ESPECIE, COMPLEMENTAREMOS ESTE ANALISIS "IN SILICO" CON LA VALIDACION FUNCIONAL DE UN SUBCONJUNTO DE LAS INSERCIONES DE ELEMENTOS TRANSPONIBLES IDENTIFICADOS, SI ES FINANCIADO, ESTE PROYECTO NOS PERMITIRA ESTABLECER DOS NUEVAS LINEAS DE INVESTIGACION EN ESPAÑA QUE AUMENTARAN CONSIDERABLEMENTE NUESTRA VISIBILIDAD INTERNACIONAL Y NUESTRA CAPACIDAD PARA SOLICITAR Y OBTENER FINANCIACION TANTO A NIVEL NACIONAL COMO INTERNACIONAL, GENÓMICA DE POBLACIONES\ELEMENTOS MÓVILES\ADAPTACIÓN\SELECCIÓN NATURAL