Descripción del proyecto
ERWINIA AMYLOVORA ES EL ORGANISMO DE CUARENTENA RESPONSABLE DEL FUEGO BACTERIANO DE LAS ROSACEAS, LA ENFERMEDAD PUEDE AFECTAR A PERAL, MANZANO Y NISPERO Y A DIVERSAS ORNAMENTALES CULTIVADAS EN ESPAÑA, ESTA BACTERIA Y LA ENFERMEDAD QUE CAUSA HAN SIDO OBJETO DE ESTUDIO EN CUATRO PROYECTOS CICYT, QUE ABORDARON LA PUESTA A PUNTO DE SISTEMAS DE DIAGNOSTICO, LA CARACTERIZACION DE CEPAS ESPAÑOLAS Y ASPECTOS POCO CONOCIDOS DE SU BIOLOGIA, CON EL FIN DE OPTIMIZAR LAS ESTRATEGIAS DE LUCHA PREVENTIVA CONTRA LA ENFERMEDAD,LOS ESTUDIOS DE VARIABILIDAD DE AISLADOS ESPAÑOLES HAN DEMOSTRADO LA EXISTENCIA DE CEPAS CARENTES DEL PLASMIDO PEA29, QUE SE CONSIDERABA UNIVERSAL PARA ESTE PATOGENO, Y SE HA DESCUBIERTO UN NUEVO PLASMIDO (PEI70) NO DESCRITO ANTERIORMENTE, SE HA PUESTO A PUNTO UN SISTEMA DE DETECCION DE AMBOS PLASMIDOS EN UN SOLO ANALISIS MEDIANTE PCR DUPLEX, Y SE HA LLEVADO A CABO UNA BUSQUEDA EN CEPAS ESPAÑOLAS Y DE DISTINTAS COLECCIONES EUROPEAS DE AISLADOS QUE CARECIERAN DEL PEA29, O QUE POSEYERAN EL NUEVO PLASMIDO PEI70, LOS ANALISIS REALIZADOS HAN PERMITIDO DESCUBRIR HASTA AHORA OCHO CEPAS (EN CUATRO PAISES EUROPEOS) CARENTES DEL PEA29 Y UNA AMPLIA DISTRIBUCION DEL PEI70 EN AISLADOS DE DIEZ PAISES EUROPEOS, LO QUE HACE QUE DESPUES DEL PLASMIDO PEA29, EL PEI70 SEA EL DE MAYOR PRESENCIA EN CEPAS DE E, AMYLOVORA, ESTE PLASMIDO SE ENCUENTRA MAYORITARIAMENTE EN CEPAS QUE POSEEN EL PEA29, PERO TAMBIEN SE HAN ENCONTRADO VARIAS CEPAS QUE SOLO POSEEN ESTE NUEVO PLASMIDO, SE DISPONE YA DE LA SECUENCIA COMPLETA DE PEI70, POR LO QUE EN ESTE NUEVO PROYECTO SE REALIZARA SU ANALISIS Y ANOTACION, Y SE COMPARARA SU SECUENCIA CON LAS DE OTROS GENOMAS DISPONIBLES EN OTRAS BACTERIAS, TAMBIEN SE ESTUDIARA EL EFECTO DE ESTOS PLASMIDOS EN LA VIRULENCIA DE E, AMYLOVORA Y EN SU CAPACIDAD ADAPTATIVA A DISTINTAS SITUACIONES DE ESTRES, ADEMAS SE PRETENDE OBTENER LA SECUENCIA COMPLETA DE OTRO PLASMIDO PRESENTE EN E, PIRIFLORINIGRANS, OTRA ESPECIE DE ERWINIA PATOGENA DE PERAL DESCUBIERTA EN ESPAÑA, Y REALIZAR LA COMPARACION DE SU CONTENIDO GENETICO CON LOS PLASMIDOS PRESENTES EN E, AMYLOVORA (PEA29, PEI70) Y E, PYRIFOLIAE (PEP36), OTRO PATOGENO DE PERAL TAXONOMICAMENTE CERCANO, LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN PROYECTOS ANTERIORES HAN DEMOSTRADO QUE E, AMYLOVORA NO SIEMPRE ENCUENTRA EN ESPAÑA LAS CONDICIONES ADECUADAS PARA SU MULTIPLICACION Y QUE TANTO LOS TRATAMIENTOS CUPRICOS COMO LA ESCASEZ DE NUTRIENTES, Y CIERTAS TEMPERATURAS, PUEDEN SUPONER UN ESTRES PARA SU SUPERVIVENCIA, COMO RESPUESTA FRENTE A ESTAS CONDICIONES, LA BACTERIA PUEDE ADOPTAR EL ESTADO VBNC U OTROS TIPOS DE ESTRATEGIAS QUE DEBEN SER ESTUDIADAS, POR ELLO, EN ESTE PROYECTO SE ABORDARIAN TAMBIEN LOS CAMBIOS CELULARES, LA PRODUCCION DE MOLECULAS SEÑAL, LA EXPRESION DEL GEN RPOS, QUE CODIFICA UNA PROTEINA DE ESTRES, Y DE OTROS GENES DE INTERES, CON TODO ELLO SE ESPERA OBTENER NUEVA INFORMACION SOBRE LOS FACTORES DE VIRULENCIA DE E, AMYLOVORA Y SU ADAPTACION A DISTINTAS SITUACIONES DE ESTRES, PARA MEJORAR EL CONOCIMIENTO DE SU CICLO BIOLOGICO EN LAS CONDICIONES ESPAÑOLAS, Fuego bacteriano\frutales\ornamentales\supervivencia\cobre\VBNC\chip de ADN\hibridación substractiva\cambios moleculares