Descripción del proyecto
LA FORMACION DE LINAJES BACTERIANOS POR MECANISMOS EPIGENETICOS ES UN FENOMENO CON INTERES ACADEMICO Y APLICADO, DESDE EL PUNTO DE VISTA DE LA BIOLOGIA FUNDAMENTAL, LA EXISTENCIA DE DIVERSIDAD FENOTIPICA DESAFIA LA VISION TRADICIONAL DE LAS BACTERIAS COMO POBLACIONES CLONALES FORMADAS POR ORGANISMOS IDENTICOS, ADEMAS, LA FORMACION DE LINAJES FENOTIPICOS TIENE UN PAPEL RELEVANTE EN INTERACCIONES PATOGENO-HOSPEDADOR Y EN LA ADAPTACION BACTERIANA A CONDICIONES AMBIENTALES CAMBIANTES Y/O HOSTILES, SALMONELLA ENTERICA ES UN ORGANISMO APROPIADO PARA EL ESTUDIO DE MECANISMOS EPIGENETICOS POR LOS MOTIVOS SIGUIENTES: (I) ES UN PATOGENO HUMANO RELEVANTE; (II) ES UN ORGANISMO MODELO EN GENETICA Y EN PATOGENESIS BACTERIANA; (III) ESTUDIOS PREVIOS, INCLUIDOS LOS DEL GRUPO SOLICITANTE, HAN MOSTRADO QUE LA FORMACION DE LINAJES ES ESENCIAL PARA LA PATOGENESIS, LA CONTINUACION DE LOS ESTUDIOS DEL GRUPO SOBRE MECANISMOS EPIGENETICOS EN SALMONELLA CONTRIBUIRA AL ESTABLECIMIENTO DE UN CONCEPTO RELATIVAMENTE NUEVO EN BIOLOGIA: QUE LA FORMACION DE LINAJES POR MECANISMOS NO MUTACIONALES ES PARTE INTRINSECA DEL MODO DE VIDA BACTERIANO, EL PROYECTO PROPONE LA INVESTIGACION DE DOS TIPOS DE MECANISMOS EPIGENETICOS QUE CONTROLAN GENES DE SALMONELLA RELACIONADOS CON LA VIRULENCIA GENERANDO LINAJES FENOTIPICOS:1, SISTEMAS DE VARIACION DE FASE Y DE EXPRESION GENICA BIESTABLE CONTROLADOS POR METILACION DAM, EL PROYECTO ANALIZARA A NIVEL MOLECULAR EL SISTEMA DE VARIACION DE FASE OPVAB, QUE GENERA SUBPOBLACIONES RESISTENTES A FAGOS Y CONTROLA LA PROLIFERACION EN MACROFAGOS, Y EL OPERON FIMBRIAL STD, QUE CONTROLA LA ADHESION DE SALMONELLA AL EPITELIO INTESTINAL Y REGULA LA EXPRESION BIESTABLE DE LA ISLA DE PATOGENICIDAD 1, ADEMAS, EL PROYECTO CARACTERIZARA 20 LOCI DE VARIACION DE FASE IDENTIFICADOS POR ANALISIS BIOINFORMATICO, MUCHOS DE ELLOS CON FUNCION DESCONOCIDA, EL PROYECTO TAMBIEN PROPONE DIFERENCIAR LA VARIACION DE FASE INDEPENDIENTE DE LA VARIACION DE FASE COORDINADA, ESTE TIPO DE ANALISIS PERMITIRA ESTIMAR LA CAPACIDAD DE LA METILACION DAM PARA GENERAR HETEROGENEIDAD FENOTIPICA EN SALMONELLA, TEORICAMENTE, VEINTE LOCI CON VARIACION DE FASE INDEPENDIENTE PODRIAN GENERAR 2(ELEVADO A)20 TIPOS DE CELULAS,2, FORMACION DE LINAJES INDEPENDIENTE DE METILACION DAM, DIFERENCIAS ENTRE CELULAS GENERADAS POR RUIDO EN PROMOTORES O POR AMPLIFICACION GENICA PREADAPTAN SUBPOBLACIONES DE CELULAS A RESISTIR UNA SELECCION LETAL (EJ, BILIS), SI EL ESTADO QUE PERMITE LA SUPERVIVENCIA ES PROPAGADO POR UN LAZO AUTOCATALITICO SE FORMA UNA POBLACION DE CELULAS RESISTENTES, EL PROYECTO PROPONE LA DISECCION DE UNA RESPUESTA DE ESTE TIPO, DEBIDA A ACTIVACION HETEROGENEA DE LA RESPUESTA GENERAL A ESTRES DEPENDIENTE DE RPOS, DICHA RESPUESTA CONFIERE RESISTENCIA A BILIS Y PRESUNTAMENTE A OTRAS CONDICIONES ADVERSAS,EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS QUE GENERAN LINAJES FENOTIPICOS PUEDE AYUDAR A ENTENDER FENOMENOS RELEVANTES PARA LA SALUD HUMANA COMO LA PERSISTENCIA BACTERIANA, LA INFECCION CRONICA, LA EVASION DE DEFENSAS DEL HUESPED Y LA RESISTENCIA NO MUTACIONAL A ANTIBACTERIANOS, ADEMAS, EL PROYECTO TIENE APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS:1, DESARROLLO DE FARMACOS EPIGENETICOS PARA TERAPIA ANTIBACTERIANA (INHIBIDORES DE LA METILASA DAM, INHIBIDORES DE VARIACION DE FASE, ETC,),2, DISEÑO DE INGENIOS CONTROLADOS POR METILACION DAM PARA CONSTRUIR INTERRUPTORES, SENSORES, SISTEMAS DE MEMORIA Y OTROS INGENIOS DE BIOLOGIA SINTETICA CON APLICACIONES BIOMEDICAS E INDUSTRIALES, SALMONELLA\ METILACIÓN DAM\ VARIACIÓN DE FASE\ EXPRESIÓN GÉNICA BIESTABLE\ LINAJES BACTERIANOS\ RESISTENCIA A BILIS\ RESPUESTA GENERAL A ESTRÉS\ INHIBIDORES DE LA METILASA DAM