Descripción del proyecto
EL OBJETIVO GENERAL DE MIAU-S3 ES CARACTERIZAR Y COMPRENDER LA NATURALEZA DE LOS CAMBIOS TRANSITORIOS O LOCALIZADOS EN LA ESTRUCTURA DE LA COMUNIDAD MICROBIANA Y SUS EFECTOS EN EL FUNCIONAMIENTO DEL OCEANO MEDIANTE EL MUESTREO EN CORTAS ESCALAS TEMPORALES Y PEQUEÑAS ESCALAS ESPACIALES, MIENTRAS QUE LOS TIEMPOS DE GENERACION MICROBIANOS SON DEL ORDEN DE HORAS A DIAS, EL MUESTREO DE PLANCTON SE REALIZA PRINCIPALMENTE EN ESCALAS TEMPORALES MUCHO MAYORES, ADEMAS, LOS CAMBIOS TRANSITORIOS A MENUDO SE DEBEN A EVENTOS DE DOMINACION DE LA COMUNIDAD POR PARTE DE UN SOLO ORGANISMO (LLAMADOS "BLOOMERS" O BACTERIAS CON UN ESTILO DE VIDA OPORTUNISTA"), QUE TIENDEN A EXISTIR EN AMBIENTES LOCALIZADOS Y DURAN POR CORTOS PERIODOS DE TIEMPO, EL MUESTREO EN GRADIENTES ESPACIALES LIMITADOS O ESCALAS TEMPORALES CORTAS PROPORCIONALES A LA TASA DE CRECIMIENTO DE LOS MICROBIOS PERMITIRA I) DETERMINAR EL PAPEL DE LOS PROCESOS DE SELECCION (SELECCION POR EL MEDIO AMBIENTE) Y LOS PROCESOS ALEATORIOS (EFECTOS DE PRIORIDAD, DISPERSION DESDE AMBIENTES ADYACENTES, DERIVA ECOLOGICA) EN LA DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA DE LA COMUNIDAD; II) DETERMINAR EL GRADO DE CONECTIVIDAD ENTRE LAS COMUNIDADES CERCANAS (EN EL TIEMPO O EN EL ESPACIO) Y EXPLORAR HIPOTESIS SOBRE LA DIRECCIONALIDAD DE ESA CONEXION; Y III) PROBAR EXPERIMENTALMENTE LA PREVISIBILIDAD DE TALES EVENTOS DE FLORECIMIENTO DETERMINANDO SI ESTAS SITUACIONES ESTAN BASADAS EN NICHOS (ES DECIR, EL ORGANISMO FLORECIENTE ES EL QUE MEJOR SE ADAPTA A ESA CARACTERISTICA AMBIENTAL PARTICULAR, Y POR LO TANTO LA FLORACION ES POTENCIALMENTE PREDECIBLE) O SI LOS PROCESOS ESTOCASTICOS O LOS EFECTOS PRIORITARIOS (ES DECIR, LA SECUENCIA DE LLEGADA) DETERMINAR LA IDENTIDAD DEL ORGANISMO, FINALMENTE, IV) SE INTENTARA EL AISLAMIENTO Y LA SECUENCIACION GENOMICA DE LOS BLOOMERS BACTERIANOS, ADEMAS SE RECONSTRUIRAN GENOMAS A PARTIR DEL ENSAMBLADO DE DATOS DE METAGENOMAS A ORIGINADOS EN CONJUNTOS DE DATOS ANTERIORES PARA OBTENER PISTAS SOBRE LAS BASES GENOMICAS DEL COMPORTAMIENTO DE LOS BLOOMERS Y LOS MECANISMOS DE ENSAMBLADO DE LA COMUNIDAD EN ESTAS SITUACIONES,EL PROYECTO PROPORCIONARA INFORMACION RELEVANTE PARA COMPRENDER LAS CAUSAS QUE SUBYACEN EN LOS EVENTOS DE DOMINIO BACTERIANO DE UN SOLO ORGANISMO, QUE PUEDEN TENER IMPLICACIONES PARA LA SALUD HUMANA EN EL OCEANO Y EN OTROS ECOSISTEMAS Y PUEDEN ALTERAR DESPROPORCIONADAMENTE LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS, Y COMO LA ESTRUCTURA Y COMPOSICION DE LA COMUNIDAD BACTERIANA RESIDENTE ALTERAN EL EXITO DE ESTOS BLOOMERS BACTERIANOS,LOS OBJETIVOS DE MIAU-S3 SE ABORDARAN CON 3 ACTIVIDADES DE MUESTREO (UNA DE MUESTREO SUB DIARIA EN UN SITIO COSTERO, Y DOS CRUCEROS QUE MUESTREAN SISTEMAS ESPACIALMENTE ALTAMENTE ORGANIZADOS: EL MAXIMO PROFUNDO DE CLOROFILA (DCM) EN EL NO MEDITERRANEO Y LA PLUMA DEL DELTA DEL EBRO) EN EL QUE DETERMINAREMOS LA ESTRUCTURA Y LA FUNCION DE LA COMUNIDAD MICROBIANA (ES DECIR, PROCARIOTA Y EUCARIOTA PEQUEÑA); UNA SERIE DE EXPERIMENTOS EN LOS CUALES PROMOVEREMOS EL FLORECIMIENTO DE ESPECIES MICROBIANAS; Y UNA SERIE DE ESFUERZOS PARA CARACTERIZAR TANTAS ESPECIES DE LAS QUE FLORECEN COMO SEA POSIBLE, YA SEA A TRAVES DEL AISLAMIENTO Y LA SECUENCIACION DEL GENOMA, O MEDIANTE LA RECONSTRUCCION DE GENOMAS A PARTIR DE METAGENOMAS, TAMBIEN ADAPTAREMOS Y ESTABLECEREMOS DIVERSAS METODOLOGIAS NECESARIAS: AMPLIFICACION DE DNA A PARTIR DE MUESTRAS PEQUEÑAS, DETERMINACION DE ABUNDANCIA DE PROCARIOTAS MEDIANTE LA AUTOMATIZACION DE LA CITOMETRIA DE FLUJO, ETC, PROCARIOTAS\OCEANO COSTERO\ESTRUCTURA DE COMUNIDAD\AISLADOS BACTERIANOS\FORMACIÓN DE LA COMUNIDAD\BIOGEOQUÍMICA