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CTM2013-48292-C3-3-R

Financiado
ECOLOGIA DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS: BIODIVERSIDAD, GENOMICA Y METAGENOMICA
LOS OCEANOS CONSTITUYEN EL ECOSISTEMA MAS GRANDE DE LA TIERRA Y UNO DE LOS MAS DESCONOCIDOS, LAS ACTIVIDADES DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS REGULAN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS Y TIENEN UNA GRAN INFLUENCIA EN EL CONTROL DE CLIMA, ADE... LOS OCEANOS CONSTITUYEN EL ECOSISTEMA MAS GRANDE DE LA TIERRA Y UNO DE LOS MAS DESCONOCIDOS, LAS ACTIVIDADES DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS REGULAN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS Y TIENEN UNA GRAN INFLUENCIA EN EL CONTROL DE CLIMA, ADEMAS, CASI LA MITAD DE LA POBLACION HUMANA VIVE CERCA DEL MAR Y, POR TANTO, LA HUMANIDAD EJERCE UN FUERTE IMPACTO SOBRE LOS OCEANOS Y, AL CONTRARIO, DEPENDE EN GRAN MEDIDA DE SUS SERVICIOS, POR ESTAS RAZONES LA INVESTIGACION MARINA HA SIDO CONSIDERADA UNO DE LOS RETOS SOCIALES EN EL PROGRAMA HORIZONTE 2020, EN EL PROYECTO PRESENTE PLANEAMOS ESTUDIAR ALGUNOS ASPECTOS DE LA DIVERSIDAD, LA ESTRUCTURA Y LAS CAPACIDADES FUNCIONALES DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS MARINAS, NUESTRO PUNTO DE PARTIDA ES QUE LA DISPONIBILIDAD DE UNA CANTIDAD ENORME DE SECUENCIAS DE LOS OCEANOS ABRE UNA VENTANA DE OPORTUNIDAD PARA RESOLVER CUESTIONES QUE NO PODRIA SER ANALIZADAS ANTES DEL ADVENIMIENTO DE LA GENOMICA Y LA METAGENOMICA,EL PROYECTO COORDINA TRES SUBPROYECTOS CON INTERESES COMUNES PERO CON APROXIMACIONES DIFERENTES, EL PRIMER SUBPROYECTO SE DEDICARA A LA DIVERSIDAD DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS, PARA ESTE FIN, SE UTILIZARAN SECUENCIAS ETIQUETA (TAGS) DEL GEN 16S RDNA PARA EXPLORAR LA BIOSFERA DE LOS MICROORGANISMOS RAROS: EL CONJUNTO DE UN NUMERO MUY ELEVADO DE ESPECIES CON ABUNDANCIAS EXTRAORDINARIAMENTE BAJAS, INTENTAREMOS DETERMINAR EL NUMERO TOTAL DE TAXONES BACTERIANOS EN LOS OCEANOS Y PONDREMOS A PUNTO UN METODO PARA ANALIZAR LAS CURVAS RANGO-ABUNDANCIA QUE ESPERAMOS REVELARA PROPIEDADES ECOLOGICAS DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS, EL SEGUNDO SUBPROYECTO ANALIZARA LAS COMUNIDADES UTILIZANDO LA METAGENOMICA Y LA METATRANSCRIPTOMICA, UNA PARTE DE ESTE SP2 SE SOLAPARA CON EL SP1 PARA COMPARAR LA DIVERSIDAD REVELADA POR LAS SECUENCIAS ETIQUETA CON LA DERIVADA DE LOS METAGENOMAS, UN COMPONENTE IMPORTANTE DE ESTE SP2 SERA LA COMPARACION DE COMUNIDADES BASANDOSE EN LA FILOGENIA Y EN LAS FUNCIONES QUE CONTIENE, A PARTIR DE LA COEXISTENCIA EN DISTINTAS COMUNIDADES, SE ESTABLECERAN REDES DE ASOCIACION ENTRE TAXONES BACTERIANOS CON EL FIN, NUEVAMENTE, DE DERIVAR PROPIEDADES DE LAS COMUNIDADES, EL TERCER SUBPROYECTO PRESTARA ATENCION A UN GRUPO MODELO DE BACTERIAS MARINAS, POLARIBACTER, UN GENERO DENTRO DEL GRAN GRUPO DE LOS BACTEROIDETES, ESTE GENERO ES RELATIVAMENTE ABUNDANTE EN LOS OCEANOS, PARTICULARMENTE EN AGUAS POLARES, ALGUNOS DE SUS MIEMBROS CONTIENEN EL GEN DE LA PROTEORRODOPSINA, UNA PROTEINA QUE PERMITE A LAS BACTERIAS UTILIZAR ENERGIA DE LA LUZ, SP3 ANALIZARA LA REGULACION Y LA RELACION DE ESTE GRUPO DE BACTERIAS CON LA LUZ, SE AISLARAN MIEMBROS DEL GENERO EN CULTIVO PURO Y SE SECUENCIARAN SUS GENOMAS, TAMBIEN SE OBTENDRAN GENOMAS AMPLIFICADOS A PARTIR DE CELULAS INDIVIDUALES (SAGS), ESTOS GENOMAS SE UTILIZARAN PARA ESTUDIAR LAS CAPACIDADES DE POLARIBACTER Y SE COMPARARAN CON LAS SECUENCIAS DE BACTEROIDETES DERIVADAS DE METAGENOMAS EN EL SP2, FINALMENTE, SE LLEVARAN A CABO EXPERIMENTOS PARA DETERMINAR LA EXPRESION GENICA DE ESTAS BACTERIAS BAJO DIFERENTES CONDICIONES DE LUZ OSCURIDAD Y LOS RESULTADOS SE COMPARARAN CON LOS OBTENIDOS A PARTIR DE METATRANSCRIPTOMAS EN EL SP2, EL OBJETIVO DE ESTE SP3 ES COMPRENDER COMO FUNCIONA EL CONTROL DEL METABOLISMO Y LA GESTION DEL METABOLISMO EN PRESENCIA DE LA LUZ EN UNA BACTERIA HETEROTROFICA,LOS RESULTADOS TENDRAN UN IMPACTO CIENTIFICO SIGNIFICATIVO EN EL CAMPO DE LA OCEANOGRAFIA MICROBIANA Y ESPERAMOS QUE ABRAN NUEVAS VIAS PARA COMPRENDER LA ECOLOGIA DE LOS OCEANOS, OCEANOGRAFÍA\ ECOLOGÍA MICROBIANA\ BACTERIOPLANCTON\ POLARIBACTER\ DIVERSIDAD\ METAGENÓMICA\ METATRANSCRIPTÓMICA\ PROTEORRODOPSINA\ BIOINFORMÁTICA\ COMUNIDADES MICROBIANAS ver más
01/01/2013
ULL
109K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 109K€
Líder del proyecto
UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Total investigadores 678