EL OBJETIVO DE OXYLIPIDS ES PRODUCIR COMPUESTOS BIO-BASADOS DE INTERES INDUSTRIAL, PARA SUSTITUIR COMPUESTOS DERIVADOS DEL PETROLEO, A PARTIR DE LA OXIGENACION SELECTIVA DE LIPIDOS VEGETALES UTILIZANDO PEROXIGENASA DISEÑADAS COMPU...
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Descripción del proyecto
EL OBJETIVO DE OXYLIPIDS ES PRODUCIR COMPUESTOS BIO-BASADOS DE INTERES INDUSTRIAL, PARA SUSTITUIR COMPUESTOS DERIVADOS DEL PETROLEO, A PARTIR DE LA OXIGENACION SELECTIVA DE LIPIDOS VEGETALES UTILIZANDO PEROXIGENASA DISEÑADAS COMPUTACIONALMENTE. EN ESTE CONTEXTO, EL USO DE PEROXIGENASAS INESPECIFICAS (UPOS) COMO BIOCATALIZADORES PARA REACCIONES OXIGENATIVAS DE EPOXIDACION E HIDROXILACION REQUIERE LA EXPRESION Y CARACTERIZACION DE NUEVAS ENZIMAS, ASI COMO EL AJUSTE DE SUS PROPIEDADES CATALITICAS Y OPERACIONALES MEDIANTE MANIPULACION GENETICA, LO CUAL ES POSIBLE MEDIANTE EL EMPLEO DE HERRAMIENTAS DE INGENIERIA DE PROTEINAS.TENIENDO EN CUENTA ESTAS NECESIDADES, EL SUBPROYECTO 1 CONTRIBUIRA A OXYLIPIDS COMO LA CONEXION NECESARIA ENTRE LOS ESTUDIOS COMPUTACIONALES (TEORICOS) DE LAS ENZIMAS QUE SE DESARROLLARAN EN EL BSC Y LOS ESTUDIOS DE APLICACION (EXPERIMENTALES) DE ESTAS ENZIMAS QUE LLEVARA A CABO EL GRUPO DEL IRNAS. ASI, EN EL SUBPROYECTO 1, EL GRUPO DEL CIB CONVERTIRA LAS SECUENCIAS DE UPOS NUEVAS Y DISEÑADAS IN SILICO (OBTENIDAS EN EL SUBPROYECTO 3) EN ENZIMAS CATALITICAMENTE ACTIVAS PARA SU POSTERIOR UTILIZACION EN LAS REACCIONES DE OXIGENACION QUE SE OPTIMIZARAN EN EL SUBPROYECTO 2. CON ESTE FIN, SE HA SELECCIONADO ESCHERICHIA COLI COMO EL HUESPED DE EXPRESION MAS ADECUADO. SE EVALUARAN DIFERENTES APROXIMACIONES PARA LA OBTENCION DE PEROXIGENASAS SOLUBLES Y ACTIVAS UTILIZANDO ESTE ORGANISMO, INCLUYENDO EL USO DE MEDIOS DE AUTOINDUCCION Y CRECIMIENTO LENTO, ASI COMO SU EXPRESION COMO PROTEINAS DE FUSION O CO-EXPRESION CON CHAPERONAS MOLECULARES QUE CONTRIBUYAN A FACILITAR EL PLEGAMIENTO POSTRADUCCIONAL. LA POSTERIOR PURIFICACION Y CARACTERIZACION FISICOQUIMICA DE LAS ENZIMAS PROPORCIONARA NUEVOS BIOCATALIZADORES CUYAS PROPIEDADES CATALITICAS Y ESTABILIDAD SERAN EVALUADAS, PROPORCIONANDO ASI LAS CONDICIONES EXPERIMENTALES PARA LOS ESTUDIOS INICIALES DE OXIGENACION QUE SE OPTIMIZARAN POSTERIORMENTE EN EL SUBPROYECTO 2.LOS ESTUDIOS ESTRUCTURA-FUNCION DERIVADOS DE LOS ANALISIS DE ACTIVIDAD/ESTABILIDAD ANTERIORES Y DE LAS SIMULACIONES COMPUTACIONALES BASADAS EN MODELOS TEORICOS Y/O CRISTALOGRAFICOS, OBTENIDOS POR DIFRACCION DE RAYOS X, SE UTILIZARAN PARA LA POSTERIOR MEJORA DE LAS PEROXIGENASAS MEDIANTE INGENIERIA ENZIMATICA GUIADA COMPUTACIONALMENTE. LOS AMINOACIDOS IMPLICADOS EN LA UNION AL SUSTRATO Y EN LA ESTABILIDAD DE LAS PROTEINAS SE MUTARAN PARA MEJORAR LA CAPACIDAD DE TRANSFERENCIA DE OXIGENO Y LA ESTABILIDAD DE LAS ENZIMAS ANTE DIFERENTES FACTORES. TRAS EXPRESION HETEROLOGA, PURIFICACION Y CARACTERIZACION DE LAS VARIANTES MUTADAS, SE LLEVARA A CABO UN ANALISIS DE LAS MEJORAS OBSERVADAS EN LAS REACCIONES DE EPOXIDACION E HIDROXILACION DE ACIDOS GRASOS INSATURADOS CATALIZADAS POR ESTAS ENZIMAS EN EL SUBPROYECTO 2. EN BASE A ESTOS RESULTADOS EXPERIMENTALES Y A LOS ANALISIS COMPUTACIONALES DE LAS NUEVAS VARIANTES DISEÑADAS EN EL SUBPROYECTO 3, SE ABORDARAN EXPERIMENTOS DE INGENIERIA ADICIONALES PARA MEJORAR AUN MAS LA EPOXIDACION O LA HIDROXILACION DE ACIDOS GRASOS INSATURADOS ESPECIFICOS, ASI COMO LA ACTIVIDAD DE OXIGENACION REGIOSELECTIVA O ENANTIOSELECTIVA Y/O LA ESTABILIDAD DE LAS ENZIMAS. RODUCTOS BIOBASADOS\PELE\ALPHAFOLD\DISEÑO DE ENZIMAS\BIOPROSPECCION\INTELIGENCIA ARTIFICIAL\OXIFUNCIONALIZACION\LIPIDOS VEGETALES\PEROXIGENASAS\SUPERCOMPUTACION
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