Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO TIENE COMO PRINCIPAL OBJETIVO EXTENDER LOS AVANCES EN NUEVAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION A LA OBTENCION DE LA SECUENCIA GENOMICA COMPLETA DE BACTERIAS DE DIFICIL CULTIVO A PARTIR DE MUESTRAS NO CULTIVADAS, TANTO CLINICAS COMO AMBIENTALES, DADA LA EXPERIENCIA PREVIA DEL EQUIPO INVESTIGADOR, ADEMAS DE TRABAJAR CON LAS TRES PRINCIPALES BACTERIAS TRANSMITIDAS POR VIA SEXUAL (CHLAMYDIA TRACHOMATIS, NEISSERIA GONORRHOEAE Y TREPONEMA PALLIDUM), NOS PROPONEMOS CONTINUAR CON EL ESTUDIO DE POBLACIONES NATURALES DE LEGIONELLA PNEUMOPHILA ASI COMO REALIZAR EL ANALISIS GENOMICO DE LA VARIACION INTRAPACIENTE, EN EL TIEMPO Y EL ESPACIO, DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA, CON ELLO PRETENDEMOS RESPONDER A UNO DE LOS GRANDES RETOS ACTUALES DE LA SALUD PUBLICA, LA EXTENSION DE LAS RESISTENCIAS A ANTIBIOTICOS, ASI COMO MEJORAR LA VIGILANCIA Y CONTROL EPIDEMIOLOGICO DE LAS MISMAS Y FACILITAR HERRAMIENTAS PARA EL ESTUDIO DE BROTES TANTO COMUNITARIOS (LEGIONELOSIS) COMO NOSOCOMIALES (P, AERUGINOSA),EL PROYECTO SE DESARROLLARA EN DOS EJES PRINCIPALES, EL PRIMERO SE CENTRA EN EL ESTUDIO GENOMICO DE BACTERIAS NO CULTIVADAS Y DISTINGUIMOS DOS SUBPROYECTOS, EN EL PRIMERO ANALIZAREMOS MUESTRAS CLINICAS DE MADRID, CATALUÑA Y LA COM, VALENCIANA DE LAS TRES BACTERIAS ASOCIADAS A ITS ANTES CITADAS, EN EL GRUPO DE TRABAJO SE INCORPORARAN FACULTATIVOS E INVESTIGADORES DE HOSPITALES Y CENTROS DE ATENCION PRIMARIA DE ESAS COMUNIDADES, NOS PROPONEMOS OBTENER LA SECUENCIA DE UNAS 300 MUESTRAS DE CADA ITS, DISTRIBUIDAS ENTRE LAS TRES COMUNIDADES AUTONOMAS, ELLO NOS PERMITIRA OBTENER ESTIMAS DE LA DINAMICA EPIDEMICA TANTO DENTRO COMO ENTRE COMUNIDADES, PARA OBTENER LA SECUENCIA GENOMICA DE LAS BACTERIAS DE INTERES UTILIZAREMOS UN METODO DE ENRIQUECIMIENTO POR CAPTURA EN COLABORACION CON EL DR, KRAUSE (UNIV, TUEBINGEN) Y LA DRA, ARORA (UNIV, ZURICH), LA INFORMACION OBTENIDA, ADEMAS, SERVIRA PARA ANALIZAR A NIVEL GENOMICO LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS, UN PROCESO ESPECIALMENTE PREOCUPANTE EN EL CASO DE N, GONORRHOEAE, PERMITIENDO LA DETECCION DE NUEVAS MUTACIONES QUE LA PRODUZCAN Y LA IDENTIFICACION DE NUEVAS CEPAS PORTADORAS, EN ESTE APARTADO, ESTUDIAREMOS LA VARIACION GENOMICA DE L, PNEUMOPHILA MUESTREADA EN BIOPELICULAS, YA QUE ESTAS REPRESENTAN EL RESERVORIO AMBIENTAL MAS IMPORTANTE DE LA BACTERIA ANTES DE SU DISPERSION POR MICROGOTAS QUE PUEDEN INFECTAR A PERSONAS SUSCEPTIBLES, ORIGINANDO BROTES COMUNITARIOS DE LEGIONELOSIS, ADEMAS DE INDAGAR SOBRE LA ESTRUCTURA Y VARIABILIDAD A ESCALA MICROESPACIAL DE ESTA ESPECIE, LA INFORMACION OBTENIDA ES DE GRAN RELEVANCIA PARA LA IDENTIFICACION Y CONTROL DE LAS FUENTES DE BROTES DE LEGIONELOSIS, EL SEGUNDO EJE PRINCIPAL DEL PROYECTO ES ESTUDIAR LA ESTRUCTURA Y VARIACION GENOMICA EN P, AERUGINOSA, UNO DE LOS PATOGENOS MAS PREVALENTES EN LAS INFECCIONES NOSOCOMIALES Y CON GRAN CARGA DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS, NOS INTERESA ANALIZAR LA VARIACION ENTRE AISLADOS OBTENIDOS A DISTINTOS TIEMPOS Y EN DISTINTOS ORGANOS EN PACIENTES INFECTADOS DE FORMA CRONICA O QUE NO RESPONDEN AL TRATAMIENTO, PERO NO AFECTADOS DE FIBROSIS QUISTICA, EN ESTE CASO DISPONEMOS DE UNA COLECCION DE MAS DE 100 MUESTRAS PROCEDENTES DE 18 PACIENTES QUE CUMPLEN LAS CONDICIONES ANTERIORES,LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO TIENEN UNA TRASLACION DIRECTA A LA SALUD PUBLICA Y LA PRACTICA ASISTENCIAL, MEJORANDO LAS ACTUALES HERRAMIENTAS DE VIGILANCIA Y CONTROL DE ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y DE RESISTENCIAS A ANTIBIOTICOS, BACTERIAS NO CULTIVADAS\LEGIONELOSIS\SÍFILIS\GONORREA\CLAMIDIA\BROTES\EPIDEMIOLOGÍA MOLECULAR\SECUENCIACIÓN GENÓMICA\ESTRUCTURA POBLACIONAL\ENRIQUECIMIENTO