EVOLUCION A CORTO Y LARGO PLAZO DE PATOGENOS: FILOGENOMICA, GENOMICA DE POBLACIO...
EVOLUCION A CORTO Y LARGO PLAZO DE PATOGENOS: FILOGENOMICA, GENOMICA DE POBLACIONES Y EPIDEMIOLOGIA GENOMICA
ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION SE BASA EN CUESTIONES Y DESARROLLOS DERIVADOS DE PROYECTOS PREVIOS EN LOS QUE HEMOS OBTENIDO Y ANALIZADO SECUENCIAS DE GENOMAS COMPLETOS DE DIFERENTES PATOGENOS, ESPECIALMENTE KLEBSIELLA PNEUMONIAE Y...
ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION SE BASA EN CUESTIONES Y DESARROLLOS DERIVADOS DE PROYECTOS PREVIOS EN LOS QUE HEMOS OBTENIDO Y ANALIZADO SECUENCIAS DE GENOMAS COMPLETOS DE DIFERENTES PATOGENOS, ESPECIALMENTE KLEBSIELLA PNEUMONIAE Y TREPONEMA PALLIDUM. EL POTENCIAL QUE OFRECEN ESTOS DATOS PARA MULTIPLES APLICACIONES (EPIDEMIOLOGIA, DIAGNOSTICO CLINICO, GENETICA Y GENOMICA DE POBLACIONES, FILOGENETICA MOLECULAR, FILOGENOMICA Y FILODINAMICA, ENTRE OTRAS) SE HA REFORZADO CON LA PANDEMIA DE COVID-19. NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION HA CONTRIBUIDO SIGNIFICATIVAMENTE A LA INVESTIGACION Y VIGILANCIA GENOMICA DEL SARS-COV-2 GRACIAS AL TRABAJO DESARROLLADO EN ESOS PROYECTOS. EN EL NUEVO PROYECTO NOS OCUPAREMOS DE TRES TEMAS DE GRAN INTERES EN EL CONTEXTO DE LA EVOLUCION Y EPIDEMIOLOGIA DE MICROORGANISMOS PATOGENOS. (1) ESTUDIAREMOS LAS RESISTENCIAS A ANTIMICROBIANOS, ANALIZANDO EL PAPEL DE LA TRANSFERENCIA GENICA HORIZONTAL Y LA RECOMBINACION EN LA DISEMINACION DE GENES Y FACTORES DE LOS QUE DEPENDEN, ESPECIALMENTE EN KLEBSIELLA PNEUMONIAE, PERO TAMBIEN EN OTRAS BACTERIAS QUE HABITAN OBLIGATORIA O FACULTATIVAMENTE EL CITOPLASMA DE CELULAS EUCARIOTAS. TAMBIEN ANALIZAREMOS LOS PROCESOS (MUTACION, CONJUGACION, TRANSFORMACION Y TRANSDUCCION) QUE ACTUAN EN ESA ESPECIE CONCRETA. (2) ESTUDIAREMOS LA EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DE T. PALLIDUM SUBSP. PALLIDUM, AGENTE CAUSAL DE LA SIFILIS, CON EL DESARROLLO Y PUESTA A PUNTO DE UN NUEVO ESQUEMA DE TIPADO MULTILOCUS (MLST) QUE SUPERA LAS LIMITACIONES Y DESVENTAJAS DE LOS SISTEMAS ACTUALES. ESTE NUEVO SISTEMA PERMITIRA UNA EVALUACION Y VIGILANCIA MUCHO MAS PRECISAS DE LAS RESISTENCIAS A DISTINTOS ANTIBIOTICOS QUE SE ESTAN EXTENDIENDO EN ESA ESPECIE. TAMBIEN INVESTIGAREMOS EL ORIGEN DE ESTA ENFERMEDAD EN NUESTRA ESPECIE, MEDIANTE EL ESTUDIO FILOGENOMICO DE GENOMAS COMPLETOS OBTENIDOS A PARTIR DE RESTOS ENTERRADOS EN CEMENTERIOS DEL NORTE DE EUROPA EN LA EDAD MEDIA Y LA EDAD MODERNA CON SINTOMAS DE PADECER SIFILIS U OTRAS TREPONEMATOSIS. FINALMENTE (3), APLICANDO LOS METODOS Y DESARROLLOS EMPLEADOS CON SARS-COV-2 CON OTRO VIRUS RESPIRATORIO, EL VIRUS RESPIRATORIO SINCITIAL (RSV), QUE TAMBIEN CAUSA INFECCIONES GRAVES, ESPECIALMENTE EN POBLACION INFANTIL Y EN POBLACION ADULTA SUSCEPTIBLE Y DEL QUE APENAS SE TIENE INFORMACION SOBRE SU EPIDEMIOLOGIA GENOMICA, PUES LA MAYOR PARTE DE LAS SECUENCIAS PUBLICAS SON DE DOS DE SUS GENES, DETERMINANTES DE LA DIVISION SEROLOGICA EN DOS SUBTIPOS, A Y B. ESTOS OBJETIVOS GENERALES COMBINAN TRABAJO DE COLABORACION CON NUMEROSOS GRUPOS TANTO DE MICROBIOLOGOS CLINICOS, EPIDEMIOLOGOS, COMO DE BIOLOGIA EVOLUTIVA DE PATOGENOS, TANTO NACIONALES COMO INTERNACIONALES, CONTRIBUYENDO A LA FORMACION DE INVESTIGADORES CON FUERTES FUNDAMENTOS EN BIOINFORMATICA, GENOMICA, BIOLOGIA EVOLUTIVA, EPIDEMIOLOGIA, Y BIOLOGIA DE MICROORGANISMOS PATOGENOS. ESTA FORMACION LES PERMITIRA ACCEDER A UN BUEN NUMERO DE OPORTUNIDADES LABORALES TANTO EN EL AMBITO ACADEMICO COMO EL SECTOR PRIVADO, INCLUYENDO EMPRESAS BIOSANITARIAS Y BIOTECNOLOGICAS. COMO PROYECTO DE INVESTIGACION, NUESTRAS ACTIVIDADES SERAN COMPLEMENTARIAS A LAS ACTUACIONES YA INICIADAS DE VIGILANCIA GENOMICA DE SARS-COV-2 Y DE BACTERIAS ASOCIADAS A ALIMENTOS O QUE DESARROLLAN RESISTENCIA A ANTIMICROBIANOS DESDE EL LABORATORIO DE SALUD PUBLICA DE LA DIRECCION GENERAL DE SALUD PUBLICA DE LA GENERALITAT VALENCIANA, CON QUIEN MANTENEMOS UNA COLABORACION MUY ESTRECHA, ACTIVA Y PRODUCTIVA. ESISTENCIA A ANTIMICROBIANOS\FILODINAMICA\TRANSDUCCION GENERAL\TRANSDUCCION LATERAL\GENOMAS ANTIGUOS\SECUENCIACION DE GENOMAS COMPLETOS\SELECCION NATURAL\RECOMBINACION\TRANSFERENCIA GENICA HORIZONTAL\PLASMIDOSver más
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