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PID2020-115853RR-C33

Financiado

ESTUDIOS GENOMICOS Y TRANSCRIPTOMICOS PARA IDENTIFICAR MARCADORES MOLECULARES Y...

ESTUDIOS GENOMICOS Y TRANSCRIPTOMICOS PARA IDENTIFICAR MARCADORES MOLECULARES Y VARIANTES GENICAS CLAVE EN EL CONTENIDO Y COMPOSICION FENOLICA DEL OLIVO LA SELECCION ASISTIDA POR MARCADORES PARA LA MEJORA GENETICA DEL OLIVO ES UN OBJETIVO PRINCIPAL PARA HACER QUE ESTE PROCESO SEA MAS EFICIENTE Y REQUIERA MENOS TIEMPO, NUESTRO GRUPO LIDERO UN CONSORCIO QUE RECIENTEMENTE HA PROPORCI... ver más

01/01/2020

UJA

194K€

Presupuesto del proyecto: 194K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE JAÉN No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 980

Ver Participantes

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01

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Participantes

UJA

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE JAÉN

Total investigadores 980

Presupuesto del proyecto 194K€

Descripción del proyecto LA SELECCION ASISTIDA POR MARCADORES PARA LA MEJORA GENETICA DEL OLIVO ES UN OBJETIVO PRINCIPAL PARA HACER QUE ESTE PROCESO SEA MAS EFICIENTE Y REQUIERA MENOS TIEMPO, NUESTRO GRUPO LIDERO UN CONSORCIO QUE RECIENTEMENTE HA PROPORCIONADO LA BASE DE DATOS MAS COMPLETA DEL GENOMA DEL OLIVO, OLIVETREEDB HTTPS://GENOMAOLIVAR,DIPUJAEN,ES/DB/INDEX,PHP, EN ESTE PROYECTO, ESTA BASE DE DATOS SE MEJORARA PARA INCLUIR TRES GENOMAS ENSAMBLADOS CORRESPONDIENTES A DOS VARIEDADES DE OLIVO CULTIVADAS RELEVANTES 'PICUAL' Y 'ARBEQUINA', ASI COMO UN VERDADERO GENOMA SALVAJE, SE OBTENDRA UN PANGENOMA DEL OLIVO Y SE SECUENCIARAN 30 NUEVAS ACCESIONES, LOS NUEVOS GENOMAS SECUENCIADOS UNIDOS A LOS 50 GENOMAS YA PRESENTES EN LA BASE DE DATOS OLIVETREEDB SE UTILIZARAN PARA EL ANALISIS GWAS DEL CONTENIDO Y COMPOSICION FENOLICA DEL ACEITE, ESTE ENFOQUE PRODUCIRA UNA SERIE DE MARCADORES GENETICOS MOLECULARES ASOCIADOS, LOS DATOS CUANTITATIVOS DE LOS COMPUESTOS FENOLICOS PRESENTES EN LOS FRUTOS Y EL ACEITE REQUERIDO PARA REALIZAR EL GWAS SERAN PROPORCIONADOS POR SP2, EL ANALISIS GWAS SE COMPLETARA CON DATOS TRANSCRIPTOMICOS DE DIFERENTES TEJIDOS, ORGANOS, ETAPAS DE DESARROLLO Y RESPUESTA AL ESTRES OBTENIDOS POR EXPERIMENTOS ANTERIORES DE RNASEQ, FINALMENTE, SE UTILIZARA EL ANALISIS DE UNA PROGENIE DE UN CRUCE GENETICO QUE PROPORCIONARA SP1 Y EL CONTENIDO Y COMPOSICION FENOLICA DETERMINADA POR SP2 PARA CONFIRMAR LOS MARCADORES OBTENIDOS EN EL GWAS, LOS GENES CANDIDATOS PREVIEAMENTE IDENTIFICADOS SERAN TAMBIEN ANALIZADOS PARA DETERMINAR LAS VARIACIONES SNP EN UNA AMPLIA REPRESENTACION DE LA COLECCION DE GERMOPLASMA MEDIANTE HRM, LO QUE PERMITIRA VALIDAR LA FUNCION DE ESTAS REGIONES GENOMICAS, LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO SERAN RAPIDAMENTE TRANSFERIDOS A LA MEJORA GENETICA DEL OLIVO POR PARTE DE LOS INVESTIGADORES DEL SP1, OLIVO\AOVE\GENOMICA\TRANSCRIPTOMICA\FENOLES

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