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AGL2010-16335

Financiado

ANALISIS DE LA EXPRESION GENICA DE LA RESISTENCIA AL PLUM POX VIRUS, PPV (SHARKA...

ANALISIS DE LA EXPRESION GENICA DE LA RESISTENCIA AL PLUM POX VIRUS, PPV (SHARKA), EN ALBARICOQUERO MEDIANTE LA SECUENCIACION MASIVA DEL TRANSCRIPTOMA (RNA-SEQ) EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES EL ANALISIS DE LA EXPRESION GENICA DE LA RESISTENCIA AL PLUM POX VIRUS, PPV ("SHARKA"), EN ALBARICOQUERO. PARA ELLO SE PROCEDERA A LA SECUENCIACION MASIVA DEL TRANSCRIPTOMA (RNA-SEQ) DE DOS GE... ver más

01/01/2010

CSIC

139K€

Presupuesto del proyecto: 139K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 139K€

Descripción del proyecto EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES EL ANALISIS DE LA EXPRESION GENICA DE LA RESISTENCIA AL PLUM POX VIRUS, PPV ("SHARKA"), EN ALBARICOQUERO. PARA ELLO SE PROCEDERA A LA SECUENCIACION MASIVA DEL TRANSCRIPTOMA (RNA-SEQ) DE DOS GENOTIPOS DE ALBARICOQUERO PROCEDENTES DE UN MISMO CRUZAMIENTO Y MUY SIMILARES AUNQUE SIENDO UNO RESISTENTE A PPV (¿ROJO PASION¿) Y OTRO SUSCEPTIBLE (¿Z506-7¿). UNA VEZ TENGAMOS LA SECUENCIACION COMPLETA DEL TRANSCRIPTOMA DE LOS DOS GENOTIPOS CONTROL E INOCULADO (EN TOTAL SECUENCIAREMOS 4 TRANSCRIPTOMAS) SE PROCEDERA A LA IDENTIFICACION DE LOS ESTS (EXPRESSED SEQUENCE TAGS) Y SNPS (SINGLE-NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS) OBTENIDOS. ESTOS RESULTADOS NOS PERMITIRAN GENERAR HERRAMIENTAS GENOMICAS EN LA ESPECIE ALBARICOQUERO QUE INCLUIREMOS EN LAS BASES DE DATOS DEL GDR (GENOME DATABASE FOR ROSACEAE) Y EL NCBI (NATIONAL CENTER FOR BIOTECHONOLOGY INFORMATION). ADEMAS, NOS PERMITIRA INDENTIFICAR ESTS Y SNPS QUE PUEDAN ESTAR CORRELACIONADOS CON LA RESPUESTA DIFERENCIAL (RESISTENCIA/SUSCEPTIBILIDAD) DEL ALBARICOQUERO FRENTE AL PPV. POR OTRO LADO, SE DESARROLLARAN CEBADORES ESPECIFICOS DERIVADOS DE ESTOS ESTS O SNPS CORRELACIONADOS CON LA RESPUESTA DIFERENCIAL DEL ALBARICOQUERO QUE PERMITAN COMPARAR LA EXPRESION GENICA DE GENOTIPOS RESISTENTES Y SUSCEPTIBLES DE ALBARICOQUERO CONTROLES E INOCULADOS CON AISLADOS DE PPV TIPO DIDERON Y MARCUS MEDIANTE RT-QPCR.

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