Descripción del proyecto
EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES EL ANALISIS DE LA EXPRESION GENICA DE LA RESISTENCIA AL PLUM POX VIRUS, PPV ("SHARKA"), EN ALBARICOQUERO. PARA ELLO SE PROCEDERA A LA SECUENCIACION MASIVA DEL TRANSCRIPTOMA (RNA-SEQ) DE DOS GENOTIPOS DE ALBARICOQUERO PROCEDENTES DE UN MISMO CRUZAMIENTO Y MUY SIMILARES AUNQUE SIENDO UNO RESISTENTE A PPV (¿ROJO PASION¿) Y OTRO SUSCEPTIBLE (¿Z506-7¿). UNA VEZ TENGAMOS LA SECUENCIACION COMPLETA DEL TRANSCRIPTOMA DE LOS DOS GENOTIPOS CONTROL E INOCULADO (EN TOTAL SECUENCIAREMOS 4 TRANSCRIPTOMAS) SE PROCEDERA A LA IDENTIFICACION DE LOS ESTS (EXPRESSED SEQUENCE TAGS) Y SNPS (SINGLE-NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS) OBTENIDOS. ESTOS RESULTADOS NOS PERMITIRAN GENERAR HERRAMIENTAS GENOMICAS EN LA ESPECIE ALBARICOQUERO QUE INCLUIREMOS EN LAS BASES DE DATOS DEL GDR (GENOME DATABASE FOR ROSACEAE) Y EL NCBI (NATIONAL CENTER FOR BIOTECHONOLOGY INFORMATION). ADEMAS, NOS PERMITIRA INDENTIFICAR ESTS Y SNPS QUE PUEDAN ESTAR CORRELACIONADOS CON LA RESPUESTA DIFERENCIAL (RESISTENCIA/SUSCEPTIBILIDAD) DEL ALBARICOQUERO FRENTE AL PPV. POR OTRO LADO, SE DESARROLLARAN CEBADORES ESPECIFICOS DERIVADOS DE ESTOS ESTS O SNPS CORRELACIONADOS CON LA RESPUESTA DIFERENCIAL DEL ALBARICOQUERO QUE PERMITAN COMPARAR LA EXPRESION GENICA DE GENOTIPOS RESISTENTES Y SUSCEPTIBLES DE ALBARICOQUERO CONTROLES E INOCULADOS CON AISLADOS DE PPV TIPO DIDERON Y MARCUS MEDIANTE RT-QPCR.