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AGL2010-22208-C02-02

Financiado

ESTUDIO DE CARACTERES RELACIONADOS CON EL METABOLISMO LIPIDICO Y LA CALIDAD EN P...

ESTUDIO DE CARACTERES RELACIONADOS CON EL METABOLISMO LIPIDICO Y LA CALIDAD EN PORCINO MEDIANTE EL ANALISIS INTEGRAL DE DATOS MASIVOS DE GENOTIPOS Y EXPRESION GENICA EL PROYECTO SOLICITADO (LIPEXQ) TIENE COMO FINALIDAD FUNDAMENTAL EL ESTUDIO DE LA BASE GENETICA DE CARACTERES VINCULADOS AL METABOLISMO LIPIDICO Y LA CALIDAD DE PRODUCTO EN LA ESPECIE PORCINA MEDIANTE EL ANALISIS DE DATOS MASIVOS... ver más

01/01/2010

UAB

85K€

Presupuesto del proyecto: 85K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1266

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UAB

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1266

Presupuesto del proyecto 85K€

Descripción del proyecto EL PROYECTO SOLICITADO (LIPEXQ) TIENE COMO FINALIDAD FUNDAMENTAL EL ESTUDIO DE LA BASE GENETICA DE CARACTERES VINCULADOS AL METABOLISMO LIPIDICO Y LA CALIDAD DE PRODUCTO EN LA ESPECIE PORCINA MEDIANTE EL ANALISIS DE DATOS MASIVOS DE GENOTIPADO Y EXPRESION GENICA, EL PROYECTO LIPEXQ REPRESENTA UNA CONTINUACION DE LOS PROYECTOS ANTERIORES AGL2002-04271-C03 Y AGL2007-66707-C02, EN EL TRANSCURSO DE LOS CUALES SE GENERO UNA POBLACION EXPERIMENTAL A PARTIR DE UNA LINEA COMERCIAL DE RAZA DUROC, SE IDENTIFICARON DIVERSOS QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL) UTILIZANDO UN PANEL DE MICROSATELITES, SE ESTUDIARON UNA BATERIA DE GENES CANDIDATOS, Y SE REALIZO UN PRIMER ESTUDIO DE EXPRESION GENICA DIFERENCIAL A PARTIR DE DATOS DE MICROARRAYS PARA UN SUBGRUPO DE ANIMALES,EN EL PRESENTE PROYECTO SE PRETENDE COMPLETAR EL CARTOGRAFIADO FINO DE LOS QTL PREVIAMENTE IDENTIFICADOS, PARA ELLO, SE PROPONE COMPLETAR EL GENOTIPADO DE 60,000 SNP EN TODA LA POBLACION DUROC, ELLO PERMITIRIA REALIZAR UN ANALISIS DE ASOCIACION A NIVEL GENOMICO PARA LAS CONCENTRACIONES SERICAS DE COLESTEROL, TRIGLICERIDOS, LDL Y HDL (FENOTIPOS DE GRAN INTERES BIOMEDICO), PORCENTAJE DE GRASA INTRAMUSCULAR, PERFIL DE ACIDOS GRASOS Y CONTENIDO EN COLESTEROL DE LA CARNE, Y MULTIPLES ATRIBUTOS SENSORIALES RELACIONADOS CON LA TEXTURA Y EL SABOR/AROMA DEL JAMON CURADO, EL ANALISIS DE LOS DATOS DE GENOTIPADO TAMBIEN PERMITIRA CONSTRUIR UN MAPA DE POLIMORFISMOS EN EL NUMERO DE COPIAS (CNP) E INVESTIGAR SU ASOCIACION CON LOS FENOTIPOS ANALIZADOS,ASIMISMO SE PRETENDE LLEVAR A CABO UN ESTUDIO, A NIVEL GENOMICO, DE LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA EN PORCINO CON EL FIN ULTIMO DE IDENTIFICAR RUTAS METABOLICAS RELACIONADAS CON LOS CARACTERES ESTUDIADOS Y DETECTAR GENES CON FUNCIONES REGULADORAS CLAVE, EN ESTE SENTIDO SE PROPONE AMPLIAR EL NUMERO DE MICROARRAYS: 1) REALIZAR DIVERSOS ESTUDIOS DE EXPRESION DIFERENCIAL Y DE ASOCIACION EXPRESION-FENOTIPO EN TRES TEJIDOS CENTRALES EN CUANTO AL METABOLISMO DE LIPIDOS (HIGADO, TEJIDO MUSCULAR Y TEJIDO ADIPOSO); 2) ABORDAR, A PARTIR DEL ANALISIS CONJUNTO DE LOS DATOS MASIVOS DE GENOTIPOS Y EXPRESION GENICA, LA BUSQUEDA DE QTL DE EXPRESION (EQTL) EN LOS TRES TEJIDOS ESTUDIADOS; 3) CARACTERIZAR LOS PATRONES DE EXPRESION EN DICHOS TEJIDOS; Y 4) LLEVAR A CABO UN ANALISIS DE LAS REDES GENETICAS REGULADORAS DE LOS CARACTERES ANALIZADOS, PARA LLEVAR A CABO ESTOS ESTUDIOS, SE PROPONE AMPLIAR EL NUMERO DE MICROARRAYS HASTA DISPONER DE UN TAMAÑO MUESTRAL QUE GARANTICE UNA POTENCIA RAZONABLE DE LOS ANALISIS PLANTEADOS, LA COMBINACION DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN LOS ESTUDIOS DE QTL Y EXPRESION GENICA RESULTARA ESENCIAL PARA AVANZAR EN LA BUSQUEDA DE LOS POLIMORFISMOS RESPONSABLES DE LA VARIACION DE LOS FENOTIPOS BAJO ESTUDIO, EN EL PRESENTE PROYECTO SE PROPONE ADEMAS REALIZAR LA ULTRASECUENCIACION MASIVA DE AQUELLOS QTL MAS SIGNIFICATIVOS Y DE LAS REGIONES REGULADORAS DE GENES PARTICULARMENTE ASOCIADOS AL METABOLISMO LIPIDICO Y LOCALIZADOS EN LOS CIS-EQTL, PARA LOS DEMAS QTL SE SEGUIRA UNA APROXIMACION BASADA EN EL ANALISIS DE GENES CANDIDATOS POSICIONALES Y FUNCIONALES,DESDE UN PUNTO DE VISTA MAS DIRECTAMENTE APLICADO A LA INDUSTRIA PORCINA, EL ANALISIS DE ASOCIACION A PARTIR DE GENOTIPADOS MASIVOS PERMITIRA EVALUAR LA EFICACIA DE LA SELECCION GENOMICA PARA MEJORAR LOS CARACTERES RELACIONADOS CON LA CALIDAD DE PRODUCTO EN LA POBLACION COMERCIAL DUROC, ASIMISMO SE ESTUDIARA SU EFICIENCIA ESPERADA A LARGO PLAZO MEDIANTE ESTUDIOS DE SIMULACION, CERDO\GENOTIPADO MASIVO\POLIMORFISMO\ANALISIS ASOCIACION

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