Descripción del proyecto
NUEVOS HALLAZGOS BIOQUIMICOS Y BIOFISICOS SUGIEREN QUE LA CADENA POLIPEPTIDICA NACIENTE (CN), RECIEN SINTETIZADA DURANTE EL PROCESO DE TRADUCCION, YA ES CAPAZ DE GENERAR UNA SEÑAL DE CARACTER REGULADOR: EL CODIGO NACIENTE, ESTAS SEÑALES PUEDEN ACTUAR DIRECTAMENTE EN EL RIBOSOMA O REQUERIR DE MAQUINARIA CELULAR ADICIONAL, Y TIENEN LA CAPACIDAD DE RALENTIZAR O INCLUSO DE INTERRUMPIR LA SINTESIS DE LA PROPIA CN, ASI COMO DE GUIARLA HACIA LA ADQUISICION DE SU ESTADO FUNCIONAL Y SU LOCALIZACION CELULAR FINALES, CURIOSAMENTE, ESTAS SEÑALES SE MODULAN MEDIANTE EL ESTADO CELULAR, ESPECIFICAMENTE POR LA PRESENCIA DE ANTIBIOTICOS O METABOLITOS, DE ESTA MANERA, EL PROCESO TRADUCCIONAL DE TRADUCCION SE CONVIERTE EN UN PUNTO DE CONTROL FUNDAMENTAL CAPAZ DE DETECTAR LAS NECESIDADES CELULARES ESPECIFICAS Y COMPLETAR O REPROGRAMAR LA EXPRESION GENICA, A PESAR DE LA IMPORTANCIA DE ESTE FENOMENO REGULADOR Y LA CERTEZA DE LA EXISTENCIA DEL CODIGO NACIENTE, SABEMOS MUY POCO ACERCA DE SU MECANISMO DE ACCION, BASADO EN RESULTADOS PREVIOS DE NUESTRO LABORATORIO GRUPO DE INVESTIGACION CENTRADOS EN ESTUDIOS ESTRUCTURALES MULTIDISCIPLINARES SOBRE EL PLEGAMIENTO CO-TRADUCCIONAL DE PROTEINAS, LA INVESTIGACION PROPUESTA EN ESTE PROYECTO PRETENDE: (I) DILUCIDAR LA ESTRUCTURA DE LOS COMPLEJOS RIBOSOMALES QUE CONTIENEN CADENAS POLIPEPTIDICAS NACIENTES QUE SEAN CAPACES DE "DETECTAR" LA PRESENCIA DE ANTIBIOTICOS O METABOLITOS, Y DE ESTA MANERA, REGULAR SU PROPIA EXPRESION (POR EJEMPLO, LAS SECUENCIAS TNAC/ERMCL QUE BLOQUEAN EL RIBOSOMA DURANTE LA TRADUCCION), (II) MEDIANTE RMN, CRIOMICROSCOPIA ELECTRONICA Y CRISTALOGRAFIA DE RAYOS X SE PRETENDE DESCRIBIR LA MANERA POR LA QUE EL CODIGO NACIENTE CONTRIBUYE A COORDINAR INTERACCIONES DINAMICAS O ESTABLES CON FACTORES DE PLEGAMIENTO Y DIRECCIONAMIENTO DE PROTEINAS (POR EJEMPLO SRP, TF Y SECA) Y CON RIBOSOMAS QUE TRADUCEN CN DESTINADAS A DIFERENTES COMPARTIMENTOS CELULARES (POR EJEMPLO, OMPA, LEP Y RPOB), LOS RESULTADOS PREVISTOS PERMITIRAN LA CARACTERIZACION, TANTO A NIVEL MACROSCOPICO COMO A NIVEL ATOMICO, LA ESTRUCTURA Y LA DINAMICA DE LOS ELEMENTOS CLAVE DEL RIBOSOMA, LA NC, LA MAQUINARIA DE PLEGAMIENTO Y SU DIRECCIONAMIENTO RELACIONADA CON LA FORMACION, DETECCION E INTERPRETACION DEL CODIGO NACIENTE, POR TANTO, LA REALIZACION DE ESTE PROGRAMA DE INVESTIGACION MULTIDISCIPLINAR DEBIERA PERMITIR ESTABLECER LOS DETERMINANTES MOLECULARES Y QUIMICOS DEL CODIGO NACIENTE ASI COMO SU PAPEL EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA Y EL PLEGAMIENTO Y DIRECCIONAMIENTO CO-TRADUCCIONAL DE PROTEINAS, ES DECIR, EL MANTENIMIENTO DE LA RED HOMEOSTATICA DE PROTEINAS CELULARES, DICHA DESCRIPCION DEL MANTENIMIENTO CO-TRADUCCIONAL DE LA HOMEOSTASIS DE PROTEINAS BAJO CONDICIONES NORMALES PROPORCIONARA LAS BASES PARA ENTENDER COMO ESTE PROCESO ACABA COLAPSANDO EN ENFERMEDADES HUMANAS ASOCIADAS CON EL PLEGAMIENTO ANOMALO DE PROTEINAS COMO LA DIABETES DE TIPO 2 Y LAS ENFERMEDADES DE PARKINSON, HUNTINGTON Y ALZHEIMER, EN ESTE SENTIDO, LA COMPRENSION DESDE EL PUNTO DE VISTA QUIMICO, DEL CODIGO NACIENTE Y, A SU VEZ, DE COMO AFECTA ESTE AL PLEGAMIENTO CO-TRADUCCIONAL Y AL DIRECCIONAMIENTO DE PROTEINAS, DEBIERA CONDUCIR A LARGO PLAZO A ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS PROMETEDORAS CONTRA ESTAS ENFERMEDADES DEGENERATIVAS ASOCIADAS A DESEQUILIBRIOS EN LA RED HOMEOSTATICA DE PROTEINAS, PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS CO-TRANSLACIONA\RIBOSOMAS\CRISTALOGRAFÍA DE RAYOS X\RMN\CRYO-EM\SECA\TRIGGER FACTOR