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BFU2008-02795

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ESTUDIO ESTRUCTURAL DE LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES EN LAS UBIQUITIN-LIGASAS ITC...

ESTUDIO ESTRUCTURAL DE LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES EN LAS UBIQUITIN-LIGASAS ITCH Y RSP5 POR RMN LAS ENZIMAS E3 DE LA FAMILIA NEDD4-UBIQUITIN LIGASA SON LAS ENCARGADAS DE SELECCIONAR Y MARCAR CON UBIQUITINAS, NUMEROSAS PROTEINAS PARA ALTERAR SU LOCALIZACION CELULAR O PARA ENVIARLAS AL PROTEOSOMA PARA SU DEGRADACION, ABUNDANTE... ver más

01/01/2008

FUNDACIO INSTITUT...

127K€

Presupuesto del proyecto: 127K€

Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA BIOMEDICA IRB BA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 23M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA BIOMEDICA IRB BA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 23M€

Presupuesto del proyecto 127K€

Descripción del proyecto LAS ENZIMAS E3 DE LA FAMILIA NEDD4-UBIQUITIN LIGASA SON LAS ENCARGADAS DE SELECCIONAR Y MARCAR CON UBIQUITINAS, NUMEROSAS PROTEINAS PARA ALTERAR SU LOCALIZACION CELULAR O PARA ENVIARLAS AL PROTEOSOMA PARA SU DEGRADACION, ABUNDANTES EVIDENCIAS EXPERIMENTALES SUGIEREN QUE ESTAS LIGASAS RESULTAN CLAVE EN EL DESARROLLO DE CANCERES Y PROCESOS DEGENERATIVOS PUES REGULAN FACTORES DE TRANSCRIPCION Y RECEPTORES DE FACTORES DE CRECIMIENTO, INCLUYEN UN REPRESENTANTE EN SACCHAROMYCES CEREVISIAE RSP5 Y NUEVE EN HUMANOS (Y SUS CORRESPONDIENTES ORTOLOGOS EN RATON), AUNQUE EXISTEN MUCHOS DATOS BIOQUIMICOS QUE DESCRIBEN LOS EFECTOS DE LAS E3 UBIQUITIN LIGASAS, AUN NO SE CONOCEN LOS CAMBIOS ESTRUCTURALES QUE IMPLICAN LA ACTIVACION DE LA PROTEINA, O LA TRANSFERENCIA DE LA CADENA DE UBIQUITINAS DESDE EL DOMINIO CATALITICO HASTA EL SUSTRATO, DE FORMA INDIRECTA Y PARCIAL Y SOLO PARA DOS LIGASAS - ITCH Y SMURF2- SE HA PODIDO AVERIGUAR QUE DICHOS PROCESOS INCLUYEN FORMACION Y RUPTURA DE CONTACTOS INTER- E INTRA-MOLECULARES, SIN EMBARGO, LOS MECANISMOS DESCRITOS SON DIFERENTES, LO QUE SUGIERE QUE PESE A LA SEMEJANZA EN LA COMPOSICION EN DOMINIOS DE ESTAS PROTEINAS, HAN DESARROLLADO AL MENOS DOS MECANISMOS DE ACCION, EL PRESENTE PROYECTO TRATA DE DESCRIBIR CON DETALLE ATOMICO LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES QUE OCURREN EN LAS ENZIMAS RSP5 (DE LEVADURA) E ITCH (RATON) CUANDO SE ACTIVAN, EMPLEANDO RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR (RMN), LA RMN ES UNA TECNICA QUE PERMITE DETERMINAR NO SOLO ESTRUCTURAS DE PROTEINAS EN SOLUCION, SINO QUE PUEDE APORTAR UNA VISION DETALLADA DE LOS PROCESOS DINAMICOS DEBIDOS A FLEXIBILIDAD Y/O A REORDENAMIENTOS ESTRUCTURALES, PLANEAMOS POR TANTO DIVIDIR LAS PROTEINAS RSP5 E ITCH EN SUS DOMINIOS CONSTITUTIVOS Y EN COMBINACIONES DE ALGUNOS DE ELLOS Y ESTUDIAR SUS CONTACTOS, COMO EXISTE POCA INFORMACION ESTRUCTURAL REFERENTE A ESTAS DOS PROTEINAS, PLANTEAMOS RESOLVER LAS ESTRUCTURAS DE LOS DOMINIOS QUE LAS CONSTITUYEN, PARA DETERMINAR LOS CONTACTOS ENTRE DOMINIOS SEGUIREMOS LOS CAMBIOS EN LOS DESPLAZAMENTOS QUIMICOS DE LOS RESIDUOS QUE PARTICIPEN EN LA INTERACCION SI ESTA ES DEBIL (EN EL RANGO MILIMOLAR) O DETERMINANDO ESTRUCTURAS SI FORMAN COMPLEJOS ESTABLES (EN EL RANGO MICROMOLAR), LOS REORDENAMIENTOS DE LOS SUBDOMINIOS CATALITICOS SE ESTUDIARAN MEDIANTE EXPERIMENTOS DE RELAJACION TRANSVERSAL Y LOGITUDINAL DEL ESQUELETO Y MEDIANTE LA MEDIDA DE ACOPLAMIENTOS DIPOLARES RESIDUALES, LOS RESULTADOS OBTENIDOS PARA LAS DOS LIGASAS NOS PERMITIRAN TRAZAR A NIVEL ESTRUCTURAL LOS CAMINOS EVOLUTIVOS DE ESTA FAMILIA DE ENZIMAS, E3 ubiquitin ligasas\Itch\Rsp5\WW\C2\Hect\RMN\relajacion\estructura

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