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PID2021-123918OB-I00

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ESTUDIO DE LA HETEROGENIDAD EN LA ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL MEDIANTE EL...

ESTUDIO DE LA HETEROGENIDAD EN LA ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL MEDIANTE EL USO DE ANALISIS DE CELULA UNICA LA ENFERMEDAD DE CROHN (EC) Y LA COLITIS ULCEROSA (CU) SON ENFERMEDADES INFLAMATORIAS CRONICAS DEL TRACTO GASTROINTESTINAL QUE PUEDEN PRESENTAR UN COMPORTAMIENTO VARIABLE Y EN MUCHAS OCASIONES IMPREDECIBLE. CARACTERISTICAS COMO LA... ver más

01/01/2021

CONSORCI INSTITUT...

339K€

Presupuesto del proyecto: 339K€

Líder del proyecto

CONSORCI INSTITUT D INVESTIGACIONS BIOMEDIQUE... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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Líder del proyecto

CONSORCI INSTITUT D INVESTIGACIONS BIOMEDIQUE... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 339K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LA ENFERMEDAD DE CROHN (EC) Y LA COLITIS ULCEROSA (CU) SON ENFERMEDADES INFLAMATORIAS CRONICAS DEL TRACTO GASTROINTESTINAL QUE PUEDEN PRESENTAR UN COMPORTAMIENTO VARIABLE Y EN MUCHAS OCASIONES IMPREDECIBLE. CARACTERISTICAS COMO LA LOCALIZACION Y EXTENSION (COLONICA, PAN-COLONICA, ILEAL, ILEO-COLONIC, DE TRACTO ALTO, ETC), DIFERENCIAS EN EL TIPO DE LESIONES (SUPERFICIAL EN LA COLITIS ULCEROSA E INTRAMURAL EN LA ENFERMEDAD DE CROHN), O EN EL FENOTIPO DE LA ENFERMEDAD (PURAMENTE INFLAMATORIO, ESTENOTICO O FISTULIZANTE) DISTINGUEN A ESTE GRUPO DE ENFERMEDADES ALTAMENTE HETEROGENEAS. ADEMAS, LA RESPUESTA A LOS FARMACOS DISPONIBLES ACTUALMENTE ES ALTAMENTE VARIABLE E IMPREDECIBLE, LO QUE HACE QUE LA ELECCION DEL TRATAMIENTO MAS ADECUADO PARA CADA PACIENTE SIGA UNA ESTRATEGIA DE PRUEBA Y ERROR. A PESAR DE LOS ESFUERZOS DE LA COMUNIDAD CIENTIFICA, INCLUYENDO NUESTROS PROPIOS INTENTOS, EL USO DEL ANALISIS TRANSCRIPCIONAL DE BIOPSIAS ENTERAS HA DEMOSTRADO SER INSUFICIENTE PARA DIFERENCIAR ENTRE DIFERENTES TIPOS DE ENFERMEDAD O PREDECIR EL COMPORTAMIENTO CLINICAMENTE DE CADA PACIENTE. EL DESARROLLO DE LAS TECNICAS DE SECUENCIACION DE ARN DE CELULA UNICA (SINGLE-CELL) Y DEL ANALISIS ESPACIO-TRANSCRIPCIONAL DE CELULA UNICA PROPORCIONA HERRAMIENTAS VERSATILES Y ROBUSTAS QUE DE MANERA SIMULTANEA NOS PERMITEN NO SOLO DESCRIBIR LA COMPOSICION CELULAR Y LA FIRMA MOLECULAR ESPECIFICA DE CADA CELULA, SINO RESOLVER LAS INTERACCIONES CELULA-CELULA A NIVEL ESPACIAL EN PEQUEÑAS MUESTRAS DE TEJIDO. EN BASE A TODO ESTO, PROPONEMOS QUE LA CAPACIDAD DE ESTAS TECNOLOGIAS PARA CARACTERIZAR CELULAS A NIVEL INDIVIDUAL, DESCRIBIR SUS FIRMAS TRANSCRIPCIONALES Y ESTUDIAR SUS INTERACCIONES EN LAS LESIONES DE PACIENTES CON EC Y CU SERAN CLAVE A LA HORA DE PREDECIR EL COMPORTAMIENTO DE LA ENFER-MEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL.ASI, LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO SON APLICAR LAS TECNICAS DE SECUENCIACION DE SINGLE-CELL ARN Y DE IMAGEN DE SINGLE-CELL PARA IDENTIFICAR LAS CARACTERISTICAS MOLECULARES Y CELULARES QUE NOS PERMITAN, DE UNA MANERA ROBUSTA, CLASIFICAR A LOS PACIENTES EN GRUPOS CLINICAMENTE RELEVANTES. FINALMENTE, MEDIREMOS LA HABILIDAD DE LOS MARCADORES CELULARES PARA PREDECIR EL COMPORTAMIENTO DE LA ENFERMEDAD (PROGNOSIS) Y LA RESPUESTA AL TRATAMIENTO. PARA CONSEGUIR ESTOS OBJETIVOS, BASAMOS NUESTRA PROPUESTA EN DATOS DE SECUENCIACION DE SINGLE-CELL ARN QUE YA HAN SIDO RECOGIDOS EN NUESTRO LABORATORIO Y QUE NOS PERMITIRAN ESTABLECER LAS CARACTERISTICAS SUBYACENTES AL DESARROLLO DIFERENCIAL DE LA CU Y LA EC COLONICA. SE UTILIZARAN TANTO TECNICAS FUNCIONALES (USANDO CELULAS DERIVADAS DE PACIENTES) COMO ESPACIALES (UTILIZANDO HIGH-PLEX, DETECCION DE ARN MEDIANTE HIBRIDACION IN SITU) PARA ANALIZAR Y COMPRENDER LAS RUTAS QUE DIFERENCIAN ESTAS DOS ENFERMEDADES. POR OTRO LADO, SE GENERARA UNA COHORTE MAS AMPLIA DE DATOS DE SECUENCIACION DE SINGLE-CELL ARN QUE NOS PERMITIRA IDENTIFICAR MODULOS MOLECULARES Y CELULARES QUE PERMITAN CLASIFICAR A LOS PACIENTES EN GRUPOS CLINICAMENTE RELEVANTES MAS ALLA DE LA CLASIFICACION ACTUAL DE EC Y CU. TANTO LA TECNICA DE SECUENCIACION DE SINGLE-CELL ARN COMO LA HIBRIDACION DE ARN IN SITU POR FLUORESCENCIA (MFISH) SERAN UTILIZADAS PARA IDENTIFICAR Y VALIDAR SUBTIPOS DE PACIENTES. EN DEFINITIVA, NUESTROS RESULTADOS PERMITIRAN EL DESARROLLO DE ENFOQUES MAS PERSONALIZADOS PARA LA ATENCION DE PACIENTES CON ENFERMEDADES INFLAMATORIAS INTESTINALES, UNA NECESIDAD QUE CONTINUA SIN RESPUESTA A DIA DE HOY. NFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL\MODELOS DE PREDICCION\HIBRIDACION IN SITU\SCRNA-SEQ\COLITIS ULCEROSA\ENFERMEDAD DE CROHN

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