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RTI2018-096946-B-I00

Financiado
CARACTERIZACION DE LA BASE CELULAR DE LA ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL MEDI...
CARACTERIZACION DE LA BASE CELULAR DE LA ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL MEDIANTE SECUENCIACION DE CELULAS INDIVIDUALES LA ENFERMEDAD DE CROHN (EC) Y LA COLITIS ULCEROSA (CU) SON ENFERMEDADES INFLAMATORIAS INTESTINALES (EII) CRONICAS CON UN CURSO RECIDIVANTE QUE PUEDE DESENCADENAR EN DAÑO Y PERDIDA DE FUNCION INTESTINAL, TANTO LA EC COMO LA CU SON... LA ENFERMEDAD DE CROHN (EC) Y LA COLITIS ULCEROSA (CU) SON ENFERMEDADES INFLAMATORIAS INTESTINALES (EII) CRONICAS CON UN CURSO RECIDIVANTE QUE PUEDE DESENCADENAR EN DAÑO Y PERDIDA DE FUNCION INTESTINAL, TANTO LA EC COMO LA CU SON MUY HETEROGENEAS EN SU FENOTIPO, COMPLICACIONES Y RESPUESTA A TERAPIA, Y LOS CRITERIOS CLINICOS, ENDOSCOPICOS E HISTOLOGICOS ACTUALES NO PERMITEN PREDECIR ESTA VARIABILIDAD ENTRE PACIENTES, ASI, LA CLASIFICACION ACTUAL DE ESTAS ENFERMEDADES NO REFLEJA LA GRAN DIVERSIDAD EN LOS MECANISMOS FISIOPATOLOGICOS DE LA EII, ESTA LIMITACION IMPIDE EL DESARROLLO DE APROXIMACIONES TERAPEUTICAS PERSONALIZADAS, LA MAYOR PARTE DE NUESTRO CONOCIMIENTO ACTUAL SE BASA EN EL ANALISIS DE TIPOS CELULARES PRE-DEFINIDOS MEDIANTE EL USO DE TECNICAS MAYORITARIAMENTE BASADAS EN ANTICUERPOS QUE PROVEEN UN CONOCIMIENTO MUY LIMITADO DE COMO CADA TIPO CELULAR CONTRIBUYE Y ES REGULADO POR LA ENFERMEDAD, POR OTRO LADO, EL ANALISIS “OMICO”, QUE NUESTRO GRUPO HA USADO EN NUMEROSAS OCASIONES PARA EL ESTUDIO DE LA EII, SE APLICA GENERALMENTE A BIOPSIAS O MEZCLAS HETEROGENEAS DE CELULAS, LO QUE NO PERMITE DISTINGUIR LA CONTRIBUCION DE CADA TIPO CELULAR, ASI, HIPOTETIZAMOS QUE UNA APROXIMACION EXPERIMENTAL QUE OFREZCA INFORMACION A NIVEL CELULAR (“SINGLE CELL”) EN INTESTINO HUMANO PODRIA AYUDAR A CLASIFICAR CORRECTAMENTE A LOS PACIENTES, IDENTIFICAR PREDICTORES DE SU PROGRESION, DE SU RESPUESTA A DIFERENTES FARMACOS ASI COMO IDENTIFICAR NUEVAS DIANAS CELULA-ESPECIFICAS PARA EL TRATAMIENTO DE LA EII, PARA ABORDAR NUESTRA HIPOTESIS USAREMOS TECNOLOGIA Y HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES RECIENTEMENTE DESARROLLADAS QUE PERMITE LA AMPLIFICACION, SECUENCIACION Y ANALISIS DEL ARN DE UNA UNICA CELULA EN MEZCLAS COMPLEJAS, NUESTRO OBJETIVO GENERAL SERA LA CARACTERIZACION DEL PERFIL TRANSCRIPCIONAL DE CELULAS INDIVIDUALES AGRUPADAS EN SUBTIPOS EN LA MUCOSA INTESTINAL HUMANA DE PACIENTES Y CONTROLES, PERMITIENDONOS ESTABLECER UNA CLASIFICACION MOLECULAR DE LA ENFERMEDAD Y UNA EVENTUAL APROXIMACION PERSONALIZADA A SU TRATAMIENTO, EN CONCRETO DIVIDIREMOS NUESTROS ESFUERZOS EN MATERIALIZAR DOS OBJETIVOS CONCRETOS:1, OBTENER UN MAPA PRECISO DE TIPOS PRESENTES EN LA MUCOSA INTESTINAL HUMANA COMPARANDO TEJIDO SANO CON INFLAMADO (PROCEDENTE DE PACIENTES CON EII), ESTE PRIMER ANALISIS INCLUIRA TODAS LAS CELULAS PRESENTES EN LA LAMINA USANDO UNA APROXIMACION DIRIGIDA A SECUENCIAS VARIOS MILES DE CELULAS POR PACIENTE,2, IDENTIFICAR TODOS LOS TIPOS DE CELULAS T Y SUS SIGNATURAS ESPECIFICAS EN EL INTESTINO HUMANO VALORANDO LOS POSIBLES CAMBIOS ASOCIADOS A DIVERSOS ESTADOS DE LA EII, BASANDONOS EN DATOS DISPONIBLES EN NUESTRO GRUPO, ESPECULAMOS QUE CIERTAS POBLACIONES LINFOCITARIAS PODRIAN JUGAR UN PAPEL CRUCIAL EN EL MANTENIMIENTO DE LA ENFERMEDAD A LO LARGO DEL TIEMPO,ASI, PROPONEMOS QUE EL USO DE SECUENCIACION DEL ARN DE CELULAS INDIVIDUALES PERMITIRA DESCIFRAR EL COMPLEJO MAPA DE TIPOS CELULARES QUE COMPONEN LA MUCOSA INTESTINAL, LOS MARCADORES IDENTIFICADOS EN NUESTRO ESTUDIO SERAN VALIDADOS Y LOCALIZADOS EN TEJIDO, ASIGNAREMOS SIGNATURAS TRANSCRIPCIONALES ESPECIFICAS PARA CADA POBLACION CELULAR, QUE SERAN ESTUDIADAS EN DIFERENTES ESTADIOS DE LA EII, PARA ELLO SE EXPLORARAN DATOS DE SECUENCIACION DE ARN DE BIOPSIA COMPLETA DE COHORTES RETROSPECTIVAS DISPONIBLES EN NUESTRO LABORATORIO, LA INFORMACION OBTENIDA SE ESPERA NOS PERMITA PROFUNDIZAR EN NUESTRO CONOCIMIENTO FUNDAMENTAL Y PERSONALIZAR EL MANEJO CLINICO DE LOS PACIENTES CON EII, ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL\SECUENCIACIÓN RNA\DECONVOLUCIÓN DATOS\CÉLULA T ver más
01/01/2018
CONSORCI INSTITUT...
242K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 242K€
Líder del proyecto
CONSORCI INSTITUT D INVESTIGACIONS BIOMEDIQUE... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos
Perfil tecnológico TRL 4-5 50K